Oxzol_00110 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces albus
Strain	JA3453
Entry name	Oxazolomycin
Contig	EF552687
Start / Stop / Direction	17,894 / 17,613 / - [in whole cluster] 17,894 / 17,613 / - [in contig]
Location	complement(17613..17894) [in whole cluster] complement(17613..17894) [in contig]
Type	CDS
Length	282 bp (93 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative acyl carrier protein
Product (GenBank)	acyl carrier protein
Gene
Gene (GenBank)	ozmE
EC number
Keyword	methoxymalonyl-ACP
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC B2WW39 PmId [16707707] Utilization of the methoxymalonyl-acyl carrier protein biosynthesis locus for cloning the oxazolomycin biosynthetic gene cluster from Streptomyces albus JA3453. (J Bacteriol. , 2006) [20406823] Oxazolomycin biosynthesis in Streptomyces albus JA3453 featuring an "acyltransferase-less" type I polyketide synthase that incorporates two distinct extender units. (J Biol Chem. , 2010) comment [PMID:16707707] methoxymalonyl-ACP生合成遺伝子の同定とクローニング OzmB, OzmC, OzmD, OzmE, OzmF, OzmGが、methoxymalonyl-ACP生合成遺伝子であることを同定し、これらがoxazolomycin productionに必須であることを示した。 OzmEに関して機能解析はされていない。 [PMID:20406823] oxazolomycin生合成遺伝子クラスターの報告。 ozmE: ACP methoxymalonyl-ACP生合成経路は、OzmB(bifunctional glyceryl transferase/phosphatase)が捕捉され、1,3-bisphospho-D-glycerateが脱リン化される。結果として、 glyceryl moietyがOzmE (ACP)にtransferされ、glyceryl-ACPを形成すると仮説が立てられている(FIGURE 3.)。機能解析はされていない。
Related Reference	ACC Q8KUG2 NITE Ansam_00160 PmId [11960423] Identification of a set of genes involved in the formation of the substrate for the incorporation of the unusual "glycolate" chain extension unit in ansamitocin biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2002) [11996558] Functional expression of genes involved in the biosynthesis of the novel polyketide chain extension unit, methoxymalonyl-acyl carrier protein, and engineered biosynthesis of 2-desmethyl-2-methoxy-6-deoxyerythronolide B. (J Am Chem Soc. , 2002) comment Actinosynnema pretiosum subsp. auranticum Acyl carrier protein(asm14) --- [PMID:11960423](2002) CoAの代わりにSNACを使い13C-labelした2-hydroxymalonyl-SNAC or 2-methoxymalonyl-SNACを用いて取り込みを測定。側鎖前駆体isobutyrateと共にA. pretiostmz ATCC 31565に与えたが、ansamitocin P-3での同位体濃縮はなかった。したがって珍しいunitによる3つめの鎖伸長stepは、2-hydroxymalonyl-CoA or 2-methoxymalonyl-CoAを基質として使用しない。珍しい伸長unitの合成に関連しそうなsubclusterにはACPであると予測されるORFが含まれた。これをコードするasm14を不活化するとansamitocin産生や新規化合物蓄積ができなかった。よって鎖伸長反応の基質は、おそらく2-hydroxy- or 2-methoxymalonyl-ACPである。また、asm15 mutantでは珍しい伸長unitの代わりにmalonate unitを取り込んだ10-desmethoxy-ansamitocin P-3が見られた。asm14 mutantではこの化合物が検出されなかったので、asm14によってコードされるACPはmalonateの異常な取り込みにも必要である。これは機能的に能力のある立体構造でPKSを維持するため、またはPKSのAT3にmalonateを実際に運搬するためと考えられる。 --- [PMID:11996558](2002) abstract S. lividansで、AT domainsのひとつがmethoxymalonateに特異的なATで置換されているerythromycin PKSのカセットとasm13-17を同時発現すると、予測された位置にmethoxymalonateが取り込まれた6-deoxyerythronolide Bの派生体が産生された。よって、asm13-17はmethoxymalonyl-ACP生合成に十分である。また、methyltransferaseをコードするasm17を削除すると、そのhydroxy類似体ではなく6-deoxyerythronolide Bが得られたので、伸長unitのmethylationはその取り込みのために必要である。
Family/Domain	FD IPR009081 comment [IPR009081] Acyl carrier protein-like (Domain)

Sequence

>putative acyl carrier protein [acyl carrier protein]
MSEHTTTPPLSAEHVRTELKRFLEERTKTDWAADTDLFATGGVSSLFAMELVVHVEKTFG
IAVEGPDLRIDNFRTVDAMTALVLRLAEAGSGE

>putative acyl carrier protein [acyl carrier protein]
ATGAGCGAGCACACCACCACCCCTCCCCTGTCGGCGGAGCACGTGCGAACCGAGCTGAAG
CGGTTCCTGGAGGAGCGCACCAAGACCGACTGGGCGGCGGACACCGACCTCTTCGCGACC
GGCGGTGTCTCCTCCCTCTTCGCGATGGAGCTGGTGGTCCACGTCGAGAAGACCTTCGGT
ATCGCCGTCGAGGGACCCGACCTGCGCATCGACAACTTCCGTACGGTGGACGCCATGACC
GCTCTGGTGCTCCGGCTCGCCGAGGCCGGCTCCGGTGAGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain) G3DSA:1.10.1200.10 ACP_like SSF47336 ACP_like PF00550 PP-binding PS50075 ACP_DOMAIN
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Oxzol_00100 Oxzol_00120