Pact_00110 Pact_00110   Pact_00130 Pact_00130

Pact_00120 : CDS information

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Organism
StrainATCC 27456 (=NBRC 13433)
Entry namePactamycin
Contig
Start / Stop / Direction16,106 / 16,390 / + [in whole cluster]
16,106 / 16,390 / + [in contig]
Location16106..16390 [in whole cluster]
16106..16390 [in contig]
TypeCDS
Length285 bp (94 aa)
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Category5.4 hypothetical protein
Producthypothetical protein
Product (GenBank)acyl carrier protein
GenepctK
ptmI
Gene (GenBank)pctK
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[17827660] Cloning of the pactamycin biosynthetic gene cluster and characterization of a crucial glycosyltransferase prior to a unique cyclopentane ring formation. (J Antibiot (Tokyo). , 2007)
[19670201] Deciphering pactamycin biosynthesis and engineered production of new pactamycin analogues. (Chembiochem. , 2009)
comment
[PMID:17827660]
Pactamycin生合成遺伝子クラスターの報告。

PctK: discrete ACP

相同性より機能付けされている。
このORFの機能解析はされていない。

PctKは6-methylsalicylic acid (6-MSA)を形成に関与すると推測しており、その生合成経路は2つの仮説を立てている。
・PctK(discrete ACP)へacetyl-CoAと共にPctT(ketoacyl-ACP synthase)が運ばれpriming reactionが起こりPctS(iterative type I PKS)により6-MSAを合成。
・PctSがacetyl-CoAとself-primingし6-MSAを合成。産生した6-MSAはPctKと一緒にPctTにより活性化し6-MSA-ACPを合成。


[PMID:19670201]
S.pactum ATCC27456のPactamycin生合成遺伝子クラスターの報告。

PtmI: putative acyl carrier protein

PtmIの機能解析はされていない。

NBRC株にて6-MSA合成に関与するとされたPctK,T,Mに相当するORF PtmI,R,Kは6-MSAの合成ではなく3-aminoacetophenoneの側鎖形成に関与すると推測している。これに関して本文中記述なし。

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selected fasta
>hypothetical protein [acyl carrier protein]
MDRAGLIRELHEIAAGMTKSDQHRQVPAEGAGDASLVDQYGFSSLDALEYLLILEEKFDV
VFEDEDLTEETLFSIEGLATYILDQKVGETTSSS
selected fasta
>hypothetical protein [acyl carrier protein]
ATGGACCGCGCCGGGCTCATACGAGAACTGCACGAGATCGCAGCCGGGATGACCAAGTCG
GACCAGCACCGGCAGGTGCCCGCGGAAGGGGCGGGCGACGCCAGCCTGGTGGACCAGTAC
GGGTTCAGCTCCCTGGACGCGCTGGAGTACCTGCTGATCCTGGAGGAGAAGTTCGACGTC
GTCTTCGAGGACGAGGACCTCACCGAGGAGACGCTGTTCTCCATCGAGGGCCTCGCCACG
TACATCCTCGATCAGAAGGTCGGCGAAACCACCTCCTCTTCGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
[9-81] 3.7e-05 PF00550
PF00550   PP-binding
[27-86] 4.70000000000001e-12 G3DSA:1.10.1200.10
G3DSA:1.10.1200.10   ACP_like
[2-86] 3.39999972437717e-10 SSF47336
SSF47336   ACP_like
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Pact_00110 Pact_00110   Pact_00130 Pact_00130
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