Adria_00160 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces peucetius
Strain	ATCC 29050 (=NBRC 100596)
Entry name	Doxorubicin
Contig	AF048833
Start / Stop / Direction	11,897 / 11,079 / - [in whole cluster] 139 / 957 / + [in contig]
Location	complement(11079..11897) [in whole cluster] 139..957 [in contig]
Type	CDS
Length	819 bp (272 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	cyclase
Product (GenBank)	polyketide cyclase
Gene
Gene (GenBank)	dpsY
EC number
Keyword	2nd and 3rd ring
Note
Note (GenBank)	DpsY; component of daunorubicin/doxorubicin polyketide synthase
Reference	ACC O68500 PmId [9573189] The Streptomyces peucetius dpsY and dnrX genes govern early and late steps of daunorubicin and doxorubicin biosynthesis. (J Bacteriol. , 1998) [10419974] The Streptomyces peucetius dpsC gene determines the choice of starter unit in biosynthesis of the daunorubicin polyketide. (J Bacteriol. , 1999) [11520231] Production of aromatic minimal polyketides by the daunorubicin polyketide synthase genes reveals the incompatibility of the heterologous DpsY and JadI cyclases. (J Nat Prod. , 2001) [12715874] Studies on a second and third ring cyclization in anthracycline biosynthesis. (J Antibiot (Tokyo). , 2003) comment [PMID: 9573189](1998) daunorubicin(DNR),doxorubicin(DXR)生合成に関与。 mutantが別の変換体であるUWM5を蓄積することから、合成系初期の12-deoxyaklanonic acid(aklanonic acid)形成反応を触媒すると考えられる。 -- 同じ著者らの続報。 [PMID: 10419974](1999) pWHM1011: tcmJ+dpsABCDGEF = UWM5 pWHM1012: tcmJ+dpsABCDGEFY = AA dpsYがないとshunt産物UWM5産生。 dpsYがあるとaklanonic acid(AA)産生。 -- [PMID: 11520231](2001) jadomycinのcyclase JadI とDXR/DNRのcyclase DpsYを比較検討。 JadI の存在下ではangucyclineが、DpsYの存在下ではDNRが形成されることをplasmidによる生合成genesの異種発現で確認。 JadI とDpsYを入れ替えての期待された新規化合物産生はできなかった。 -- [PMID: 12715874](2003) 異種性遺伝子発現によるanthracycline生合成での2nd and 3rd ring cyclizationの研究に焦点を合わせた論文。DpsYについて上記論文を引用している。 anthracycline非産生Streptomyces peucetius mutant D2とのaa比較により、重要なaaを同定している。

Sequence

>cyclase [polyketide cyclase]
MCCGGPRGAEATTMRIIDISSAVDASGWEPDEVRHEVHSPREGAVHMSEEMRRHFGVAFD
PDELPEGEFLSLDRLTLTSHTGTHIDAPSHYGSRAHYGDGRPRNIDELPLDWFYGPGLLL
DLTGCDGPTAGAGDLEKELARIGRVPEPGTIVLLRTGASERAGTEQYFTDFTGLDGPAVN
LLLDHGVRVIGTDAFSLDAPFGAVIRRYRETGDRSVLWPAHVTGRHREYCQIERLGNLAA
LPGCDGFQVACFPVKITGGGAGWTRAVAFVDE

>cyclase [polyketide cyclase]
GTGTGCTGTGGTGGCCCGAGAGGAGCGGAGGCGACGACCATGCGGATCATCGACATCTCC
AGCGCGGTGGACGCGTCGGGATGGGAACCGGACGAAGTGCGGCACGAGGTGCACAGCCCC
CGGGAGGGCGCCGTCCACATGAGCGAGGAGATGCGGCGTCACTTCGGTGTCGCGTTCGAC
CCCGACGAGCTGCCCGAAGGCGAGTTCCTGTCGCTCGACCGTCTCACGCTCACGTCCCAC
ACCGGCACGCACATCGACGCTCCCTCCCACTACGGCTCACGGGCGCACTACGGCGACGGC
AGGCCGCGGAACATCGACGAGCTGCCACTCGACTGGTTCTACGGCCCGGGGCTGCTGCTC
GACCTCACCGGCTGCGATGGACCGACGGCCGGGGCCGGGGACCTGGAGAAGGAACTGGCC
CGCATCGGCCGGGTGCCGGAACCGGGCACCATCGTCCTGCTCCGCACCGGCGCCTCCGAG
CGGGCCGGGACCGAGCAGTACTTCACCGACTTCACCGGTCTGGACGGCCCCGCCGTCAAC
CTGCTGCTCGACCACGGCGTGCGGGTCATCGGCACCGACGCGTTCAGCCTGGACGCGCCG
TTCGGCGCCGTCATCCGCCGGTACCGGGAGACGGGTGACCGGTCGGTGCTCTGGCCGGCG
CATGTCACCGGCCGCCACAGGGAGTACTGCCAGATCGAGCGGCTGGGGAACCTGGCCGCG
CTGCCGGGGTGCGACGGCTTCCAGGTCGCCTGCTTCCCCGTGAAGATCACCGGCGGGGGG
GCCGGCTGGACCCGCGCGGTCGCCTTCGTCGACGAATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR007325 Putative cyclase (Family) PF04199 Cyclase
SignalP	Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

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