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微生物 : Rothia dentocariosa

微生物株情報

NBRC番号 12531
学名 Rothia dentocariosa
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 12531 <- KCC A-0067 <- NCDC W-858 <- G.D. Roth, XD-1A
他保存機関番号 ATCC 17931=CCUG 35437=CIP 81.83=DSM 43762=DSM 46363=JCM 3067=NCDC W-858=NCTC 10917=NRRL B-8017
他株番号 KCC A-0067=XD-1A
参考文献
13465125
Proteolytic organisms of the carious lesion. (Oral Surg Oral Med Oral Pathol. 1957)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0733_10256
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHMPREF0733_10945
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHMPREF0733_11818
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseHMPREF0733_11108
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0733_11957
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF0733_10188
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0733_10331
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0733_10331
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterHMPREF0733_11875
E
OPUE
(NRULE_0222)
Sodium/proline symporterHMPREF0733_10417
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSHMPREF0733_11099
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTHMPREF0733_11098

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA48447
ローカスタグHMPREF0733
INSDC entriesCP002280
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,506,025
遺伝子数 2,217
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.3.10192009
冗長度
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
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763.0 KB 665.6 KB 458.2 KB 186.5 KB