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微生物 : Chloracidobacterium thermophilum B

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Chloracidobacterium thermophilum B
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号
参考文献
21951563
Complete genome of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum, a chlorophyll-based photoheterotroph belonging to the phylum Acidobacteria. (Environ Microbiol. 2012)

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCabther_A0054
Arginine degradation(NFUNC_0074)
必須A
ARGI
(NRULE_0239)
ArginaseCabther_A0669
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCabther_A1143
Biotin biosynthesis(NFUNC_0051)
必須A
BIOF
(NRULE_0182)
8-amino-7-oxononanoate synthaseCabther_A0332
BIOA
(NRULE_0183)
Adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferaseCabther_A2241
BIOD
(NRULE_0184)
ATP-dependent dethiobiotin synthetase BioDCabther_A0525
BIOB
(NRULE_0185)
Biotin synthaseCabther_A1844
(R)-pantothenate biosynthesis(NFUNC_0030)
必須A
PAND
(NRULE_0115)
Aspartate 1-decarboxylaseCabther_A0195
PANB
(NRULE_0116)
3-methyl-2-oxobutanoate hydroxymethyltransferaseCabther_A2258
PANE
(NRULE_0117)
2-dehydropantoate 2-reductaseCabther_A0704
PANC
(NRULE_0118)
Pantothenate synthetaseCabther_A0190 Cabther_A0700
Riboflavin biosynthesis(NFUNC_0058)
必須A
RIBB
(NRULE_0200)
3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthaseCabther_A1570
RIBA
(NRULE_0201)
GTP cyclohydrolase-2Cabther_A1570 Cabther_B0641
RIBD
(NRULE_0202)
Riboflavin biosynthesis protein RibDCabther_A0264
RIBH
(NRULE_0203)
6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthaseCabther_A1188
RIBE
(NRULE_0204)
Riboflavin synthaseCabther_A1966
任意 
RIBF
(NRULE_0205)
Riboflavin biosynthesis protein RibFCabther_A0521
Vitamin B6 biosynthesis (PdxS/PdxT pathway)(NFUNC_0059)
必須A
PDXS
(NRULE_0206)
Pyridoxal biosynthesis lyase PdxSCabther_A2160
PDXT
(NRULE_0207)
Glutamine amidotransferase subunit PdxTCabther_A2189

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA62457
ローカスタグCABTHER
INSDC entriesCP002514
ステータスComplete
解析状況
コンティグ数2
サイズ(bp) 3,695,372
遺伝子数 2,905
フィニッシングゴール
アセンブル方法
冗長度
シーケンス方法
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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1.1 MB 1.3 MB 698.9 KB 256.9 KB