Sch475_00300 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	SCC-2136
Entry name	Sch 47554
Contig	AJ628018
Start / Stop / Direction	43,258 / 42,086 / - [in whole cluster] 43,258 / 42,086 / - [in contig]
Location	complement(42086..43258) [in whole cluster] complement(42086..43258) [in contig]
Type	CDS
Length	1,173 bp (390 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	putative glycosyltransferase
Product (GenBank)	putative O-glycosyltransferase
Gene
Gene (GenBank)	schS9
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q2HR28 PmId [17085966] Angucyclines Sch 47554 and Sch 47555 from Streptomyces sp. SCC-2136: cloning, sequencing, and characterization. (Mol Cells. , 2006) comment angucyclines Sch 47554 and Sch 47555の生合成に関連したentire gene clusterのクローニング、シークエンス、配列解析からの特徴づけ。 SchS9(390aa): O-glycosyltransferase UrdGT1b/cに似ていることから、Sch47555におけるC-9でのD-(←L-の間違いと思われる)amicetosyl transferを担う候補であるが、SchS9 and SchS10の割り当てはさらなる実験での検証を必要とする。glycosylateの順番も解明されていない。
Related Reference	ACC Q9RP99 NITE Urd_00060 PmId [10662691] Function of glycosyltransferase genes involved in urdamycin A biosynthesis. (Chem Biol. , 2000) [11094336] The NDP-sugar co-substrate concentration and the enzyme expression level influence the substrate specificity of glycosyltransferases: cloning and characterization of deoxysugar biosynthetic genes of the urdamycin biosynthetic gene cluster. (Chem Biol. , 2000) [11410375] Two sequence elements of glycosyltransferases involved in urdamycin biosynthesis are responsible for substrate specificity and enzymatic activity. (Chem Biol. , 2001) comment Blast 2nd, id59%, 1e-116 Streptomyces fradiae_urdGT1c Glycosyl transferase [Urd_00060]L-rhodinose glycosyltransferase --- [PMID: 10662691](2000) [PMID: 11094336](2000) urdamycin clusterに含まれるglycosyltransferase候補genes=urdGT1a, urdGT1b, urdGT1cについて、mutant作成、相補実験における蓄積産物解析を行い、各機能割り当てが確定されている。 UrdGT1cは、urdamycin A生合成においてC-9での3糖側鎖2番目にあるL-rhodinoseの付着を担うO-glycosyltransferaseである。 3糖側鎖3番目にL-rhodinoseを持つurdamycin O, urdamycin Nの形成にも関与する。 urdamycin AなどはC-12bにも同じL-rhodinoseが付着するが、これを担うのはUrdGT1aであり、UrdGT1cは代替しない。 -- [PMID: 11410375](2001) アミノ酸を91%共有しているUrdGT1b and UrdGT1cの基質特異性の違いに関する検討。 nucleotide sugarとacceptor substrateの特異性を決定するのはN末である。

Sequence

>putative glycosyltransferase [putative O-glycosyltransferase]
MRVLVICTPVPTHFLPLVPLVWALRSAGHEVVVTGQPDVLGAVRAAGLTGAVVGESFDVD
GMLLRGLAEEERPLQARPRPAPEVLGGYGKLWMGHAKSVLGHYGELVREFGPELILSDPL
EYCSLILGARLGVPVVHHRWTVDAISGPARRLVRPDFRELCEELGLPGLPDPAVLLDPCP
PSLRLPDSEPGTSIRYVPYSGGGEVPGWLRADRGPGAGRQRVAVSLGNTLALHGEPFTRD
LLHALAGRPGTEILATVPERHRAGIGAVPEHVRLIDPLPLHLFLDRCDAMVHHGGAGTAM
TATAFGLPQLTLPQLADHFPLGDRLAATGAGLTFDKAAEQDDPQLIAGALDTLLSDPAYG
AAARRLAAEMAAMPSPADVAADLEQLARQA

>putative glycosyltransferase [putative O-glycosyltransferase]
ATGCGCGTACTCGTGATCTGCACCCCTGTTCCCACCCACTTCCTGCCGCTCGTGCCGCTC
GTCTGGGCGCTGCGCTCGGCGGGGCACGAGGTCGTGGTGACCGGGCAGCCCGATGTGCTC
GGCGCCGTGCGGGCCGCCGGGCTGACCGGCGCGGTCGTGGGCGAGTCGTTCGACGTGGAC
GGGATGCTGCTGCGGGGACTGGCCGAGGAGGAACGGCCGTTGCAGGCGCGGCCCCGGCCC
GCGCCCGAGGTGCTCGGCGGATACGGCAAGCTCTGGATGGGGCACGCCAAGTCCGTACTC
GGCCACTACGGCGAGCTCGTCCGGGAGTTCGGGCCCGAGTTGATCCTCTCGGACCCGCTG
GAGTACTGCTCGCTGATCCTCGGCGCGCGGCTGGGCGTGCCGGTGGTGCACCACCGTTGG
ACGGTGGACGCCATCTCCGGTCCGGCCCGGCGCCTGGTGCGCCCCGACTTCCGGGAGCTG
TGCGAGGAGCTGGGCCTGCCCGGCCTGCCGGATCCGGCGGTGCTGCTCGACCCGTGCCCG
CCGTCCCTGCGGCTGCCGGACTCCGAGCCGGGCACGTCCATCCGGTACGTGCCCTACAGC
GGCGGTGGTGAGGTGCCCGGCTGGCTGCGCGCGGACCGGGGGCCCGGTGCCGGACGGCAG
CGGGTCGCCGTCTCGCTGGGCAACACCCTCGCCCTGCACGGCGAACCGTTCACCCGGGAC
CTGCTGCATGCCCTCGCGGGCCGGCCCGGCACCGAGATCCTCGCGACGGTGCCCGAGCGG
CACCGGGCCGGTATCGGCGCCGTGCCGGAACACGTACGGCTGATCGATCCGCTGCCCCTG
CACCTGTTCCTCGACCGCTGCGACGCGATGGTCCACCACGGCGGCGCGGGCACCGCGATG
ACCGCGACCGCCTTCGGGCTGCCGCAGCTCACCCTGCCCCAGCTGGCGGACCACTTCCCG
CTGGGCGACCGGCTCGCCGCGACCGGCGCGGGCCTCACCTTCGACAAGGCAGCCGAGCAG
GACGACCCGCAGCTGATCGCCGGAGCCCTGGACACCCTGCTGTCGGATCCCGCGTACGGC
GCGGCGGCCCGGCGGCTCGCCGCGGAGATGGCCGCGATGCCGTCGCCCGCCGATGTCGCG
GCCGACCTGGAACAGCTGGCCCGTCAGGCATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR010610 Domain of unknown function DUF1205 (Domain) PF06722 DUF1205
SignalP	Eukaryota Bacteria, Gram-positive
TMHMM	No significant hit

Sch475_00290 Sch475_00310