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Griseo_00130 : CDS information

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Organism
StrainJP95
Entry nameGriseorhodin A
Contig
Start / Stop / Direction13,031 / 13,234 / + [in whole cluster]
13,031 / 13,234 / + [in contig]
Location13031..13234 [in whole cluster]
13031..13234 [in contig]
TypeCDS
Length204 bp (67 aa)
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Category4.5 electron carrier
Productputative ferredoxin
Product (GenBank)putative ferredoxin GrhO4
Gene
Gene (GenBank)grhO4
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[12323376] A gene cluster from a marine Streptomyces encoding the biosynthesis of the aromatic spiroketal polyketide griseorhodin A. (Chem Biol. , 2002)
comment
griseorhodin A生合成gene clusterのクローニング、シークエンス、異種性発現。

GrhO4: Ferredoxin

配列解析のみ。
grhO3によってコードされるCYP450と共にepoxidationに関与すると提唱されている。
Related Reference
ACC
B3XWK4
PmId
[18640605] Increase in pladienolide D production rate using a Streptomyces strain overexpressing a cytochrome P450 gene. (J Biosci Bioeng. , 2008)
comment
Blast 2nd, id65%, 2e-19
Streptomyces sp. A-1544_psmB
Ferredoxin

Streptomyces sp. A-1544にpladienolide B 16-hydroxylaseをエンコードするpsmAを過剰発現させると、pladienolide B より pladienolide Dへの変換が15倍高くなることを示している。また、この変換にはpsmAの下流のferredoxinをエンコードすると予想されるpsmBの産物が必要であることが示されている。

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selected fasta
>putative ferredoxin [putative ferredoxin GrhO4]
MHLSVDSDRCIGSAQCAVTVPSVFEQDEDGLSTVIPGREDGGGEPMVREAVRACPVQAIV
LKETEGV
selected fasta
>putative ferredoxin [putative ferredoxin GrhO4]
GTGCACCTCTCCGTCGACTCCGACCGCTGCATCGGCTCCGCCCAGTGCGCCGTCACCGTG
CCCTCCGTCTTCGAGCAGGACGAGGACGGGCTCTCCACCGTCATCCCCGGCCGCGAGGAC
GGCGGTGGCGAGCCGATGGTGCGCGAGGCCGTCCGGGCCTGCCCGGTGCAGGCCATCGTG
CTGAAGGAGACCGAGGGCGTATGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001080 3Fe-4S ferredoxin (Family)
[5-16] 2.00000075217457e-07 PR00352 [16-26] 2.00000075217457e-07 PR00352 [47-59] 2.00000075217457e-07 PR00352
PR00352   3FE4SFRDOXIN
IPR017896 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulpur binding domain (Domain)
[1-29] PS51379
PS51379   4FE4S_FER_2
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
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