Merid_00040 : CDS information
Location
Organism | Streptomyces violaceusniger |
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Strain | DSM 4137 |
Entry name | Meridamycin |
Contig | DQ885223 |
Start / Stop / Direction | 51,363 / 86,177 / + [in whole cluster] 51,363 / 86,177 / + [in contig] |
Location | 51363..86177 [in whole cluster] 51363..86177 [in contig] |
Type | CDS |
Length | 34,815 bp (11,604 aa) |
Annotation
Category | 1.1 PKS |
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Product | polyketide synthase |
Product (GenBank) | MerC |
Gene | |
Gene (GenBank) | merC |
EC number | |
Keyword | |
Note | |
Note (GenBank) |
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Reference |
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Related Reference |
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PKS/NRPS Module
8 | malonyl-CoA | |
9 | malonyl-CoA | |
10 | methylmalonyl-CoA | |
11 | malonyl-CoA | |
12 | malonyl-CoA | |
13 | methylmalonyl-CoA | |
14 | malonyl-CoA |
Sequence
>polyketide synthase [MerC] MSSENVRPGIEGAGTRMSNDEKVLEYLKKLTADLRQTRQRLQDVEAKSREPIAIVGMSCR FPGGVSSPEDLWRLTESAVDAVSGFPTDRGWDLDGLYDPDPDRAGRSYAREGAFIPDAGH FDAGLFGISPREALAMDPQQRLLLEASWEALERAGIPTDSLKGSRTGVFAGLMSSDYVSR LPEVPDELEGYVGIGSAASVASGRVSYTLGLEGPAVTVDTACSSSLVALHLAVQALRSGE CSLALAGGVTVMATPGTFVQFSRQRGLAADGRCKAFAAGADGTGWGEGVGMLVVERLSDA ERNGHRVLAVVRGSAVNQDGASNGLTAPNGPSQQRVIRQALANARLSAVDVDAVEAHGTG TALGDPIEAQALLATYGQDRDGDRPLWLGSVKSNIGHTQAAAGVAGVIKMVMAMRHGVLP RTLHVDEPSPHVDWSAGAVELLLGQVAWPDVDRPRRAGVSAFGVSGTNAHVMLEQAPEVA EGSRDEGVALPAVPWVVSGVGEAAVRAQVARLREFVVGDPGLDPVDVGWSLASARAGLSH RAVVVGADRDELLGGLGSAVVGVPVVGGLGVLFAGQGSQRLGMGRGLYEAYPVFAAAWDE VCAQLDRYLDRSVGEVAWGDDVELIGETAYTQAGLFALEVALYRLIASWGVRADYLLGHS IGELASAYVAGVWSLEDAARVVAARGRLMQGLPSGGVMVAVAASEGEVLPLLADGVAVAA VNAPESVVVSGDEDAVQAVVDVLVGRGVRTRRLRVSHAFHSARMDGMLAEFGEVLDGVEF HAPSLPVVSNVSGVVAGEELCSPEYWVRHVRETVRFADGLATLRGLGVGSFLELGPDGTL TALADGDGVSVLQPGRPEPTAVMAALGGLYVRGVEVDWGAVFPGARRVDLPTYAFQRERF 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>polyketide synthase [MerC] ATGAGCAGCGAGAACGTCCGACCGGGAATCGAGGGGGCTGGCACGCGGATGTCGAACGAC GAAAAGGTACTCGAGTACCTCAAGAAGCTCACCGCCGATCTGCGCCAGACGCGTCAGCGC CTCCAGGACGTCGAGGCCAAGAGTCGCGAGCCGATCGCGATCGTCGGTATGAGCTGCCGT TTCCCGGGCGGGGTGAGCTCGCCGGAAGACCTGTGGCGGCTGACGGAGTCGGCGGTGGAC GCGGTCTCCGGCTTCCCCACCGACCGAGGCTGGGACCTGGACGGCCTGTACGACCCCGAC CCGGATCGCGCGGGCCGGTCGTACGCCCGCGAGGGCGCGTTCATCCCCGATGCCGGACAC TTCGACGCCGGCCTCTTCGGGATCTCGCCGCGTGAGGCGCTGGCGATGGATCCGCAGCAG CGGCTGCTGCTGGAGGCGTCGTGGGAGGCCCTGGAGCGTGCGGGTATCCCGACCGACTCC CTGAAGGGCAGCCGGACCGGTGTGTTCGCCGGACTGATGTCTTCCGACTATGTCTCGCGG CTGCCGGAGGTCCCGGACGAGCTCGAGGGATACGTCGGAATCGGAAGCGCGGCGAGTGTC GCCTCCGGCCGTGTGTCGTACACGCTGGGGCTCGAGGGTCCGGCGGTCACGGTGGATACG GCGTGTTCGTCGTCGTTGGTGGCGTTGCATCTGGCGGTGCAGGCGTTGCGGTCGGGTGAG TGTTCGCTGGCGCTTGCGGGCGGTGTCACGGTGATGGCGACACCTGGCACCTTTGTCCAG TTCTCCCGGCAGCGCGGCCTGGCCGCCGACGGCCGGTGCAAGGCGTTCGCGGCGGGCGCG GACGGCACCGGCTGGGGCGAGGGCGTCGGCATGCTGGTGGTGGAGCGGTTGTCCGATGCT GAGCGGAACGGTCACCGGGTGTTGGCGGTGGTGCGGGGTAGTGCGGTGAATCAGGATGGT