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微生物 : Lactobacillus hilgardii

微生物株情報

NBRC番号 15886
学名 Lactobacillus hilgardii
別名（シノニム） 該当データなし
由来 IFO 15886 <- JCM 1155 <- ATCC 8290 <- R.H. Vaughn, 9
他保存機関番号 ATCC 8290=DSM 20176=JCM 1155=NCIMB 8040
他株番号 9=NCDO 264
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0519_0106
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF0519_1744
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeHMPREF0519_0955
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0519_1276
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0519_1276
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0519_0751
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinHMPREF0519_0750
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinHMPREF0519_0749

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA31489
ローカスタグ
INSDC entriesACGP01000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数233
サイズ(bp) 2,619,588
遺伝子数 2,791
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度11x
シーケンス方法
  • 454
  • ABI
  • Illumina/Solexa
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz		 FASTA
gz		 TSV
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