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微生物 : Flexibacter litoralis

微生物株情報

NBRC番号 15988
学名 Flexibacter litoralis
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15988 <- DSM 6794 <- H. Reichenbach, Fx l1 <- ATCC 23117 <- R.A. Lewin, SIO-4
他保存機関番号 ATCC 23117=CIP 106402=DSM 6794=LMG 3992=NCIMB 1366
他株番号
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseFleli_1522 Fleli_0871
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseFleli_2034
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DFleli_2929
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須B
PHAE
(NRULE_0012)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaE subunitFleli_1812
PHAC2
(NRULE_0373)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaC subunitFleli_1811
任意 
PHAB
(NRULE_0011)
Acetoacetyl-CoA reductaseFleli_3186
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFleli_1686
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFleli_1686
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseFleli_3517
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseFleli_3152
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseFleli_2278
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseFleli_3518
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DFleli_2929

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA51775
ローカスタグFleli
INSDC entriesCP003345
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数1
サイズ(bp) 4,919,337
遺伝子数 3,878
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • 454
  • Illumina
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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1.4 MB 1.2 MB 869.1 KB 301.5 KB