English site

微生物 : Planctomyces brasiliensis

微生物株情報

NBRC番号 103401
学名 Planctomyces brasiliensis
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IAM 15109 <- DSM 5305 <- IFAM 1448
他保存機関番号 ATCC 49424=DSM 5305=IAM 15109=IFAM 1448=JCM 21570
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferasePlabr_0457
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IPlabr_3420
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductasePlabr_1007
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphatasePlabr_4683
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminasePlabr_3301
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferasePlabr_3300
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthasePlabr_3302
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylasePlabr_1322
Hydroxyectoine biosynthesis(NFUNC_0057)
必須A
ECTD
(NRULE_0189)
Ectoine hydroxylasePlabr_3303
任意 
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminasePlabr_3301
 
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferasePlabr_3300
 
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthasePlabr_3302
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthasePlabr_4695
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Plabr_4695
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDPlabr_2819
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthasePlabr_0755
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthasePlabr_2632
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFPlabr_2734

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA47863
ローカスタグPLABR
INSDC entriesCP002546
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 6,006,602
遺伝子数 4,750
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz		 FASTA
gz		 FASTA
gz		 TSV
uncompressed
1.8 MB 1.5 MB 1.1 MB 361.6 KB