English site

微生物 : Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris

微生物株情報

NBRC番号 104121
学名 Desulfovibrio vulgaris subsp. vulgaris
別名(シノニム) Desulfovibrio vulgaris
由来 DSM 644 <- G. Gottschalk <- NCIB 8303 <- M.E. Adams & K.R. Butlin, Hildenborough
他保存機関番号 ATCC 29579=CCUG 34227=CIP 107040=DSM 644=LMG 7563=NCAIM B.01489=NCIB 8303=NCIMB 8303=VKM B-1760
他株番号 Hildenborough
参考文献
5342518
Classification of Desulfovibrio species, the nonsporulating sulfate-reducing bacteria. (Bacteriol Rev. 1966)

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseDVU_0955
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseDVU_2548
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseDVU_1660
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseDVU_2145
B
CAT4
(NRULE_0108)
Chloramphenicol acetyltransferaseDVU_1992
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinDVU_0179 DVU_0771
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinDVU_2667 DVU_0177
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRDVU_2891
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinDVU_0177 DVU_2667
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinDVU_0181
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinDVU_0180
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainDVUA0012
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainDVUA0011
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseDVUA0015

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA51
ローカスタグDVU
INSDC entriesAE017285
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 3,773,159
遺伝子数 3,531
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • The genome sequence of the anaerobic, sulfate-reducing bacterium Desulfovibrio vulgaris Hildenborough. (Nat Biotechnol. 2004) PMID: 15077118

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
1.1 MB 986.4 KB 693.5 KB 273.6 KB