English site

微生物 : Acidimicrobium ferrooxidans

微生物株情報

NBRC番号 103882
学名 Acidimicrobium ferrooxidans
別名(シノニム) 該当データなし
由来 DSM 10331 <- P.R. Norris, ICP
他保存機関番号 DSM 10331=JCM 15462
他株番号 ICP
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAfer_0437
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseAfer_1640
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseAfer_2009
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseAfer_1778
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSAfer_1221
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTAfer_1220

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA29525
ローカスタグAFER
INSDC entriesCP001631
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,158,157
遺伝子数 1,964
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler, Arachne
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Acidimicrobium ferrooxidans type strain (ICP). (Stand Genomic Sci. 2009) PMID: 21304635

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
632.1 KB 568.8 KB 399.8 KB 152.6 KB