Nanch_00040 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces nanchangensis
Strain	NS3226
Entry name	Nanchangmycin
Contig	AF521085
Start / Stop / Direction	4,923 / 3,724 / - [in whole cluster] 4,923 / 3,724 / - [in contig]
Location	complement(3724..4923) [in whole cluster] complement(3724..4923) [in contig]
Type	CDS
Length	1,200 bp (399 aa)

Annotation

Category	5.4 hypothetical protein
Product	hypothetical protein
Product (GenBank)	NanT4
Gene
Gene (GenBank)	nanT4
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	hypothetical chemoreceptor
Reference	ACC Q7WTF9 PmId [12770825] A complete gene cluster from Streptomyces nanchangensis NS3226 encoding biosynthesis of the polyether ionophore nanchangmycin. (Chem Biol. , 2003) comment Nanchangmycin生合成のためのcomplete gene clusterの報告。（complete clusterと言っているが、同定されたclusterがNanchangmycin生合成に十分かは確認されていない。）配列解析からの機能予測 NanT4: Chemoreceptor NanT5: putative sensor histidine kinaseとNanT3: putative response regulator proteinの間に、putative chemoreceptorをコードするNanT4があり、nanT5と同じ向きで転写される。これは細菌の膜貫通シグナル伝達を暗示し、特異的な化学物質の認識と、非共有結合的に関連したhistidine kinaseの調節により、細菌のchemoreceptorsによって媒介される。 Naのionophoreとして最も役立つであろうnanchangmycinの場合、細胞内のkinase活性を調節する膜貫通シグナルを生み出すために、ligandは膜貫通receptorの外部domainに結合するかもしれない。そして順々にnanchangmycin産生を調節する。

Sequence

>hypothetical protein [NanT4]
MGEDFRQLITRHQLRGIRAGGLVILVTLHIGSALPGLLGGLGEYRHPWIPLAAYGLLTLI
LGGSVVLGLDGRPWPRGWVPCALAGTFVASVATTSQVPADHYFVSSLHWSYSLAGWFTVV
LLGHRGPLVSGAFLGAHLAVTAALLLTVDVPSRSIGASMALSALSAGCFQMTIAAGAKLL
LDSSAAIGQALRAQERVRTRIAVARQIQADQRRRYAELNATVLPLLTGLASGSLDPEDDE
VRHACALEAARLRRLFAESDCTFDPLVHEMRACIDVAERNGTTVQLAVRGDPLELPLPLR
RALLDPVIAALAAAGQTARVTVVRGGDQVRVGVVVDALRDRLPEPKANGIRVRTVHAEDR
LLVEAACRITARPELSDRPEPPWPPAWPSWSPAGRRSRT

>hypothetical protein [NanT4]
GTGGGTGAGGACTTCCGGCAGCTGATCACCCGTCACCAGCTCCGTGGCATCCGCGCCGGG
GGGCTGGTCATCCTGGTCACTCTGCACATCGGGTCCGCGCTGCCCGGCCTGCTGGGCGGC
CTGGGCGAATACCGGCACCCCTGGATCCCCCTGGCCGCCTACGGCCTGCTCACGCTGATC
CTCGGCGGCAGCGTGGTTCTCGGCCTCGACGGGCGCCCCTGGCCGCGCGGCTGGGTGCCA
TGCGCGCTGGCCGGCACCTTCGTCGCCTCGGTGGCCACCACCAGCCAGGTCCCGGCGGAC
CACTACTTCGTCAGCTCCTTGCACTGGTCCTACTCGCTCGCGGGCTGGTTCACCGTCGTC
CTGCTCGGCCACCGAGGACCGCTGGTGTCCGGCGCCTTCCTCGGCGCTCATCTGGCCGTC
ACCGCCGCCCTGTTGCTGACCGTCGACGTGCCCTCGCGGTCCATCGGGGCGAGCATGGCC
CTGAGCGCCCTGTCCGCCGGCTGCTTCCAGATGACCATCGCCGCCGGCGCCAAGCTGCTC
CTCGACAGCAGCGCGGCCATCGGCCAGGCCCTGCGGGCCCAGGAGCGGGTACGCACCCGT
ATCGCAGTCGCCCGGCAGATCCAGGCGGACCAGCGCCGCCGGTACGCCGAGCTGAACGCC
ACCGTGCTCCCCCTGCTCACCGGGCTCGCCAGCGGCTCCCTCGACCCGGAGGACGACGAG
GTGCGGCACGCCTGCGCGCTGGAAGCCGCCCGGCTGAGGCGGCTGTTCGCGGAGAGCGAC
TGTACGTTCGATCCGCTGGTCCACGAGATGCGCGCCTGTATCGACGTCGCCGAGCGCAAC
GGGACCACCGTGCAACTCGCCGTCCGCGGCGACCCCCTCGAACTGCCCCTGCCCCTGCGC
CGCGCGCTCCTGGACCCGGTCATCGCCGCGCTGGCCGCCGCCGGGCAGACGGCGCGCGTC
ACCGTGGTCCGCGGCGGGGATCAGGTGCGGGTGGGCGTCGTGGTGGACGCGCTGCGGGAC
CGGCTGCCCGAGCCGAAGGCGAACGGGATCCGGGTACGCACGGTCCACGCCGAGGACCGT
CTCCTCGTGGAGGCCGCCTGCCGGATCACAGCTCGTCCAGAGCTATCAGACCGTCCTGAA
CCGCCCTGGCCACCAGCTTGGCCTTCGTGGTCGCCGGCCGGCCGGCGTTCGCGTACTTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro	No significant hit
SignalP	Eukaryota
TMHMM	Transmembrane 5

Nanch_00030 Nanch_00050