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Pyrlo_00200 : CDS information

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Organism
StrainATCC 31673 (=NBRC 14294)
Entry namePyrrolomycin
Contig
Start / Stop / Direction26,400 / 27,617 / + [in whole cluster]
26,400 / 27,617 / + [in contig]
Location26400..27617 [in whole cluster]
26400..27617 [in contig]
TypeCDS
Length1,218 bp (405 aa)
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Category3.3 modification reduction
Productputative cytochrome P450
Product (GenBank)cytochrome P450
Gene
Gene (GenBank)pyr20
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[17158935] Cloning and characterization of the pyrrolomycin biosynthetic gene clusters from Actinosporangium vitaminophilum ATCC 31673 and Streptomyces sp. strain UC 11065. (Antimicrob Agents Chemother. , 2007)
comment
pyrrolomycin biosynthetic gene clustersに関する文献。

pyr20(405 a.a.): cytochrome P450

pyr20自体の機能実験は行われていないが、相同性よりcytochrome P450の機能を持つと予測している。
aryl O-methyl基の酸化的環化を行い、dioxapyrrolomycinのmethylenedioxy基の生産に関与する可能性が記されている。
Related Reference
ACC
P33271
PmId
[1732208] Characterization of Saccharopolyspora erythraea cytochrome P-450 genes and enzymes, including 6-deoxyerythronolide B hydroxylase. (J Bacteriol. , 1992)
comment
<Cytochrome P450 107B1, Saccharopolyspora erythraea, BLAST 65, id=40%>

orf405に相当するentry.

catalytically active cytochrome P-450 fractionより、majorなものとminorな種類の P-450 を精製し、各々の遺伝子orf405(major) とeryF(minor)の遺伝子をクローニングしている。また、各々の遺伝子をE. coliで発現させて活性を調べ、EryFは6-deoxyerythronolide B hydroxylase activityを持つのに対して、Orf405は6-deoxyerythronolide B hydroxylase activityを持たないこと、EryF, Orf405共に弱いながらも7-ethoxycoumarinのO-dealkylation活性を持つことが示されている。
ACC
Q9KHJ7
NITE
Enter_00180
PmId
[11137817] Cloning, sequencing and analysis of the enterocin biosynthesis gene cluster from the marine isolate 'Streptomyces maritimus': evidence for the derailment of an aromatic polyketide synthase. (Chem Biol. , 2000)
[17704772] Enzymatic total synthesis of enterocin polyketides. (Nat Chem Biol. , 2007)
comment
Blast 43rd, id41%, 2e-65
Streptomyces maritimus_encR
Putative p450 monooxygenase EncR

---
[PMID: 11137817](2000)
enterocin と wailupemycinsの生合成をコードするgene clusterの同定。

EncR: Cytochrome P-450 hydroxylase

monooxygenase inhibitorであるancymidol によって、S.maritimusでのenterocin産生は減り、5-deoxyenterocinが蓄積する。

EncRをクローニング、maltose-binding-protein(MBP) affinity tagを付けて精製。反応産物のLC-MS解析から、MBP-EncRは 5-deoxyenterocin → enterocin への変換をすることを実証。

またMBP-EncRはancymidol によって抑制されたので、in vivoでのancymidol による結果が、CYP450 EncR抑制のせいであることも確認された。

---
[PMID: 17704772](2007)
enc genesを異種性に発現して得たタンパクを用いて、enterocinをin vitroに合成している。

EncA/B, EncC, EncD, EncN, EncM, EncK, EncR, SgFabD + benzoic acid, ATP/Mg2+, NADPH, SAM, ferredoxin, ferredoxin-NADP+ reductase, catalaseでenterocin, wailupemycin F and Gの産生あり。

他のCYP450でも報告があるようにEncRはSAMで抑制されることがさらなる解析から明らかになったので、5-deoxyenterocinを含むnonpolar reaction productsを酸性条件下で抽出し、これがEncR-catalyzed reactionを受けてenterocinが得られることを確認した。

