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微生物 : Chitinispirillum alkaliphilum

微生物株情報

NBRC番号 該当データなし
学名 Chitinispirillum alkaliphilum
別名(シノニム) 該当データなし
由来
他保存機関番号
他株番号 ACht6-1
参考文献
該当データなし

推定保有機能 >>詳細

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タイプパターン 構成遺伝子 該当CDS
Alanine racemization(NFUNC_0063)
必須A
ALR
(NRULE_0228)
Alanine racemaseCHISP_2926
Aminoglycoside resistance (by aminoglycoside N-acetyltransferase)(NFUNC_0041)
必須A
AAC3
(NRULE_0149)
Aminoglycoside N(3')-acetyltransferaseCHISP_2208
Anthranilate biosynthesis(NFUNC_0038)
必須A
GLAT
(NRULE_0142)
Glutamine amidotransferaseCHISP_2175
TRPE
(NRULE_0143)
Anthranilate synthase component ICHISP_2174
Bacitracin resistance(NFUNC_0022)
必須A
UPPP
(NRULE_0097)
Undecaprenyl-diphosphataseCHISP_0496
Macrolide antibiotic resistance(NFUNC_0045)
必須D
ERE
(NRULE_0168)
Erythromycin esteraseCHISP_1890 CHISP_1685 CHISP_2064
Trehalose biosynthesis (from maltooligosaccharide)(NFUNC_0037)
必須A
TREY
(NRULE_0140)
Maltooligosyl trehalose synthaseCHISP_3120 CHISP_3325
TREZ
(NRULE_0141)
Malto-oligosyltrehalose trehalohydrolaseCHISP_3326
任意 
GLGX
(NRULE_0139)
Glycogen debranching enzymeCHISP_3327
Trehalose biosynthesis (from maltose)(NFUNC_0034)
必須B
TRES
(NRULE_0128)
Trehalose synthaseCHISP_2737 CHISP_0785

ゲノム配列情報

BioProject IDPRJNA283172
ローカスタグCHISP
INSDC entriesLDWW00000000
ステータスWGS
解析状況
コンティグ数160
サイズ(bp) 4,434,773
遺伝子数 3,601
フィニッシングゴール
アセンブル方法GS De Novo Assembler v. 2.9
冗長度40.0x
シーケンス方法
  • 454
参考文献

データダウンロード

ゲノム塩基配列 CDS塩基配列 CDSアミノ酸変換配列 遺伝子/ORF リスト
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gz
FASTA
gz
FASTA
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TSV
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1.3 MB 1.2 MB 797.1 KB 283.2 KB