FR008_00070 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	FR-008
Entry name	FR-008
Contig	AY310323
Start / Stop / Direction	13,522 / 14,898 / + [in whole cluster] 13,522 / 14,898 / + [in contig]
Location	13522..14898 [in whole cluster] 13522..14898 [in contig]
Type	CDS
Length	1,377 bp (458 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	GDP-mycosamine glycosyltransferase
Product (GenBank)	FscMI
Gene
Gene (GenBank)	fscMI
EC number
Keyword	mycosamine
Note
Note (GenBank)	glycosyltransferase responsible for mycosamine attachment
Reference	ACC Q6W5Q9 PmId [14652074] Organizational and mutational analysis of a complete FR-008/candicidin gene cluster encoding a structurally related polyene complex. (Chem Biol. , 2003) [23324745] In vivo investigation of the substrate recognition capability and activity affecting amino acid residues of glycosyltransferase FscMI in the biosynthesis of candicidin. (Mol Biosyst. , 2013) comment [PMID: 14652074](2003) complete FR-008 gene clusterの報告。 fscMI : glycosyltransferase @attachment of mycosamine FscMI を妨害されたmutantではFR-008の抗真菌力価が下がる。そしてLC-MSn analysisによって得られた質量差から、そのmutantではmycosamineからHへの置換が起きている、つまりmycosamineが付着できていないことを確認。よってFscMI はFR-008のaglyconeへのC21での糖(mycosamine)の付着を担う。 --- この間に、candicidinとFR-008が一致した要素のmixtureであるという報告がある。産生株が異なる。 candicidin: S. griseus IMRU 3570 FR-008: Streptomyces sp. FR-008 --- [PMID: 23324745](2013) abstract: putative glycosyltransferase(GT)をコードするfscMI のmutant株で、amphDI, nysDI, pimKなどの相同なGT genesは、candicidin aglycone → candicidin/FR-008-III への変換を触媒できる。また、PKSのDH11 domainの不活化でpolyketide骨格が変化してもmycosamineを持つ新規polyene派生体が導かれ、これらpolyene GTsの基質特異性がゆるいことが確認された。さらに、site-directed mutagenesisによってFscMI のSer346, Ser361, His362 or Cys387 を変異すると有意に触媒活性が減少。さらなる解析から、Ser361 and Cys387 がGT FscMI の活性に決定的な残基であるようだと示唆された。

Sequence

>GDP-mycosamine glycosyltransferase [FscMI]
MDSAARPILFVSLPESGLLNPLLVLAGELARRGVPDLWFATDEHRREEVEALSDVSKVSF
ASLGEVVPELSAVTWDDEVYREVTQSSRFKAHRAVVRQSYRPALQARKYRELEQVVDEVR
PALMVVDCVAGFGVDLALARGIPYVLNVPFVASNVLTSHNPFGASYTPKSFPVPNSGLPA
RMSVRQKLANTLFKWRTLGMFLHPDMAALLREDAAIRKELGIAPPNAMTRVDEAAAVVCS
SVAELDYPFDIPDRVSLVGAVLPPLPEAPDDDEVTRWLDAQSSVVYMGFGTITRLTREEV
AALVEVARRMSGTHQFLWKLPKEQQHLLPEAGSLPDNLRVESWVPSQLDVLAHPNVSVFF
SHGGGNAYHEGVYFGKPQVVRPLWVDCFDQAVRGRDFGISLTLDKPHTVDPDDVVDKLTR
VTSDPAFRTEAERLGALQRAAGGRAAAADLVTGLLPAA

>GDP-mycosamine glycosyltransferase [FscMI]
ATGGACTCCGCCGCCCGGCCGATCCTCTTCGTCAGTCTCCCCGAGAGCGGGCTGCTCAAC
CCGTTGCTGGTGCTGGCCGGGGAGCTTGCCCGGCGCGGTGTGCCGGACCTGTGGTTCGCC
ACCGACGAGCACCGGCGCGAGGAGGTGGAGGCGCTCTCCGACGTCTCCAAGGTGTCGTTC
GCCTCGCTGGGCGAGGTGGTCCCCGAACTGTCGGCGGTGACCTGGGACGACGAGGTGTAC
CGCGAGGTCACCCAGTCCTCCCGCTTCAAGGCCCACCGCGCGGTCGTCCGGCAGTCCTAC
CGGCCCGCGCTCCAGGCGCGCAAGTACCGCGAGCTGGAGCAGGTCGTCGACGAGGTCCGG
CCGGCGCTGATGGTCGTCGACTGCGTCGCGGGCTTCGGCGTCGACCTGGCCCTGGCCCGG
GGCATCCCGTACGTGCTGAACGTGCCGTTCGTCGCCAGCAACGTGCTGACCTCGCACAAC
CCGTTCGGCGCCTCGTACACCCCCAAGAGCTTCCCGGTGCCCAACTCGGGGCTGCCCGCG
CGGATGTCGGTGCGGCAGAAGCTGGCCAACACGCTGTTCAAGTGGCGGACGCTCGGCATG
TTCCTGCACCCGGACATGGCGGCACTGCTGCGCGAGGACGCCGCGATACGCAAGGAACTG
GGCATCGCCCCGCCGAACGCCATGACCCGGGTCGACGAGGCCGCCGCCGTGGTGTGCTCC
TCCGTCGCGGAACTGGACTACCCCTTCGACATCCCGGACCGGGTGAGCCTGGTGGGCGCC
GTGCTGCCGCCGCTGCCCGAGGCACCGGACGACGACGAGGTCACCAGGTGGCTCGACGCG
CAGTCGTCGGTGGTCTACATGGGCTTCGGCACCATCACGCGCCTCACCCGCGAGGAGGTC
GCGGCGCTGGTGGAGGTGGCCCGGCGGATGTCCGGCACCCACCAGTTCCTGTGGAAGCTG
CCCAAGGAGCAGCAGCACCTGCTGCCCGAGGCCGGGTCGCTGCCGGACAACCTGCGGGTG
GAGAGCTGGGTGCCCTCGCAGCTCGATGTGCTGGCCCACCCGAACGTCTCCGTCTTCTTC
TCGCACGGCGGCGGCAACGCCTACCACGAGGGCGTCTACTTCGGTAAGCCGCAGGTCGTG
CGGCCCCTGTGGGTGGACTGCTTCGACCAGGCGGTCCGCGGCCGCGACTTCGGCATCAGC
CTGACCCTGGACAAGCCGCACACCGTCGACCCCGACGACGTGGTGGACAAGCTGACCCGG
GTCACCTCCGACCCCGCCTTCCGTACCGAGGCCGAACGCCTGGGCGCCCTGCAGCGGGCG
GCCGGAGGCCGTGCGGCCGCCGCCGATCTCGTGACCGGCCTGCTCCCGGCGGCATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR002213 UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (Family) PF00201 UDPGT
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

FR008_00060 FR008_00080