Ncarz_00240 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces carzinostaticus
Strain	ATCC 15944
Entry name	Neocarzinostatin
Contig	AY117439
Start / Stop / Direction	43,345 / 44,670 / + [in whole cluster] 43,345 / 44,670 / + [in contig]
Location	43345..44670 [in whole cluster] 43345..44670 [in contig]
Type	CDS
Length	1,326 bp (441 aa)

Annotation

Category	3.3 modification reduction
Product	putative monooxygenase
Product (GenBank)	hydroxylase
Gene	orf34
Gene (GenBank)
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q84HB0 PmId [15797213] The neocarzinostatin biosynthetic gene cluster from Streptomyces carzinostaticus ATCC 15944 involving two iterative type I polyketide synthases. (Chem Biol. , 2005) comment Neocarzinostatin生合成遺伝子クラスターの報告。 orf34: Oxygenase/Hydroxylase このORFについて機能解析はされていない。
Related Reference	ACC B5M9L6 NITE Lasal_00200 PmId [22506807] Sequential enzymatic epoxidation involved in polyether lasalocid biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2012) [23796908] Biosynthetic machinery of ionophore polyether lasalocid: enzymatic construction of polyether skeleton. (Curr Opin Chem Biol. , 2013) comment Blast id37% Streptomyces lasaliensis ATCC 35851_lsd18 Putative epoxidase GenBank,UniprotではATCC31180と登録されているが、clusterの報告論文[PMID:19129623]ではATCC35851であるとされている。 --- [PMID:22506807](2012) Lsd18がprelasalocidのbisepoxylasalocidへのsequential epoxydationに関与するようだ。酵素学的エポキシ化反応の解析。 --- [PMID:23796908](2013) Lsd18,Lsd19について続報有り。abstract only.
	ACC B5M9L6 NITE Lasal2_00240 PmId [19025863] Analysis of specific mutants in the lasalocid gene cluster: evidence for enzymatic catalysis of a disfavoured polyether ring closure. (Chembiochem. , 2008) comment Blast id37% Streptomyces lasaliensis NRRL3382R(ATCC 31180)_lasC Putative epoxidase S. lasaliensis ATCC31180におけるLasalocid生合成gene clusterの報告。 lasC deletion mutant作製し機能推定している。 flavin-linked epoxidaseをコードしていると予測されているlasCを欠損すると、lasalocidとiso-lasalocid両方の生産ができなかったことから、full-length polyketide productの放出より前にポリエーテル環の酸化的環化がPKSで行われていると思われる。また、相補実験の結果から、PKS結合dieneがLasC, LasBの基質であると推測された。
	ACC Q846W9 NITE Monen_00220 PmId [12940979] Analysis of the biosynthetic gene cluster for the polyether antibiotic monensin in Streptomyces cinnamonensis and evidence for the role of monB and monC genes in oxidative cyclization. (Mol Microbiol. , 2003) comment Blast id34% Streptomyces cinnamonensis_monC1 Monensin epoxidase Streptomyces cinnamonensisのmonensin biosynthetic gene clusterにおけるmonB と monCの機能について調べた文献。 monCI について、S. coelicolorにおけるHeterologous expressionを行ったところ、linaloolをlinalool oxideにepoxidizeする能力が10-20倍に増加することを確認している。

Sequence

>putative monooxygenase [hydroxylase]
MSGYVGDRAVVLGGSIAGSLAARVLADAYREVTVVDRDDLTDRAEPRHATPQGHHIHALL
ARGQQILDEIFPGFTDELVALGVPTGDFGTSLTWYFKGIAIKKAETGLTCVAAGRPLLEN
RIRHRIRRLPNVTLREQTDVLGLVTSPNRRTVTGVRVQSRSHNSAEEVLAADLVVDTTGR
GTRTPRWLAELGYPQVLEERVKMDLTYTTCHFRGPLPFDPIGEDIALLPVATPAMRRGAI
FARMPDRYSLSLTGVLGDRPPTDHEGFLSYAESLPIPEVYKALRDAEPLGPPTSFHFPAS
IRRRYERQARHLGGLLVMGDAACVFNPVYGQGMSVAAIQSLVLRDHLLQGPPEPRAFFRD
LAGAIDGPWDMSAGADLGFPEVQGRRTAKTRLGNAYVTRLQTAAAADRELSKAFLRAAGL
VDPPQALMRPRLISRVLRGAR

>putative monooxygenase [hydroxylase]
ATGAGTGGCTATGTCGGAGATCGTGCCGTGGTCCTGGGAGGCAGCATCGCAGGGTCCCTG
GCGGCACGCGTACTCGCCGACGCCTACCGCGAGGTGACCGTGGTCGACCGGGACGACCTC
ACCGACCGTGCCGAGCCGCGACACGCCACCCCCCAGGGACACCACATCCACGCGCTCCTC
GCCCGTGGTCAGCAGATCCTCGATGAGATCTTCCCCGGCTTCACCGACGAACTGGTCGCC
CTCGGAGTACCCACCGGTGACTTCGGCACCAGCCTGACCTGGTATTTCAAGGGAATCGCG
ATCAAGAAGGCAGAGACGGGGCTGACGTGTGTGGCGGCCGGCCGGCCGCTGCTCGAGAAC
CGAATCCGGCACCGGATCCGGCGCCTGCCCAACGTCACGCTGCGGGAGCAGACGGACGTA
CTGGGGCTCGTGACATCACCGAACCGCCGCACCGTGACCGGGGTCCGGGTGCAGAGCCGT
TCGCACAACTCCGCTGAGGAGGTGCTCGCCGCGGACCTCGTGGTCGACACGACCGGGCGC
GGCACGCGGACCCCGCGATGGCTGGCAGAGCTCGGCTATCCGCAAGTCCTTGAGGAACGG
GTGAAGATGGACCTGACCTATACGACGTGCCACTTCCGCGGTCCTCTGCCGTTCGACCCG
ATCGGCGAAGACATCGCCCTTCTGCCAGTCGCCACCCCGGCCATGCGGCGAGGGGCGATC
TTCGCCCGGATGCCCGACCGCTACTCACTGTCGCTCACAGGGGTCCTCGGCGACCGGCCC
CCCACCGACCACGAGGGATTTCTCTCCTACGCCGAGTCCCTGCCGATTCCAGAGGTGTAC
AAGGCCCTGCGGGACGCGGAGCCGCTCGGTCCTCCCACGTCGTTCCACTTCCCGGCCAGC
ATCCGCCGCCGCTACGAACGGCAGGCGCGCCATCTGGGGGGACTGCTCGTGATGGGCGAT
GCGGCCTGCGTCTTCAACCCGGTGTACGGGCAGGGCATGTCGGTGGCCGCGATCCAGTCG
CTCGTACTGCGTGACCACCTGCTCCAGGGGCCGCCCGAGCCGCGCGCCTTCTTCCGTGAT
CTCGCCGGCGCTATCGACGGGCCCTGGGACATGTCCGCGGGAGCGGACCTCGGTTTTCCG
GAGGTTCAGGGGCGGCGAACGGCGAAGACTCGGCTCGGCAACGCCTACGTCACACGCCTT
CAGACCGCTGCGGCCGCCGACAGGGAGCTGTCCAAGGCCTTCCTGCGCGCCGCCGGGCTC
GTCGACCCGCCCCAGGCGCTCATGCGACCGCGGCTGATCTCTCGCGTCCTGCGCGGCGCT
CGGTAG

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-positive
TMHMM	No significant hit

Ncarz_00230 Ncarz_00250