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微生物 : Propionibacterium avidum

微生物株情報

NBRC番号 15671
学名 Propionibacterium avidum
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15671 <- GIFU 7985
他保存機関番号 ATCC 25577=CCUG 36754=CIP 103261=DSM 4901=GIFU 7985=NCTC 11864
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF9153_0982
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseHMPREF9153_1215 HMPREF9153_0598
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component IHMPREF9153_1826
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF9153_0905
Human milk oligosaccharides metabolism(NFUNC_0083)
必須A
LNBP
(NRULE_0112)
1,3-beta-galactosyl-N-acetylhexosamine phosphorylaseHMPREF9153_1931
任意 
GALE
(NRULE_0111)
UDP-glucose 4-epimeraseHMPREF9153_1114
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF9153_0163
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF9153_1444
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseHMPREF9153_1257
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseHMPREF9153_1256
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeHMPREF9153_1838
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseHMPREF9153_1840
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseHMPREF9153_2002
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseHMPREF9153_2001
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSHMPREF9153_1995
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTHMPREF9153_1994

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA64741
ローカスタグHMPREF9153
INSDC entriesAGBA00000000
ステータスWGS
解析状況Standard Draft
コンティグ数24
サイズ(bp) 2,533,496
遺伝子数 2,376
フィニッシングゴールStandard Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 2.3-04192010
冗長度28.83x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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FASTA
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FASTA
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