| Category | 5.1 general function |
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| Product | putative hydroxylase |
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| Product (GenBank) | hypothetical protein |
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| Gene | |
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| Gene (GenBank) | idmH |
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| EC number | |
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| Keyword | |
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| Note | |
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| Note (GenBank) | |
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| Reference | - ACC
- C5HV10
- PmId
[19301315] Analysis of the indanomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces antibioticus NRRL 8167. (Chembiochem. , 2009)
[21491871] Identification of a tetraene-containing product of the indanomycin biosynthetic pathway. (Org Lett. , 2011) - comment
- [PMID: 19301315](2009)
indanomycin biosynthetic gene clusterに関する文献。
idmH(145a.a): cyclase
idmH自体の機能実験は無いが、SnoaL-like polyketide cyclaseと相同性を示すことから、cyclaseであるとしている。
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[PMID: 21491871](2011)
同じ著者らの続報。
idmHの不活化株で、linear tetraeneを所有しC-19がdehydration, enoylreductionされている新規産物を検出。この産物はIdmHで変換されず、idmJ不活化株でindanomycin生合成を回復しないことから、indanomycinの論理的中間体ではなく、代替産物だと考えられる。
この産物は、module skippingとmodule 3にあるdomainの反復使用の組み合わせにより形成されると提唱されている。同じ過程がindane ring形成に関与するとされるDiels-Alder cyclizationの適切なdienophileであろうpyrrolylenone中間体を産生すると述べている。
IdmHの機能は謎のまま。
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| Related Reference | - ACC
- Q1XDX7
- PmId
[16650858] Crystal structures of SnoaL2 and AclR: two putative hydroxylases in the biosynthesis of aromatic polyketide antibiotics. (J Mol Biol. , 2006) - comment
- Blast 85th, id39%, 1e-07
Streptomyces galilaeus_aclR
AclR protein
SnoaL2と同様に、AclRもvivoで1-hydroxylated anthracyclinesの産生に関連する。
SnoaL2とAclRの3次元構造測定。
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- ACC
- Q9RN64
- NITE
- Nogl_00150
- PmId
[16650858] Crystal structures of SnoaL2 and AclR: two putative hydroxylases in the biosynthesis of aromatic polyketide antibiotics. (J Mol Biol. , 2006)
[11683270] The entire nogalamycin biosynthetic gene cluster of Streptomyces nogalater: characterization of a 20-kb DNA region and generation of hybrid structures. (Mol Genet Genomics. , 2001)
[22633406] SnoaW/SnoaL2: a different two-component monooxygenase. (Chem Biol. , 2012)
[22633415] Discovery of a two-component monooxygenase SnoaW/SnoaL2 involved in nogalamycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2012) - comment
- Blast 142nd, id39%, 1e-06
Streptomyces nogalater_snoL
SnoL
[DoBISCUIT]C-1 hydroxylase_snoaL2
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[PMID: 16650858](2006) abstract
SnoaL2 and AclRの構造解析。
gene transfer experimentsから、SnoaL2がpolyketide鎖のC-1 hydroxylationを触媒することが示唆されている。
たぶんこの記述は引用。
↓元はこれ
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[PMID: 11683270](2001)
S. nogalater genomic DNA fragmentの配列解析と、異種性発現による産物解析。
nogalamycin生合成に関する20ORFsが明らかになった。
snoaL2: C1-hydroxylase
aklavinoneを蓄積するS.galilaeus mutant H063で、snoaL2を発現すると、1-OH-aklavinoneを形成。
よってSnoaL2はnogalamycin aglycone合成におけるC-1 hydroxylationを担うと考えられる。
このC1-OH基にnogalamineが付着する。
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[PMID: 22633415](2012)
Comment in [PMID: 22633406](2012)
snoaL2 または snoaWの不活化による産物解析から、1-OH化にはSnoaW/SnoaL2の両方が必要であることがわかった。
精製されたSnoaW/SnoaL2を使ったvitroでの実験、hydroperoxy intermediateの存在を確認するH2O2の検出から、
1) 非定型SDR酵素 SnoaWがmonoglycosylated anthracycline substrate(3',4'-demethoxy-nogalose-nogalamycinone) → dihydroquinoneへの還元をする
2) 酸素との反応のために基質を活性化し、hydroperoxy intermediateを形成する
3) hydroxylase SnoaL2によってプロトン化して最終産物(3',4'-demethoxy-nogalose-1-hydroxy-nogalamycinone)を得る
という新しいtwo-component monooxygenase systemを提唱している。
この反応はO2とNAD(P)Hの存在下で起こる。
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Indano_00110
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![[11-126] 5.09999999999998e-25 PF12680](../../img/H.gif "[11-126] 5.09999999999998e-25 PF12680"){kind=small}
