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微生物 : Acetobacter pasteurianus

微生物株情報

NBRC番号 105190
学名 Acetobacter pasteurianus
別名(シノニム) Acetobacter pasteurianus subsp. ascendens
Acetobacter pasteurianus subsp. paradoxus
Acetobacter pasteurianus subsp. pasteurianus
由来 Yamaguchi Univ. (Y. Azuma, IFO 3283-32) <- NBRC 3283 <- IFO 3283 <- IFO (K. Kondo, 46)
他保存機関番号
他株番号 IFO 3283-32
参考文献
19638423
Whole-genome analyses reveal genetic instability of Acetobacter pasteurianus. (Nucleic Acids Res. 2009)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseAPA32_24990
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseAPA32_12220
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IAPA32_12230
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須A
ARSB1
(NRULE_0015)
Arsenical pump membrane proteinAPA32_42350
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseAPA32_42360 APA32_42450
任意 
ARSH
(NRULE_0021)
ArsH proteinAPA32_42340
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseAPA32_11380
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAPA32_01350
H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRAPA32_13960
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinAPA32_01350
Pyrroloquinoline quinone biosynthesis(NFUNC_0020)
必須A
PQQC
(NRULE_0092)
Pyrroloquinoline-quinone synthaseAPA32_21270
任意 
PQQA
(NRULE_0090)
Coenzyme PQQ synthesis protein AAPA32_21250
 
PQQB
(NRULE_0091)
Coenzyme PQQ synthesis protein BAPA32_21260
 
PQQE
(NRULE_0094)
Coenzyme PQQ synthesis protein EAPA32_21290
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseAPA32_20790
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseAPA32_20800
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeAPA32_20830

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJDA31139
ローカスタグAPA32
INSDC entriesAP011156
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数7
サイズ(bp) 3,337,040
遺伝子数 3,046
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
1004.7 KB 933.1 KB 602.0 KB 232.2 KB