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微生物 : Marivirga tractuosa

微生物株情報

NBRC番号 15989
学名 Marivirga tractuosa
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 15989 <- DSM 4126 <- NCMB 1408 <- R.A. Lewin, H-43
他保存機関番号 ATCC 23168=CIP 106410=DSM 4126=LMG 8378=NCIMB 1408=NCMB 1408=VKM B-1430
他株番号
参考文献
5360473
Isolation, cultivation and characterization of flexibacteria. (J Gen Microbiol. 1969)
5360474
Deoxyribonucleic acid base composition of flexibacteria. (J Gen Microbiol. 1969)
5360476
A classification of flexibacteria. (J Gen Microbiol. 1969)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseFtrac_2421 Ftrac_0653 Ftrac_3256
n-alkane hydroxylation(NFUNC_0008)
必須B
ALKB
(NRULE_0024)
Alkane 1-monooxygenaseFtrac_0880
Arsenical resistance(NFUNC_0004)
必須D
ARSB2
(NRULE_0016)
Arsenite resistance protein ArsBFtrac_2630
ARSC1
(NRULE_0017)
Arsenate reductaseFtrac_0848
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseFtrac_0779
Freeze resistance (by antifreeze protein)(NFUNC_0019)
必須A
AFP
(NRULE_0089)
Ice-structuring proteinFtrac_0100
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseFtrac_1888
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFtrac_1791 Ftrac_0410 Ftrac_1664
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinFtrac_1791 Ftrac_1664 Ftrac_0410
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseFtrac_2049
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseFtrac_3555
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseFtrac_2458
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseFtrac_2050
Uptake of osmoprotectant(NFUNC_0061)
必須C
BCCT
(NRULE_0220)
BCCT family transporterFtrac_2905

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA37901
ローカスタグFTRAC
INSDC entriesCP002349
ステータスComplete
解析状況Finished
コンティグ数2
サイズ(bp) 4,516,490
遺伝子数 3,757
フィニッシングゴールFinished
アセンブル方法Newbler v. 2.3
冗長度
シーケンス方法
  • Illumina
  • 454
参考文献
  • Complete genome sequence of Marivirga tractuosa type strain (H-43). (Stand Genomic Sci. 2011) PMID: 21677852

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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TSV
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1.3 MB 1.2 MB 861.2 KB 286.5 KB