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微生物 : Microscilla marina

微生物株情報

NBRC番号 16560
学名 Microscilla marina
別名(シノニム) 該当データなし
由来 IFO 16560 <- NCIMB 1400 <- R.A. Lewin
他保存機関番号 ATCC 23134=DSM 4236=LMG 18923=NBRC 16042=NCIMB 1400
他株番号 SI08
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseM23134_04564 M23134_01337
n-alkane hydroxylation(NFUNC_0008)
必須B
ALKB
(NRULE_0024)
Alkane 1-monooxygenaseM23134_01361
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinM23134_00768 M23134_04885
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseM23134_01055
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DM23134_01068
Chloramphenicol resistance(NFUNC_0025)
必須A
CAT1
(NRULE_0107)
Chloramphenicol acetyltransferaseM23134_04581
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinM23134_06816
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinM23134_06817 M23134_05860 M23134_01711
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinM23134_01711 M23134_05860 M23134_06817
任意 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinM23134_06815
 
MODC
(NRULE_0326)
Molybdate ABC transporter ATP-binding proteinM23134_02802
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DM23134_01068
Phytic acid hydrolysis(NFUNC_0085)
必須A
PHYT
(NRULE_0258)
3-phytaseM23134_07188
Trehalose biosynthesis (from NDP-glucose and glucose-6-phosphate)(NFUNC_0031)
必須A
TPS
(NRULE_0119)
Trehalose-phosphate synthaseM23134_00593
TPP
(NRULE_0120)
Trehalose-6-phosphate phosphataseM23134_00593

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA13411
ローカスタグ
INSDC entriesAAWS00000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数135
サイズ(bp) 9,771,226
遺伝子数 8,319
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
FASTA
gz
FASTA
gz
FASTA
gz
TSV
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2.9 MB 2.5 MB 1.6 MB 634.3 KB