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selected fasta
>putative cytochrome P450 [cytochrome P450]
MVEKMDQHQGAISFPFPARSHLEFPPQFAEAHAKCPVSRVKLPHGQEAWLATGHDVVRKV
LVDPNFSRALAAEHENRRLTPAAILNSSLIGLDPPDHTRLRTLASRAFTARRVERLRPHI
VAIIDDLLTAMGKHEGPVDLLEHFMRPLPALVISEMMGVPEQDIERFLEWSAEAIAGPSN
PEAAAAGYQSLIEFFGKLIEDKRRAPGDDLLSALIAAHDEQDKLSDDEMVALSVLLLVAG
HEAITTVFSWFVIILTTQYPEHWKHLQSHPEDIAPTVEELLRVVPRTKIGGGFPRIARED
TELAGVRIKAGEAVIPAMDAANRDPVVYGEDPERLDFNRSENPHLGFGAGVHFCIGAPLA
RLQMQEGMRLLLKHFPTLRVAVPVEELKLTPETAMRILLSVPVTW
selected fasta
>putative cytochrome P450 [cytochrome P450]
ATGGTGGAGAAGATGGACCAACACCAAGGCGCGATCTCCTTCCCCTTCCCGGCACGCAGT
CACCTCGAGTTCCCCCCGCAGTTCGCGGAGGCACACGCCAAGTGCCCGGTCAGCCGGGTC
AAGCTCCCGCACGGCCAGGAGGCGTGGCTGGCCACAGGACACGACGTGGTGCGCAAGGTC
CTCGTCGATCCCAACTTCAGTCGGGCCCTCGCAGCCGAGCACGAGAACCGGCGACTCACG
CCGGCTGCGATCCTGAACTCCTCCCTGATCGGGCTCGACCCGCCCGACCACACCCGGCTC
CGCACCCTGGCCAGCCGCGCCTTCACCGCCCGCAGGGTGGAGCGGCTGCGTCCGCACATC
GTCGCCATCATCGACGACCTGCTGACCGCGATGGGGAAGCACGAGGGCCCCGTCGATCTG
CTCGAGCACTTCATGCGGCCCCTGCCCGCGCTGGTCATCAGCGAGATGATGGGCGTTCCC
GAGCAGGACATCGAGCGGTTCCTGGAGTGGTCCGCCGAGGCCATCGCCGGGCCGAGCAAC
CCGGAGGCGGCCGCGGCCGGTTACCAGAGCCTGATCGAGTTCTTCGGGAAGCTCATCGAG
GACAAGCGGAGGGCCCCCGGGGACGACCTGCTCAGCGCACTGATCGCGGCCCACGACGAA
CAGGACAAGCTCAGCGACGACGAGATGGTGGCGCTCAGCGTGCTGCTGCTCGTCGCCGGG
CACGAGGCCATCACCACGGTCTTCAGTTGGTTCGTCATCATCCTGACCACCCAGTACCCC
GAGCACTGGAAGCACCTCCAGAGCCACCCCGAGGACATCGCGCCCACGGTGGAGGAACTG
TTGCGGGTGGTTCCCCGAACCAAGATCGGGGGCGGTTTCCCACGGATCGCCAGGGAGGAC
ACCGAGCTGGCGGGGGTGCGGATCAAGGCCGGGGAGGCGGTGATCCCGGCGATGGACGCG
GCGAACCGGGACCCGGTGGTCTACGGCGAGGACCCGGAGCGCCTGGACTTCAACCGCTCG
GAGAACCCGCACCTCGGGTTCGGCGCGGGGGTGCACTTCTGCATCGGCGCCCCGCTCGCA
AGGCTCCAGATGCAGGAGGGCATGCGACTGCTGTTGAAGCACTTCCCCACCCTGCGGGTG
GCGGTTCCGGTCGAGGAACTCAAGCTCACCCCGGAGACGGCGATGCGCATCCTGCTGAGC
GTCCCGGTGACCTGGTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001128 Cytochrome P450 (Family)
[239-256] 2.19999900980708e-06 PR00385 [275-286] 2.19999900980708e-06 PR00385 [345-354] 2.19999900980708e-06 PR00385 [354-365] 2.19999900980708e-06 PR00385
PR00385   P450
[4-405] 3.60002015031011e-91 SSF48264
SSF48264   Cytochrome_P450
[17-405] 2.70000000000002e-101 G3DSA:1.10.630.10
G3DSA:1.10.630.10   Cyt_P450
[201-267] 2.9e-05 PF00067 [276-376] 1.8e-15 PF00067
PF00067   p450
IPR002397 Cytochrome P450, B-class (Family)
[92-103] 5.50001754266469e-50 PR00359 [139-155] 5.50001754266469e-50 PR00359 [156-171] 5.50001754266469e-50 PR00359 [193-215] 5.50001754266469e-50 PR00359 [275-286] 5.50001754266469e-50 PR00359 [295-322] 5.50001754266469e-50 PR00359 [345-354] 5.50001754266469e-50 PR00359 [354-365] 5.50001754266469e-50 PR00359
PR00359   BP450
IPR017972 Cytochrome P450, conserved site (Conserved_site)
[347-356] PS00086
PS00086   CYTOCHROME_P450
SignalP
[1-31] 0.208 Signal
Bacteria, Gram-positive   
TMHMM No significant hit
Pyrlo_00190 Pyrlo_00190   Pyrlo_00210 Pyrlo_00210
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