| Category | 2.1 modification addition of extender units |
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| Product | putative acyl carrier protein |
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| Product (GenBank) | HbmJ |
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| Gene | |
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| Gene (GenBank) | hbmJ |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | |
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| Note (GenBank) | - similar to FkbJ (ACP in methoxymalonyl-ACP biosynthesis pathway)
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| Reference | - ACC
- Q49BD5
- PmId
[16085885] Insights into the biosynthesis of the benzoquinone ansamycins geldanamycin and herbimycin, obtained by gene sequencing and disruption. (Appl Environ Microbiol. , 2005) - comment
- herbimycin生合成系gene clusterのクローニングを行い、同じbenzoquinone ansamycin系のgeldanamycin のgene clusterと比較し、一部の遺伝子欠損株を作成してその生合成における関与を調べた文献。
HbmJ(276bp):ACP in methoxymalonyl-ACP biosynthesis pathway
hbmJ自体の機能実験は無し。
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| Related Reference | - ACC
- Q8KUG2
- NITE
- Ansam_00160
- PmId
[11960423] Identification of a set of genes involved in the formation of the substrate for the incorporation of the unusual "glycolate" chain extension unit in ansamitocin biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2002)
[11996558] Functional expression of genes involved in the biosynthesis of the novel polyketide chain extension unit, methoxymalonyl-acyl carrier protein, and engineered biosynthesis of 2-desmethyl-2-methoxy-6-deoxyerythronolide B. (J Am Chem Soc. , 2002) - comment
- Blast 13th, id63%, 6e-19
Actinosynnema pretiosum subsp. auranticum_asm14
Acyl carrier protein
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[PMID:11960423](2002)
CoAの代わりにSNACを使い13C-labelした2-hydroxymalonyl-SNAC or 2-methoxymalonyl-SNACを用いて取り込みを測定。側鎖前駆体isobutyrateと共にA. pretiostmz ATCC 31565に与えたが、ansamitocin P-3での同位体濃縮はなかった。したがって珍しいunitによる3つめの鎖伸長stepは、2-hydroxymalonyl-CoA or 2-methoxymalonyl-CoAを基質として使用しない。
珍しい伸長unitの合成に関連しそうなsubclusterにはACPであると予測されるORFが含まれた。これをコードするasm14を不活化するとansamitocin産生や新規化合物蓄積ができなかった。
よって鎖伸長反応の基質は、おそらく2-hydroxy- or 2-methoxymalonyl-ACPである。
また、asm15 mutantでは珍しい伸長unitの代わりにmalonate unitを取り込んだ10-desmethoxy-ansamitocin P-3が見られた。asm14 mutantではこの化合物が検出されなかったので、asm14によってコードされるACPはmalonateの異常な取り込みにも必要である。これは機能的に能力のある立体構造でPKSを維持するため、またはPKSのAT3にmalonateを実際に運搬するためと考えられる。
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[PMID:11996558](2002) abstract
S. lividansで、AT domainsのひとつがmethoxymalonateに特異的なATで置換されているerythromycin PKSのカセットとasm13-17を同時発現すると、予測された位置にmethoxymalonateが取り込まれた6-deoxyerythronolide Bの派生体が産生された。よって、asm13-17はmethoxymalonyl-ACP生合成に十分である。
また、methyltransferaseをコードするasm17を削除すると、そのhydroxy類似体ではなく6-deoxyerythronolide Bが得られたので、伸長unitのmethylationはその取り込みのために必要である。
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- ACC
- Q9KIE4
- NITE
- Asco_00100
- PmId
[15179529] Engineered biosynthesis of 16-membered macrolides that require methoxymalonyl-ACP precursors in Streptomyces fradiae. (Appl Microbiol Biotechnol. , 2004) - comment
- Blast 15th, id56%, 4e-17
Streptomyces hygroscopicus subsp. ascomyceticus_fkbJ
FkbJ
S.hygroscopicus由来fkbG-Kを導入することにより、S. fradiaeはmalonyl-CoA, methylmalonyl-CoA, ethylmalonyl-CoAに加えてmethoxymalonyl-ACPもPKS前駆体として利用できるようになることを、midecamycin PKS genes（最後から2番目の縮合ステップでmethoxymalonateを要求）の異種性発現産物で確認している。
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| Family/Domain | - FD
- IPR009081
- comment
- [IPR009081] Acyl carrier protein-like (Domain)
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Herb_00220
Location
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