Avil_00200 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces viridochromogenes
Strain	Tü57
Entry name	Avilamycin
Contig	AF333038
Start / Stop / Direction	16,593 / 17,624 / + [in whole cluster] 16,593 / 17,624 / + [in contig]
Location	16593..17624 [in whole cluster] 16593..17624 [in contig]
Type	CDS
Length	1,032 bp (343 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	putative acyltransferase
Product (GenBank)	AviN
Gene
Gene (GenBank)	aviN
EC number
Keyword	dichloroisoeverninic acid
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q93KW7 PmId [9335272] Cloning of an avilamycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces viridochromogenes Tu57. (J Bacteriol. , 1997) [11410376] Biosynthesis of the orthosomycin antibiotic avilamycin A: deductions from the molecular analysis of the avi biosynthetic gene cluster of Streptomyces viridochromogenes Tu57 and production of new antibiotics. (Chem Biol. , 2001) comment [PMID:9335272] Avilamycin生合成遺伝子クラスターの報告。 ORF1-4(orf1,aviM,aviD,aviE)のcloning。このORFは、ORF1。truncated ORFとして取得されている。 orsellinic acid合成のためのスターターユニットを制御するORFだとしているが、機能解析はされていない。 [PMID:11410376] Avilamycin生合成遺伝子クラスターの報告。本論文にてORF1の完全長配列が取得され、AviNと改名されている。 AviN:DpsC from Streptomyces peucetius ATCC29050 [Proposed function:Orsellinic acid biosynthesis] このORFについて機能解析はされていない。
Related Reference	ACC Q0R4P5 NITE Chth_00090 PmId [19266533] Dissection of two acyl-transfer reactions centered on acyl-S-carrier protein intermediates for incorporating 5-chloro-6-methyl-O-methylsalicyclic acid into chlorothricin. (Chembiochem. , 2009) comment Streptomyces antibioticus ChlB3 [DoBISCUIT]6-methylsalicylyltransferase 異種性発現、精製したChlB1 ACP domain, ChlB2, ChlB3, ChlB6を使い、ChlB1(PKS)-ACPからChlB2(ACP)への6-methylsalicylyl transferがChlB3によるものであり、ChlB6ではできないことをHPLCで確認している。6-methylsalicylic acid(6-MSA)では活性が検出されないので、ChlB1(PKS)-ACPから6-MSAとして放出されることなく、直接ChlB2(ACP)へ移動される。

Sequence

>putative acyltransferase [AviN]
MQIADLYIGALGVFVPPCVSVEWAVERGLYPAEEAEAHELGGVAIAGDVPPPEMALRAAQ
QAVKRWGGSPTEFDLLLYASTWHQGPDGWPPQAYLQRHLVGGDMLALEIRQGCNGVFSAL
ELAVGYLQADPNRTSALIVAADNYGTPLIDRWRMGPGFIGGDALPPWCCKRPGFARLCSV
ASKGLPEIESLHRGDEPLFPPSITRGRATDFSARIGQQFATRSPAFVAMAEIQDHMMDVA
ERALAGAGIGMADVARVSFMNYHAKWSSSAEWRPGGCRCPGPRGNSAGRSATCGASDHLL
SMEHIVRTGELAPGDHVLQLATAPGLVVSSAVLQVLESPDWDE

>putative acyltransferase [AviN]
GTGCAGATAGCCGACCTGTACATCGGTGCTCTCGGCGTCTTCGTACCGCCGTGTGTGAGC
GTCGAATGGGCCGTGGAACGCGGCCTCTATCCGGCCGAAGAGGCCGAGGCACACGAGCTC
GGCGGGGTCGCCATAGCCGGCGACGTCCCCCCTCCGGAAATGGCCTTGCGGGCGGCGCAG
CAGGCGGTGAAGAGGTGGGGCGGATCGCCGACGGAATTCGATCTGCTGCTGTATGCGAGC
ACCTGGCACCAGGGCCCGGACGGCTGGCCGCCCCAGGCATACCTGCAGCGGCACCTGGTG
GGCGGGGACATGCTCGCCCTGGAGATCAGGCAGGGCTGCAACGGCGTGTTCAGCGCGCTG
GAACTCGCCGTCGGCTACCTGCAGGCCGATCCGAACCGCACCAGCGCGCTGATCGTCGCC
GCCGACAACTACGGAACGCCGCTGATCGACCGGTGGCGGATGGGCCCCGGCTTCATCGGC
GGCGATGCGCTCCCGCCCTGGTGCTGCAAGCGGCCCGGCTTCGCCCGGCTCTGCTCGGTG
GCCTCCAAGGGGCTGCCGGAGATCGAGTCGCTGCACCGCGGTGACGAGCCGTTGTTCCCG
CCGAGCATCACCCGGGGCCGTGCCACCGACTTCAGCGCCCGTATCGGCCAGCAGTTCGCC
ACCCGCAGCCCCGCCTTCGTTGCGATGGCCGAGATTCAGGACCATATGATGGACGTGGCC
GAGCGCGCCCTGGCCGGGGCCGGCATCGGGATGGCGGACGTCGCCCGCGTCTCCTTCATG
AACTATCACGCGAAGTGGTCGAGCAGTGCTGAATGGCGGCCTGGGGGGTGCCGCTGTCCC
GGTCCACGTGGGAATTCGGCCGGGAGATCGGCCACTTGCGGGGCCAGCGACCATCTGCTG
TCCATGGAACACATCGTACGGACCGGTGAGCTCGCCCCCGGCGACCACGTCCTGCAACTC
GCCACGGCCCCGGGCCTGGTGGTGTCCAGCGCCGTCCTTCAGGTTCTCGAATCGCCGGAC
TGGGACGAATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR013747 3-Oxoacyl-[acyl-carrier-protein (ACP)] synthase III C-terminal (Domain) PF08541 ACP_syn_III_C IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain) G3DSA:3.40.47.10 Thiolase-like_subgr IPR016039 Thiolase-like (Domain) SSF53901 Thiolase-like
SignalP	Bacteria, Gram-positive Eukaryota
TMHMM	No significant hit

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