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Ncarz_00150 : CDS information

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Organism
StrainATCC 15944
Entry nameNeocarzinostatin
Contig
Start / Stop / Direction31,918 / 31,475 / - [in whole cluster]
31,918 / 31,475 / - [in contig]
Locationcomplement(31475..31918) [in whole cluster]
complement(31475..31918) [in contig]
TypeCDS
Length444 bp (147 aa)
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Category3.4 other modification
Productneocarzinostatin apoprotein
Product (GenBank)neocarzinostatin apoprotein
GenencsA
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[15797213] The neocarzinostatin biosynthetic gene cluster from Streptomyces carzinostaticus ATCC 15944 involving two iterative type I polyketide synthases. (Chem Biol. , 2005)
comment
[[PMID:15797213]
Neocarzinostatin生合成遺伝子クラスターの報告

ncsA: Apo-protein
resistance proteinをエンコードしていると推測している。
Related Reference
ACC
P0A3R9
PmId
[39562] Neocarzinostatin: spectral characterization and separation of a non-protein chromophore. (Biochem Biophys Res Commun. , 1979)
[6448635] Stabilization of neocarzinostatin nonprotein chromophore activity by interaction with apoprotein and with HeLa cells. (Biochemistry. , 1980)
[6445563] Roles of chromophore and apo-protein in neocarzinostatin action. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1980)
[2967272] An antitumor polypeptide antibiotic neocarzinostatin: the mode of apo-protein--chromophore interaction. (J Antibiot (Tokyo). , 1988)
comment
Streptomyces carzinostaticus_ncsA
neocarzinostatin

[PMID:39562]
非タンパク質性の低分子であるクロモフォア(NCS-Chr）とタンパク質部分であるアポネオカルチノスタチン(Apo-NCS)とが1:1のモル比で非共有結合的に結合している構造を有していた。

[PMID:6448635]
apo-NCSが不安定なNCS-Chrを安定化し、またキャリヤとしての役割を担うことを明らかにした。

[PMID:2967272]
NCSの生理活性の本体はNCS-Chrにあることを示した。

[PMID:2967272]
NCS-chrはapo-NCSのC末端43peptide residueに結合しantimicrobial activityを示した。

[PMID:entryなし](1999)
Enediyne Biosynthesis and Self-Resistance:A Progress Report

クロモフォアプロテインenediynesはアポプロテインがhistoneを切断しDNAを暴露させること、その後chromophoreによりDNAを破壊するというtargeted delivery "two-pronged"attackを経由してin vivoで実際に機能しているかもしれないと推測。
また、Apo-NCSが恒常的に発現しており、NCS-Chrの産生に依存する事から、NCS-Chrは捕捉されており、Apo-NCSは極端な細胞毒性をもつ天然化合物に対してself-resistanceの機能を持つ可能性が推測された。self-resistanceに関して実験的な証明はしていない。放射性同位体の研究から、NCSのbicyclo[7.3.0]enediyne coreは脂肪酸ではなくtype I polyketide originであると推測された。
ACC
Q06110
PmId
[19845765] Disruption of cagA, the apoprotein gene of chromoprotein antibiotic C-1027, eliminates holo-antibiotic production, but not the cytotoxic chromophore. (FEMS Microbiol Lett. , 2009)
comment
Streptomyces globisporus_cagA
Antitumor antibiotic C-1027 apoprotein
C-1027生合成遺伝子。

apoprotein gene cagA欠損株はantibacterial assayによって検出されるC-1027 holo-antibiotic 生産ができなかった。野生株でのcagA過剰発現はC-1027 productionが増加した。
ESI- MSやESI-MS/MSによる解析は、cagA-disrupted mutantでC-1027 enediyne chromophoreやそのaromatized productの生産を検出した。リアルタイム逆転写PCRの結果はこれと一致しており、positive regulator sgcR3,structural genes sgcA1,sgcC4,sgcD6,sgcEの転写は野生株や相補株と同様cagA-disrupted mutant株で検出された。
C-1027のapoproteinはenediyne chromophoreのself-resistance mechanismに必須ではない事を初めて示した。

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selected fasta
>neocarzinostatin apoprotein [neocarzinostatin apoprotein]
MVPISIIRNRVAKVAVGSAAVLGLAVGFQTPAVAAAPTATVTPSSGLSDGTVVKVAGAGL
QAGTAYDVGQCAWVDTGVLACNPADFSSVTADANGSASTSLTVRRSFEGFLFDGTRWGTV
DCTTAACQVGLSDAAGNGPEGVAISFN
selected fasta
>neocarzinostatin apoprotein [neocarzinostatin apoprotein]
GTGGTCCCCATTTCCATCATCAGGAATCGAGTAGCGAAGGTCGCCGTCGGCTCGGCGGCG
GTGCTGGGGCTCGCCGTAGGGTTCCAGACCCCGGCCGTGGCCGCGGCGCCGACGGCTACG
GTGACTCCGTCGTCCGGTCTGTCCGACGGCACCGTGGTCAAGGTCGCCGGCGCGGGTCTC
CAGGCCGGAACGGCCTACGACGTCGGGCAGTGCGCGTGGGTGGACACCGGTGTTCTCGCG
TGCAACCCGGCGGACTTCTCCTCCGTGACCGCGGACGCCAACGGCTCCGCGAGCACGTCG
CTGACGGTGCGCCGCTCCTTCGAGGGCTTCCTCTTCGACGGCACCCGCTGGGGCACCGTG
GACTGCACCACCGCGGCCTGCCAGGTCGGCCTCTCGGACGCTGCGGGCAACGGCCCGGAG
GGTGTGGCGATCTCCTTCAACTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR002186 Neocarzinostatin-type antitumour, antibiotic chromoprotein (Family)
[38-147] 1.4e-49 PF00960
PF00960   Neocarzinostat
[36-55] 1.8e-35 PR01885 [59-74] 1.8e-35 PR01885 [90-107] 1.8e-35 PR01885 [114-130] 1.8e-35 PR01885
PR01885   MACROMOMYCIN
[44-147] 7e-53 PD012709
PD012709   NCZS_STRML_P0A3S0;
[35-147] 2.2e-53 G3DSA:2.60.40.230
G3DSA:2.60.40.230   no description
[35-147] 4e-51 SSF49319
SSF49319   Actinoxanthin-like
SignalP
[1-35] 0.986 Signal
Eukaryota   
[1-35] 1 Signal
Bacteria, Gram-positive   
[1-34] 1 Signal
Bacteria, Gram-negative   
TMHMM No significant hit
Ncarz_00140 Ncarz_00140   Ncarz_00160 Ncarz_00160
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