Pyolu_00140 : CDS information

Location

Organism	Pseudomonas fluorescens
Strain	Pf-5
Entry name	Pyoluteorin
Contig	AF081920
Start / Stop / Direction	26,235 / 27,383 / + [in whole cluster] 26,235 / 27,383 / + [in contig]
Location	26235..27383 [in whole cluster] 26235..27383 [in contig]
Type	CDS
Length	1,149 bp (382 aa)

Annotation

Category	4.3 transport
Product	putative ABC transporter permease protein
Product (GenBank)	PltK
Gene
Gene (GenBank)	pltK
EC number
Keyword	type I secretion system
Note
Note (GenBank)	predicted transmembrane subunit of ABC transporter
Reference	ACC Q59DM6 PmId [16269724] Reciprocal regulation of pyoluteorin production with membrane transporter gene expression in Pseudomonas fluorescens Pf-5. (Appl Environ Microbiol. , 2005) comment pyoluteorin生合成clusterの3'側 pltZ-orf1についての論文 pltK: transmembrane subunit of ABC transporter pltK and pltNは、ABC transporterのtransmembrane domain subunitsのコンセンサス配列に似ている。6TMSs。
Related Reference	ACC Q4VWC8 PmId [16581203] Identification and characterization of a putative ABC transporter PltHIJKN required for pyoluteorin production in Pseudomonas sp. M18. (Gene. , 2006) comment 4th(Q4VWC8) 83%, 1e-175 Pseudomonas sp. M18_pltJ Inner membrane permease protein Pseudomonas sp. M18もPyoluteorinを産生する。 gene nameはP. fluorescens Pf-5と一致していない。 --- 配列から、pltHIJKN gene productsが典型的な3つの要素のABC export systemに組み込まれることが示唆される。そのシステムは、・inner membrane ABC transporter PltIJK ・membrane fusion protein PltH ・outer membrane efflux protein PltN からなる。 pltH or pltI 欠陥mutantではPlt非産生。 pltHIJKN gene clusterの過剰発現でPlt産生増加。 pltHIJKN gene clusterの異種性発現で外因性Pltへの抵抗性あり。外因性Pltは、Plt生合成gene clusterとABC transporter gene cluster pltHIJKN の両方の発現を転写レベルで誘導する。

Sequence

>putative ABC transporter permease protein [PltK]
MTMTDSNRSASGFRRRLIALTRKELRQLMRDKSNLAIGIVLPIVLILIFGYGLSLDIRNT
PLAVVLEDSSPSARSVVAKLASSDYFSVVQVTSMAEARALMDKRRVDGIVRVPADFSRRL
EQQDARLQLLLHGADANSAATLGRYVRGALNVWQQQQFDRSRQPQSAGRVLVVERMWFNA
ANSSTWYLVPGLIALIMTLVGAFLTSLVLAREWERGTLESLFVTPVRSIEILLAKIIPYF
LVGLLGLVMCLVSARLLFEVPIQGSLVLLLLSSMLYLLVTLGIGLLISAKTRNQFLASQI
AIIFSFLPALMLSGFLFDLRNVPTFIRVVGSILPATYFMELVKTLFLAGNNWPLIAKNLA
ILAAYAVFLLNAARLCTRKKLD

>putative ABC transporter permease protein [PltK]
ATGACCATGACTGACTCCAATCGATCCGCCTCAGGGTTCAGGCGCAGGCTCATTGCGCTC
ACCCGAAAGGAGTTGCGCCAATTGATGCGTGACAAGAGCAACCTGGCGATAGGCATTGTC
CTGCCCATCGTACTGATCCTGATATTTGGCTACGGCCTGTCCCTGGACATTCGCAACACG
CCGCTGGCCGTGGTCCTGGAAGACAGCTCCCCCAGCGCCCGCAGCGTGGTGGCGAAGCTT
GCGAGTTCGGACTACTTCTCGGTGGTCCAGGTGACCAGCATGGCCGAGGCCCGAGCGCTG
ATGGACAAGCGTCGGGTCGACGGCATCGTGCGCGTGCCGGCGGATTTTTCCAGGCGCCTC
GAACAGCAGGATGCGCGCTTGCAATTGCTCCTGCATGGCGCCGATGCCAACAGCGCGGCG
ACCCTTGGACGCTATGTCAGGGGCGCGCTGAATGTCTGGCAACAGCAGCAGTTCGACCGC
TCCCGGCAGCCCCAGTCGGCCGGTCGGGTGCTGGTCGTCGAACGCATGTGGTTCAACGCC
GCCAACAGCAGTACCTGGTACCTGGTGCCCGGGCTCATCGCCCTGATCATGACCCTGGTG
GGTGCCTTCCTGACCTCTCTGGTACTGGCCCGGGAGTGGGAGCGGGGCACGCTCGAATCA
CTGTTCGTCACCCCGGTCAGGTCGATCGAAATACTCCTGGCCAAGATCATTCCCTATTTC
CTGGTGGGCCTGCTGGGCCTGGTGATGTGCCTGGTTTCGGCGCGGTTGCTGTTCGAGGTA
CCGATCCAGGGTTCGCTGGTGCTCCTGCTGTTGAGCTCCATGCTCTACCTGCTGGTCACC
CTGGGCATTGGCCTGCTGATTTCGGCGAAGACACGCAACCAGTTCCTGGCCAGCCAGATC
GCGATCATCTTCAGCTTCCTGCCGGCGCTGATGCTCTCGGGGTTCCTCTTCGATCTGCGC
AATGTGCCGACGTTCATCCGCGTGGTGGGCTCGATCCTGCCGGCGACTTACTTCATGGAA
CTGGTCAAGACCCTGTTCCTGGCTGGCAACAACTGGCCATTGATCGCCAAGAACCTCGCA
ATCCTCGCGGCCTACGCCGTGTTCCTGTTGAACGCTGCACGCCTGTGCACCCGCAAGAAG
CTGGATTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR000412 ABC-2 (Family) PS51012 ABC_TM2
SignalP	Eukaryota
TMHMM	Transmembrane 6

Pyolu_00130 Pyolu_00150