微生物 : Atopobium rimae
微生物株情報
NBRC番号 | 15546![]() |
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学名 | Atopobium rimae |
別名(シノニム) | Lactobacillus rimae |
由来 | IFO 15546 <- NCFB 2896 <- ATCC 49626 <- VPI (D140H-11A) |
他保存機関番号 | ATCC 49626=CCUG 31168=DSM 7090=JCM 10299=LMG 11476=NCFB 2896 |
他株番号 | VPI D140H-11A |
参考文献 |
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推定保有機能 >>詳細
ゲノム配列情報
BioProject ID | PRJNA30999 |
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ローカスタグ | HMPREF0086 |
INSDC entries | ACFE01000000 |
ステータス | WGS |
解析状況 | |
コンティグ数 | 9 |
サイズ(bp) | 1,626,291 |
遺伝子数 | 1,548 |
フィニッシングゴール | |
アセンブル方法 | |
冗長度 | 10-20x |
シーケンス方法 |
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参考文献
- Lactobacillus uli sp. nov. and Lactobacillus rimae sp. nov. from the human gingival crevice and emended descriptions of lactobacillus minutus and Streptococcus parvulus. (Int J Syst Bacteriol. 1991) PMID: 1854640
データダウンロード
ゲノム塩基配列 | CDS塩基配列 | CDSアミノ酸変換配列 | 遺伝子/ORF リスト |
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TSV uncompressed |
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