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微生物 : Salinibacter ruber

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Salinibacter ruber
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DCM 13855=DSM 11347=CECT 5946
他株番号 M31
参考文献
16330755
The genome of Salinibacter ruber: convergence and gene exchange among hyperhalophilic bacteria and archaea. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2005)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseSRU_0573
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseSRU_1665
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ISRU_1662
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseSRU_0337
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseSRU_0847

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA16159
ローカスタグSRU
INSDC entriesCP000159
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 3,587,328
遺伝子数 2,833
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • The genome of Salinibacter ruber: convergence and gene exchange among hyperhalophilic bacteria and archaea. (Proc Natl Acad Sci U S A. 2005) PMID: 16330755

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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TSV
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1.0 MB 961.0 KB 637.3 KB 217.4 KB