Dauno_00080 Dauno_00080   Dauno_00100 Dauno_00100

Dauno_00090 : CDS information

close this sectionLocation

Organism
StrainC5
Entry nameDaunorubicin
Contig
Start / Stop / Direction18,623 / 19,108 / + [in whole cluster]
1,353 / 1,838 / + [in contig]
Location18623..19108 [in whole cluster]
1353..1838 [in contig]
TypeCDS
Length486 bp (161 aa)
Click on the icon to see Genetic map.

close this sectionAnnotation

Category3.4 other modification
Productaklanonic acid methyl ester cyclase
Product (GenBank)
Gene
Gene (GenBank)dauD
EC number
Keyword
  • 4th ring
Note
Note (GenBank)
  • putative
Reference
ACC
PmId
[7836284] Analysis of clustered genes encoding both early and late steps in daunomycin biosynthesis by Streptomyces sp. strain C5. (J Bacteriol. , 1995)
comment
Daunorubicin (DNR)のPKS genes領域に近接した4ORFsの同定。

aklanonic acid methyl ester(AAME)を蓄積するdauD dauE double mutantで、dauDが（dauE mutant株によって蓄積される）maggiemycin産生を回復する。
S.lividans TK24に導入されたとき、dauDは異種性ホストで実質的なAAME cyclase活性を与えた。
AAME clyclase活性はpH 7.5 and pH 6.0 のどちらでも観察されたので、活性のための最適pHは幅広いことが示唆される。
Related Reference
ACC
Q54808
NITE
Adria_00320
PmId
[7601857] Functional characterization and transcriptional analysis of a gene cluster governing early and late steps in daunorubicin biosynthesis in Streptomyces peucetius. (J Bacteriol. , 1995)
[10200167] DnrD cyclase involved in the biosynthesis of doxorubicin: purification and characterization of the recombinant enzyme. (Biochemistry. , 1999)
comment
Blast 2nd, id97%, 3e-76
Streptomyces peucetius_dnrD
Methylaklanonic acid cyclase
[DoBISCUIT]aklanonic acid methyl ester cyclase

--
[PMID: 7601857](1995)
pWHM917(carrying dnrD)を含むdnrI::aphII strain(WMH1445)は、
aklanonic acid methylester(AAME) → aklaviketoneの変換ができる。
この変換でできた産物をdpsB(-)mutantに加えると、RHOへ変換可能。よって正しい中間体。

これらの演繹は、相同なStreptomyces sp. strain C5 dauD geneの機能と完全に一致する。
DnrDはDauDより16aa短い。

--
同じ著者らの続報
[PMID: 10200167](1999) abstract
Streptomyces peucetius dnrDの変異は、AAME → aklaviketone への環化をブロックする。
さらに調査するためdnrDをE.coliで過剰発現、タンパク精製、特徴づけ。
DnrDはたぶん分子内aldol縮合メカニズムを介して、AAME → aklaviketone への変換を触媒することを示した。

close this sectionSequence

selected fasta
>aklanonic acid methyl ester cyclase
MSPQIDLVRRMVEAYNTGKTDDVAEFILHEYLNPGALEHNPELRGPEAFAAAVTWLKYAF
SEEAHLEEIGYEENGPWVRAKLALYGRHVGNLVGMPATGRRFSGEQIHLIRIVDGKIRDH
RDWPDYLGTYRQLGEPWPTPEGWRPCPPPPRRRHDRSTDTP
selected fasta
>aklanonic acid methyl ester cyclase
ATGAGCCCGCAGATCGATCTGGTCCGCCGCATGGTGGAGGCGTACAACACGGGAAAAACC
GATGATGTCGCGGAGTTCATTCTACACGAGTACCTGAACCCCGGCGCGCTGGAGCACAAC
CCGGAGCTGCGAGGCCCGGAGGCGTTCGCAGCTGCCGTCACGTGGCTCAAGTACGCCTTC
TCCGAGGAGGCGCACCTGGAGGAGATCGGGTACGAGGAGAACGGCCCGTGGGTCCGCGCG
AAGCTCGCCCTCTACGGGCGGCACGTCGGCAACCTCGTCGGCATGCCGGCAACGGGGCGC
CGGTTCTCCGGTGAGCAGATCCACCTCATCCGCATCGTCGACGGCAAGATCCGTGATCAC
CGCGACTGGCCCGACTATCTCGGCACCTACCGCCAGCTCGGCGAGCCCTGGCCCACTCCC
GAGGGCTGGCGACCCTGCCCCCCACCGCCCCGCCGACGCCACGACAGGAGCACGGACACA
CCATGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR009959 Polyketide cyclase SnoaL-like domain (Domain)
[6-133] 9.50000000000005e-33 PF07366
PF07366   SnoaL
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Dauno_00080 Dauno_00080   Dauno_00100 Dauno_00100
Page top