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微生物 : Lactobacillus plantarum subsp. plantarum

微生物株情報

NBRC番号 15891
学名 Lactobacillus plantarum subsp. plantarum
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15891 <- JCM 1149 <- ATCC 14917 <- P.A. Hansen, Lp 39 <- Roy. Techn. Coll., Copenhagen <- S. Orla-Jensen, No. 39
他保存機関番号 ATCC 14917=DSM 20174=IAM 12477=JCM 1149=NRIC 1067
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseHMPREF0531_12314
Aromatic azo compounds degradation(NFUNC_0073)
必須A
AZOR
(NRULE_0236)
FMN-dependent NADH-azoreductaseHMPREF0531_11156 HMPREF0531_12298
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseHMPREF0531_12672
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseHMPREF0531_10803
GABA biosynthesis(NFUNC_0066)
必須A
GAD
(NRULE_0231)
Glutamate decarboxylaseHMPREF0531_12685
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須B
RLMA
(NRULE_0165)
23S rRNA (guanine-N(1))-methyltransferaseHMPREF0531_12236
Malolactic fermentation(NFUNC_0070)
必須A
MLE
(NRULE_0233)
Malolactic enzymeHMPREF0531_10007
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinHMPREF0531_12431 HMPREF0531_10254
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0531_10768 HMPREF0531_13081
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0531_10768 HMPREF0531_13081
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseHMPREF0531_12294
Tannin degradation(NFUNC_0082)
必須A
TASE
(NRULE_0255)
TannaseHMPREF0531_12033
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須A
OPUAC
(NRULE_0213)
Osmoprotectant ABC transporter substrate-binding proteinHMPREF0531_10642
OPUAB
(NRULE_0214)
Osmoprotectant ABC transporter permease proteinHMPREF0531_10641 HMPREF0531_10643
OPUAA
(NRULE_0215)
Osmoprotectant ABC transporter ATP-binding proteinHMPREF0531_10640

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA31515
ローカスタグ
INSDC entriesACGZ02000000
ステータスWGS
解析状況Improved High-Quality Draft
コンティグ数36
サイズ(bp) 3,198,761
遺伝子数 3,154
フィニッシングゴールImproved High-Quality Draft
アセンブル方法Newbler Assembler v. 1.1.03.24_64
冗長度36x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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