English site

微生物 : Lactobacillus fructivorans

微生物株情報

NBRC番号 13954
学名 Lactobacillus fructivorans
別名(シノニム) Lactobacillus heterohiochii
Lactobacillus trichodes
由来 IFO 13954 <- ATCC 8288 <- R.H. Vaughn <- C. Pederson
他保存機関番号 ATCC 8288=CECT 4785=DSM 20203=KCTC 3543=NRRL B-3796
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

Download
タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseLACFR_10_00170
Histamine biosynthesis(NFUNC_0078)
必須A
HDCA
(NRULE_0244)
Histidine decarboxylase proenzymeLACFR_08_01950
任意 
HDCP
(NRULE_0246)
Histidine/histamine antiporterLACFR_08_02150
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeLACFR_11_00160
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLACFR_10_00800 LACFR_11_00460
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinLACFR_10_00800 LACFR_11_00460

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA61453
ローカスタグLACFR
INSDC entriesAEQY01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数11
サイズ(bp) 1,371,284
遺伝子数 0
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度43.3x
シーケンス方法
  • 454
参考文献
  • Genome sequence of Lactobacillus fructivorans KCTC 3543. (J Bacteriol. 2012) PMID: 22461550

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
uncompressed
416.6 KB 405.0 KB 265.9 KB 110.5 KB