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微生物 : Thermanaerovibrio acidaminovorans

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Thermanaerovibrio acidaminovorans
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号 DSM 6589
他株番号 Su883
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseTaci_1132
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseTaci_0480
Beta-lactam antibiotic resistance(NFUNC_0033)
必須D
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DTaci_1207
Metal-binding protein(NFUNC_0105)
必須C
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTaci_0095 Taci_1603
Molybdate transport (ABC transporter)(NFUNC_0097)
必須A
MODA
(NRULE_0324)
Molybdate ABC transporter substrate-binding proteinTaci_0095 Taci_1603
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseTaci_0465
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseTaci_0463
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseTaci_0462
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseTaci_0464
Penicillin resistance(NFUNC_0047)
必須B
BLAD
(NRULE_0125)
Beta-lactamase class DTaci_1207
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseTaci_1008
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Taci_1008
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDTaci_1010
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseTaci_1007
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseTaci_1009
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFTaci_0988
Trehalose biosynthesis (from D-glucose and ADP-glucose)(NFUNC_0032)
必須A
TRET
(NRULE_0121)
Trehalose synthaseTaci_0297

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA29531
ローカスタグTACI
INSDC entriesCP001818
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数1
サイズ(bp) 1,848,474
遺伝子数 1,738
フィニッシングゴール
アセンブル方法Newbler version 1.1.02.15, Phrap
冗長度
シーケンス方法
参考文献
  • Complete genome sequence of Thermanaerovibrio acidaminovorans type strain (Su883). (Stand Genomic Sci. 2009) PMID: 21304665

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ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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