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微生物 : Nitrososphaera viennensis

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Nitrososphaera viennensis
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 26422=JCM 19564
他株番号 EN76
参考文献
24907263
Nitrososphaera viennensis gen. nov., sp. nov., an aerobic and mesophilic, ammonia-oxidizing archaeon from soil and a member of the archaeal phylum Thaumarchaeota. (Int J Syst Evol Microbiol. 2014)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseNVIE_005360
Bioplastic synthesis(NFUNC_0001)
必須B
PHAE
(NRULE_0012)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaE subunitNVIE_003020
PHAC2
(NRULE_0373)
Poly(3-hydroxyalkanoate) polymerase PhaC subunitNVIE_003010
Mercury resistance(NFUNC_0005)
必須A
MERA
(NRULE_0008)
Mercuric reductaseNVIE_012710
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須H
NIKR
(NRULE_0331)
Nickel-responsive transcriptional regulator NikRNVIE_014970
Phenol degradation(NFUNC_0028)
必須B
PHEA1
(NRULE_0083)
Aromatic ring hydroxylaseNVIE_017160
任意 
FDX1
(NRULE_0034)
Putative Rieske-type ferredoxinNVIE_028160 NVIE_030140 NVIE_028840 NVIE_020010 NVIE_012450 NVIE_002620 NVIE_028140 NVIE_025420 NVIE_022410 NVIE_020190
 
FADR1
(NRULE_0101)
NADH-dependent flavin reductaseNVIE_001360
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSNVIE_029430
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTNVIE_029420

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJEA60103
ローカスタグNVIE
INSDC entriesCP007536
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 2,527,938
遺伝子数 3,123
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Nitrososphaera viennensis gen. nov., sp. nov., an aerobic and mesophilic, ammonia-oxidizing archaeon from soil and a member of the archaeal phylum Thaumarchaeota. (Int J Syst Evol Microbiol. 2014) PMID: 24907263

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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