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Phosl_00050 : CDS information

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Organism
StrainHK803
Entry namePhoslactomycin
Contig
Start / Stop / Direction9,770 / 9,000 / - [in whole cluster]
9,770 / 9,000 / - [in contig]
Locationcomplement(9000..9770) [in whole cluster]
complement(9000..9770) [in contig]
TypeCDS
Length771 bp (256 aa)
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Category1.4 Other
Productputative type II thioesterase
Product (GenBank)Plm8
Gene
Gene (GenBank)plm8
EC number
Keyword
  • type II thioesterase
Note
Note (GenBank)
  • thioesterase type II
Reference
ACC
PmId
[12819191] Enhancement and selective production of phoslactomycin B, a protein phosphatase IIa inhibitor, through identification and engineering of the corresponding biosynthetic gene cluster. (J Biol Chem. , 2003)
comment
Phoslactomycins生合成gene clusterのクローニング、配列解析報告。
separate type II TE protein (plmT8)はPKSsの編集と校正で重要な役割をする。

--
plmT8となっているがplm8が正しいと思われる。同じ著者らの続報[PMID: 16609856](2006)でほぼ同様の記述があるが、そこではplm8となっている。
Related Reference
ACC
Q846W2
NITE
Monen_00290
PmId
[16984884] Identification of NanE as the thioesterase for polyether chain release in nanchangmycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2006)
comment
18th(Q846W2) 50%, 7e-61
Streptomyces cinnamonensis_monAX
Thioesterase
[Monen_00290]type II thioesterase

対照実験として。
MonAXはdiketide-SNACを加水分解したが、polyether-SNACを加水分解しなかった。
よって、polyether鎖の放出には関与しない。
ACC
Q6W5Q5
NITE
FR008_00110
PmId
[18836004] Selective removal of aberrant extender units by a type II thioesterase for efficient FR-008/candicidin biosynthesis in Streptomyces sp. strain FR-008. (Appl Environ Microbiol. , 2008)
comment
43rd(Q6W5Q5) 49%, 1e-57
Streptomyces sp. FR-008_fscTE
FscTE
[FR008_00110]type II thioesterase

fscTEはputative type II thioesterase (TEII)をコードする。
fscTE deletionでFR-008/candicidin産生は約90%減。
type I thioesteraseを不活化させたとき、FscTEは成熟して伸長したpolyketideの放出を代償することができなかった。

FscTE and TylOのHydrolytic activitiesは、
propionyl-S-N-acetylcysteamine > methylmalonyl-S-N-acetylcysteamine
acetyl-S-N-acetylcysteamine > malonyl-S-N-acetylcysteamine

したがって、TEII はacyl carrier proteins(ACP)に結合するnon-elongatable residuesを選択的に除去することにより、効果的なpolyketide生合成を維持することが結論付けられる。

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selected fasta
>putative type II thioesterase [Plm8]
MSSETATESDRWIRSYLPGPAEALHLVHFPHAGGSASYYRPFCTSLSDRFNALALQYPGR
QDRRDEPCVTDLHVLADLVFDRLRQCADRPMAFFGHSMGALLAFEVTRRFERELNTSPVA
LFLSGRRAPSRHRDENVDLSSNESLLAEIRELSGTDPRLLGDDEMLEMIMEPLRADYRAL
GAYRFVPQPPVRCPVTVLTGADDPRTARDEAAAWQEHTTGDFALRVFPGGHFFISENVAD
VTGFVAERLSAVPLPG
selected fasta
>putative type II thioesterase [Plm8]
TTGAGTTCAGAAACAGCCACCGAGTCGGACCGATGGATCCGCAGCTATCTACCGGGCCCC
GCCGAGGCGCTCCATCTCGTCCACTTTCCCCACGCAGGTGGTTCCGCCAGCTATTACCGG
CCCTTCTGCACCTCCCTGTCGGACCGGTTCAACGCGCTCGCCCTGCAGTATCCGGGGCGT
CAAGACCGGCGCGATGAGCCTTGTGTGACCGATCTGCACGTCCTGGCGGACCTCGTGTTC
GACCGGTTGCGGCAATGCGCGGACCGCCCGATGGCGTTCTTCGGCCACAGCATGGGGGCT
CTCCTGGCGTTCGAGGTGACGCGGAGGTTCGAGCGGGAACTCAACACCTCACCGGTGGCG
CTCTTCCTGTCCGGGCGGCGCGCTCCGTCCCGCCATCGGGACGAGAACGTCGACCTGAGC
AGCAACGAGAGCCTGCTCGCCGAGATCCGGGAGCTGAGTGGCACGGATCCCCGGCTGCTG
GGAGACGACGAGATGCTTGAAATGATCATGGAGCCGCTGCGCGCCGACTACCGAGCCCTG
GGCGCCTACCGGTTCGTGCCACAACCGCCCGTACGCTGCCCGGTCACCGTTCTGACCGGC
GCCGACGACCCCCGTACCGCCCGGGATGAGGCAGCCGCCTGGCAGGAGCACACCACTGGC
GACTTCGCACTGCGGGTGTTCCCCGGTGGTCACTTCTTCATCAGCGAGAACGTCGCCGAT
GTCACCGGCTTCGTCGCCGAGCGGCTCTCCGCTGTCCCACTGCCTGGTTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001031 Thioesterase (Domain)
[25-246] 1.40000000000001e-56 PF00975
PF00975   Thioesterase
SignalP
[1-37] 0.092 Signal
Eukaryota   
[1-36] 0.112 Signal
Bacteria, Gram-positive   
[1-23] 0.274 Signal
Bacteria, Gram-negative   
TMHMM No significant hit
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