Stref_00270 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces steffisburgensis
Strain	NRRL 3193 (=NBRC 13446)
Entry name	Steffimycin
Contig	AM156932
Start / Stop / Direction	28,077 / 26,977 / - [in whole cluster] 28,077 / 26,977 / - [in contig]
Location	complement(26977..28077) [in whole cluster] complement(26977..28077) [in contig]
Type	CDS
Length	1,101 bp (366 aa)

Annotation

Category	2.3 modification addition of sugar moiety
Product	putative glycosyltransferase helper protein
Product (GenBank)	cytochrome P450-like
Gene
Gene (GenBank)	stfPII
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q2P9Y8 PmId [16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) comment steffimycin生合成gene clusterのクローニング、特徴づけ。 36ORFsが見つかり、そのうち24ORFsを含む26.5 kb領域がおそらくsteffimycin生合成に関連する。 stfPII: Cytochrome P450-like 配列解析。 stfG and stfPII はsugar moiety L-rhamnoseの付着に関与する。 StfPII はヘム補欠分子族を結合するために必須のCysを欠いたCYP450に似ている。
Related Reference	ACC Q9L4U5 NITE Acla_00220 PmId [15911373] AknT is an activating protein for the glycosyltransferase AknS in L-aminodeoxysugar transfer to the aglycone of aclacinomycin A. (Chem Biol. , 2005) [17685523] Characterization of rhodosaminyl transfer by the AknS/AknT glycosylation complex and its use in reconstituting the biosynthetic pathway of aclacinomycin A. (J Am Chem Soc. , 2007) comment Blast 2nd, id40%, 1e-57, gapあり Streptomyces galilaeus_aknT AknT [DoBISCUIT]glycosyltransferase helper protein --- [PMID: 15911373](2005) AknKの実験に基づき代替基質として2-deoxyfucoseを用いたAknS/Tの実験。 AknS単独でも活性はあるが、AknTがないと活性は低い。 -- [PMID: 17685523](2007) dTDP-L-rhodosamineがAknS/AknTの自然な基質であることを確認。これまでに代替基質として使用されていたdTDP-2-deoxyfucoseより100倍、dTDP-daunosamineより1000倍速いKcat値を示す。 partner protein AknTは、L-rhodosamine移動のためのAknSの代謝回転速度を200倍に加速する。 AknTの存在はKm値に影響せず、kcatに影響する。AknS:AknTの最適比率は1:3。 aglycone, L-rhodosamine, 2-deoxyfucose, AknS/T, AknKでの産物は2糖型aclacinomycinが主要産物でだったことから、3糖目は2-deoxyfucoseでなく、これまでの提唱通りL- rhodinoseでありそう。
Related Reference	ACC Q54823 NITE Adria_00350 PmId [7592454] Cloning and characterization of the Streptomyces peucetius dnrQS genes encoding a daunosamine biosynthesis enzyme and a glycosyl transferase involved in daunorubicin biosynthesis. (J Bacteriol. , 1995) [17049185] Functional analysis of desVIII homologues involved in glycosylation of macrolide antibiotics by interspecies complementation. (Gene. , 2007) comment Blast 5th, id38%, 5e-52, gapあり Streptomyces peucetius_dnrQ DnrQ protein [DoBISCUIT]putative glycosyltransferase helper protein --- [PMID: 7592454](1995) dnrQSの配列解析とdnrQ不活化・相補実験。 dnrQ::aphII mutantはRHOを産生するが、DNRを産生できない。よってdnrQはdaunosemine生合成に必要、と言っている。 --- [PMID: 17049185](2007) abstract glycosyltransferase補助タンパクをコードするStreptomyces venezuelae ATCC 15439のdesVIII. このdesVIIIを不活化したmutantをdnrQで相補すると、desVIIIによる自己相補の26%まで回復する。よってdnrQには類似機能が示唆される。

Sequence

>putative glycosyltransferase helper protein [cytochrome P450-like]
MEIRTDSELGRSLLTERGMQWLHAHSGDPYARLLRAEDEDRRALGAQIRELGPLYRSRTG
AWVTGSGVLGAEILRDPRLEPLAPYVGRAQLTTVDADGPALPGPAARDAERLCGEALGRT
AGGFDLVSDVLRPVVVRLTGELLAVPPERRGTFERLCGAVAPALDAGLCPPTLPRARALI
DAVEGLRSLLAESAGPRDARMRACVVGVEVTTNVVANAMLALLERPEQWRLVCDDPRRAE
AAVEETLRCDPPVRLDGRVAREDLELAGRTVTAGDEVVVHIEAANQDAGPSRDPERFDLR
RATATGHLCLLEGTRFGAVAPQVRIFGAAVLRALAARAPDLRRTGSVVRRLRAPVTQAVV
RFPVAA

>putative glycosyltransferase helper protein [cytochrome P450-like]
GTGGAGATTCGGACGGACAGTGAACTCGGGCGGTCCCTGCTGACCGAGCGAGGTATGCAA
TGGCTGCACGCACACAGCGGAGACCCCTATGCACGGCTGCTGCGCGCGGAGGACGAGGAC
CGCCGGGCCCTCGGCGCACAGATCAGGGAACTCGGACCGCTGTACCGCAGCCGCACCGGG
GCGTGGGTCACCGGTAGCGGTGTGCTGGGCGCGGAGATTCTCCGTGATCCACGGCTGGAG
CCGCTCGCGCCGTACGTCGGGCGCGCCCAGCTGACGACGGTGGACGCCGACGGGCCGGCC
CTCCCCGGTCCGGCGGCCCGCGATGCCGAGCGGTTGTGCGGTGAGGCACTCGGCCGGACG
GCCGGCGGGTTCGACCTGGTCTCGGACGTCCTGCGTCCGGTCGTGGTCCGCCTGACCGGT
GAGCTGCTGGCCGTACCGCCCGAACGGCGAGGGACCTTCGAGCGGTTGTGCGGCGCGGTG
GCGCCCGCGCTGGACGCCGGGCTGTGCCCACCGACGCTGCCCCGCGCACGGGCACTGATC
GACGCGGTCGAGGGCCTGCGGTCCCTCCTCGCGGAGTCGGCCGGGCCGCGGGACGCGCGG
ATGCGGGCGTGCGTCGTGGGCGTCGAGGTGACGACGAACGTCGTCGCGAACGCGATGCTC
GCGCTCCTCGAGCGGCCGGAACAGTGGCGGTTGGTGTGCGACGACCCGCGACGCGCGGAG
GCGGCGGTGGAGGAAACGCTGCGCTGCGACCCGCCGGTCCGGCTCGATGGCCGAGTCGCA
CGAGAGGACCTGGAACTCGCGGGCCGGACGGTGACCGCGGGGGACGAGGTGGTCGTCCAC
ATCGAGGCGGCGAACCAGGACGCCGGGCCGTCGCGCGACCCCGAGCGGTTCGACCTGCGG
CGCGCTACCGCGACCGGGCATCTCTGCCTGCTCGAGGGAACGCGATTCGGTGCCGTGGCA
CCACAGGTGCGGATCTTCGGCGCCGCGGTGCTCCGGGCGCTGGCCGCCCGGGCGCCGGAT
CTGCGCCGGACCGGGTCCGTGGTGCGCCGTCTGCGGGCGCCGGTCACCCAGGCCGTCGTC
AGGTTCCCGGTCGCGGCATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001128 Cytochrome P450 (Family) G3DSA:1.10.630.10 Cyt_P450 PF00067 p450 SSF48264 Cytochrome_P450
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Stref_00260 Stref_00280