GCGTCGAATGGTTTGACGGCGCCGAATGGTCCGTCGCAGCAGCGGGTGATTCGTCAGGCG TTGGCGAATGCGCGGTTGTCGGCGGTGGATGTGGATGCGGTGGAGGCGCACGGTACGGGT ACGGCCCTGGGCGATCCGATCGAGGCGCAGGCTCTGCTGGCCACCTATGGTCAGGATCGG GATGGGGACCGGCCGTTGTGGTTGGGTTCGGTGAAGTCGAATATTGGTCATACGCAGGCT GCGGCGGGTGTGGCTGGTGTGATCAAGATGGTGATGGCGATGCGGCACGGGGTATTGCCG CGGACGCTGCACGTGGATGAGCCCTCCCCGCATGTGGATTGGTCTGCCGGTGCGGTGGAG TTGTTGTTGGGGCAGGTGGCGTGGCCGGATGTGGATCGGCCGCGTCGGGCGGGTGTGTCG GCGTTCGGGGTGAGTGGGACGAACGCGCATGTGATGTTGGAGCAGGCGCCCGAGGTGGCG GAGGGGTCTCGGGACGAGGGTGTTGCGTTGCCTGCGGTGCCGTGGGTGGTGTCGGGTGTG GGTGAGGCGGCGGTGCGGGCTCAGGTGGCGCGGTTGCGGGAGTTTGTGGTGGGTGATCCT GGGTTGGATCCGGTGGATGTGGGGTGGTCGTTGGCGAGTGCGCGTGCCGGGTTGTCGCAT CGTGCGGTGGTGGTGGGTGCGGATCGTGATGAGTTGTTGGGTGGGTTGGGTTCGGCGGTG GTGGGTGTTCCGGTGGTGGGTGGACTGGGTGTGTTGTTTGCCGGTCAGGGGTCGCAGCGG TTGGGGATGGGGCGTGGGTTGTATGAGGCGTATCCGGTGTTCGCTGCGGCGTGGGATGAG GTGTGCGCTCAGCTGGACCGGTATCTGGATCGGTCGGTGGGTGAGGTGGCGTGGGGTGAT 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GCATTGCCTGCCTTGGCGTCGTGGCGGCGAGCGCGTCAGGAAGAGTCGGTCATCGACGCA TGGCGGTATCGGCTGACCTGGGCCCCGGTCGTGGGTCCTTCTTCGCAGCTCTCCGGCCTG TGGTTGGTGGTGGTCGAGCCGGACGAGGAGGAGACGGACGTTGTCGCCGCGCTGCGAGGC GCTGGTGCCGAGGTGCGTGTCGTAACGGTCGATGAGCTGGGTGCGGGTCCGGTTGCGGGT GTGGTGTCGTTGTTGTCGGTTGAGGCGACGGTGTCGCTGGTGCGGGGTCTTGTGGCTGCT GGGGGCGATGCGCCGTTGTGGTGTGTCACTCGGGGTGCGGTCTGTGTGGTGGACGGGGAT GTGGTGGATCCGTATGCGTCGGCTGTCTGGGGTCTGGGTCGTGTGATCGGGTTGGAGCAT CCGGACCGTTGGGGCGGGCTGATCGATCTGCCCACCGCATGGGATGAGCGAACCTCGGAT CTGTTGTGCTCGGTGCTTTCGGGCGCCACAGGTGAGGACCACACAGCGATCCGTGGCAAC GAGGTGTTGGGCTGTCGTCTGAGCCGGGCGACGACGTCGGGCCCGGGGCCGTCCACTGCC TGGGAAGCGTCGGGGACCGCGCTGATCACTGGTGGAACGGGTGCCCTGGGGAGCCATGTC GCCCGATGGCTCGCGGATACCGGCGTTGAAGAGATCGTGTTGACGAGCCGGCGAGGCGTG GACGCTCCTGGAGCACGGGAACTGGTCGCCGAACTGTCGGCCACGGGTGTATCGACCCGC GTCGTGGCGTGTGATGTGGCCGATCGGAACGCGGTTGCGGAGCTGATCGGGACCATTCCG GATCTTCGCGTGGTTGTGCACGCCGCGGGAGTACCGAGCTGGGGCCCGTTGAGCGCCCTA ACCGCGCAGGACCTTCAGGATGGAATGCGGGCCAAGGTCGCGGGAGCCATCCACCTGGAT 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Feature
BLASTP Database:UniProtKB:2011_09 |
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IPR001128 Cytochrome P450 (Family)
IPR001227 Acyl transferase domain (Domain)
IPR002198 Short-chain dehydrogenase/reductase SDR (Family)
IPR002397 Cytochrome P450, B-class (Family)
IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM)
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
IPR011032 GroES-like (Domain)
IPR013154 Alcohol dehydrogenase GroES-like (Domain)
IPR013968 Polyketide synthase, KR (Domain)
IPR014030 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (Domain)
IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR015083 Polyketide synthase, docking (Domain)
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
IPR020841 Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase domain (Domain)
IPR020842 Polyketide synthase/Fatty acid synthase, KR (Domain)
IPR020843 Polyketide synthase, enoylreductase (Domain)
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SignalP | No significant hit |
TMHMM | No significant hit |