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微生物 : Chrysiogenes arsenatis

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Chrysiogenes arsenatis
別名（シノニム） 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 11915
他株番号
参考文献
24233593
Draft Genome Sequence of the Arsenate-Respiring Bacterium Chrysiogenes arsenatis Strain DSM 11915. (Genome Announc. 2013)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseP304_RS0101545
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseP304_RS0103420
Ectoine biosynthesis(NFUNC_0056)
必須A
ECTB
(NRULE_0186)
Diaminobutyrate--2-oxoglutarate transaminaseP304_RS0104510
ECTA
(NRULE_0187)
L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferaseP304_RS0104505
ECTC
(NRULE_0188)
L-ectoine synthaseP304_RS0104515
Freeze resistance (by antifreeze protein)(NFUNC_0019)
必須A
AFP
(NRULE_0089)
Ice-structuring proteinP304_RS14395 P304_RS14390
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須A
MOP
(NRULE_0322)
Putative molybdenum-binding proteinP304_RS0109030 P304_RS0104115 P304_RS0109020
B
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorP304_RS0109020
C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinP304_RS0101940 P304_RS0104100 P304_RS0103440 P304_RS0109025
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinP304_RS0104100 P304_RS0103440 P304_RS0101940 P304_RS0109025
任意 
MODE
(NRULE_0323)
Putative molybdate-dependent transcriptional regulatorP304_RS0109020
 
MODB
(NRULE_0325)
Molybdate ABC transporter permease proteinP304_RS0109035
Nitrogenase(NFUNC_0094)
必須A
NIFD
(NRULE_0347)
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chainP304_RS0112265
NIFK
(NRULE_0348)
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chainP304_RS0112260
VNFH
(NRULE_0353)
Nitrogenase reductaseP304_RS0112270
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseP304_RS0101380
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2P304_RS15475 P304_RS0101380
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDP304_RS15490
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseP304_RS0107225
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseP304_RS0104870
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFP304_RS13785

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA217687
ローカスタグP304
INSDC entriesNZ_AWNK01000001
ステータスScaffold
解析状況
コンティグ数22
サイズ(bp) 2,824,977
遺伝子数 2,508
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Draft Genome Sequence of the Arsenate-Respiring Bacterium Chrysiogenes arsenatis Strain DSM 11915. (Genome Announc. 2013) PMID: 24233593

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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