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Megalo_00090 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 3275 (=NBRC 14744)
Entry nameMegalomicin
Contig
Start / Stop / Direction9,220 / 8,228 / - [in whole cluster]
9,220 / 8,228 / - [in contig]
Locationcomplement(8228..9220) [in whole cluster]
complement(8228..9220) [in contig]
TypeCDS
Length993 bp (330 aa)
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Category2.3 modification addition of sugar moiety
ProductdTDP-hexose C-3 ketoreductase component
Product (GenBank)TDP-4-keto-6-deoxyhexose 2,3-reductase
GenemegBIIb
Gene (GenBank)megDVII
EC number
Keyword
  • mycarose
  • axial-OH
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[10972798] Biosynthesis of the anti-parasitic agent megalomicin: transformation of erythromycin to megalomicin in Saccharopolyspora erythraea. (Mol Microbiol. , 2000)
[17571859] Characterization of the heterodimeric MegBIIa:MegBIIb aldo-keto reductase involved in the biosynthesis of L-mycarose from Micromonospora megalomicea. (Biochemistry. , 2007)
comment
[PMID: 10972798](2000)
megalomicin (meg) biosynthetic gene clusterの報告。
megDVII: 2,3-reductase

---
[PMID: 17571859](2007)

megDVII→megBIIb
megBII→megBIIa

vivoでのdTDP-sugar中間体の解析が示したのは、MegBIIaも、そのhomologueであるMegBIIbも、それ自身による完全な活性型酵素ではないということ。
C3-ketoreductase activityはMegBIIa and MegBIIbの両方の存在下のみ観察されたことから活性型複合体形成が示唆された。
MegBIIa and MegBIIb が1:1 heterodimeric complexを形成する相互作用をすることが同時精製とsize exclusion chromatography experimentsで確かめられた。
L-mycarose pathwayの他の生合成遺伝子と共にmegBIIa and megBIIbを含むmycarose operonが構築され、E.coliでの生物変換実験によってテストされ、高レベルのmycarosyl-erythronolide Bが産生された。

MegBIIaは活性残基を欠いている。
MegBIIbはC末が不完全で、EryBIIのC末で置きかえるとself-dimerizationし、活性を持つ。
MegBIIaは、MegBIIbの構造安定性を維持するための足場として働くと示唆される。

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selected fasta
>dTDP-hexose C-3 ketoreductase component [TDP-4-keto-6-deoxyhexose 2,3-reductase]
MGTTGAGSARVRVGRSALHTSRLWLGTVNFSGRVTDDDALRLMDHALERGVNCIDTADIY
GWRLYKGHTEELVGRWFAQGGGRREETVLATKVGSEMSERVNDGGLSARHIVAACENSLR
RLGVDHIDIYQTHHIDRAAPWDEVWQAAEHLVGSGKVGYVGSSNLAGWHIAAAQESAARR
NLLGMISHQCLYNLAVRHPELDVLPAAQAYGVGVFAWSPLHGGLLSGVLEKLAAGTAVKS
AQGRAQVLLPAVRPLVEAYEDYCRRLGADPAEVGLAWVLSRPGILGAVIGPRTPEQLDSA
LRAAELTLGEEELRELEAIFPAPAVDGPVP
selected fasta
>dTDP-hexose C-3 ketoreductase component [TDP-4-keto-6-deoxyhexose 2,3-reductase]
GTGGGAACCACCGGGGCCGGGTCCGCCCGGGTACGCGTCGGACGATCGGCGTTGCACACC
AGCCGACTCTGGCTCGGCACCGTGAACTTCAGTGGACGGGTGACCGACGACGACGCGCTG
CGGCTGATGGACCACGCCCTCGAGCGGGGCGTCAACTGCATCGACACCGCCGACATCTAC
GGCTGGCGGCTCTACAAGGGCCACACCGAGGAACTCGTCGGACGGTGGTTCGCCCAGGGC
GGAGGTCGACGCGAGGAGACCGTCCTGGCGACCAAGGTGGGCAGCGAGATGAGCGAACGG
GTCAACGACGGCGGGCTCTCCGCCCGACACATCGTCGCCGCCTGCGAGAACTCCCTCCGC
CGCCTCGGGGTCGACCACATCGACATCTACCAGACGCACCACATCGACCGCGCCGCACCG
TGGGACGAGGTGTGGCAGGCCGCCGAACATCTGGTCGGCAGTGGGAAGGTCGGGTACGTC
GGCTCCTCCAACCTGGCGGGCTGGCACATCGCCGCCGCCCAGGAGAGCGCGGCACGCCGC
AACCTGCTCGGCATGATCTCCCACCAGTGCCTGTACAACCTGGCCGTCCGCCACCCCGAG
CTGGACGTCCTGCCCGCCGCCCAGGCGTACGGGGTGGGCGTGTTCGCCTGGTCCCCCCTG
CACGGCGGGCTGCTCAGCGGCGTACTGGAGAAGTTGGCAGCCGGAACCGCCGTCAAGTCG
GCGCAGGGACGCGCCCAGGTGCTCCTCCCCGCCGTACGCCCCCTCGTCGAGGCGTACGAG
GACTACTGCCGACGCCTCGGCGCGGACCCGGCCGAGGTCGGTCTGGCCTGGGTCCTGTCC
CGCCCCGGGATCCTGGGCGCTGTCATCGGCCCCCGCACACCCGAGCAGCTCGACTCGGCG
TTACGGGCCGCCGAGCTGACGCTGGGCGAGGAGGAACTCCGGGAACTCGAAGCGATCTTC
CCGGCACCGGCCGTCGACGGGCCGGTGCCGTAG

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR023210 NADP-dependent oxidoreductase domain (Domain)
[18-322] 5.00000000000001e-84 G3DSA:3.20.20.100
G3DSA:3.20.20.100   Aldo/ket_red
[8-328] 6.29998179434741e-84 SSF51430
SSF51430   Aldo/ket_red
[23-320] 3.99999999999998e-64 PF00248
PF00248   Aldo_ket_red
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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