Stref_00280 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces steffisburgensis
Strain	NRRL 3193 (=NBRC 13446)
Entry name	Steffimycin
Contig	AM156932
Start / Stop / Direction	28,239 / 29,417 / + [in whole cluster] 28,239 / 29,417 / + [in contig]
Location	28239..29417 [in whole cluster] 28239..29417 [in contig]
Type	CDS
Length	1,179 bp (392 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	putative O-methyltransferase
Product (GenBank)	O-methyl transferase
Gene
Gene (GenBank)	stfMIII
EC number	2.1.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC Q2P9Y7 PmId [16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) comment steffimycin生合成gene clusterのクローニング、特徴づけ。 36ORFsが見つかり、そのうち24ORFsを含む26.5 kb領域がおそらくsteffimycin生合成に関連する。 stfMIII : O-Methyltransferase 配列解析。 stf clusterにある他のmethyltransferase StfMI, StfMII の機能推定からの消去法で、StfMIII には 8-hydroxyl基のO-methylationが割り当てられている。
Related Reference	ACC Q83WF2 PmId [19415708] Functional analysis of MycE and MycF, two O-methyltransferases involved in the biosynthesis of mycinamicin macrolide antibiotics. (Chembiochem. , 2009) comment Blast 4th, id45%, 3e-75 Micromonospora griseorubida_mycE Methyltransferase mycinamicin生合成における2つのO-methyltransferase、MycE と MycFの機能を解析している。 mycE, mycFそれぞれの遺伝子をHis-tagを付けてE. coliで発現させて精製し、各々の機能を調べている。各酵素はS-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent deoxysugar methyltransferaseであることが確認された。MycEの最適反応には、MycFよりも明白にMg(2+)が必要。 MycE → aglycone付着6-deoxyalloseのC2''-OHをmethylation = javose MycF → aglycone付着javoseのC3''-OHをmethylation = mycinose
	ACC O54261 NITE Nogl_00410 PmId [22120896] Identification of late-stage glycosylation steps in the biosynthetic pathway of the anthracycline nogalamycin. (Chembiochem. , 2012) comment Blast 16th, id45%, 3e-61 Streptomyces nogalater_snogY SnogY [DoBISCUIT]demethoxynogalose C-2' O-methyltransferase_snogY aglycone生合成とdeoxysugar形成に必要な29ORFsを含むpSnogaoriを異種ホストS. albusに導入。・3',4'-demethoxynogalose-1-hydroxynogalamycinone ・nogalamineがC-C結合ありrhodosamineで置換されたnogalamycin R ・nogalamineがC-C結合なし2-deoxyfucoseで置換されたnogalamycin F がS. albus/pSnogaoriで産生された。 sno clusterにあるO-methyltransferase候補のうち、pSnogaoriにはsnogYが含まれるが、snogM and snogLは含まれない。 S. albus/pSnogaoriの産物はどれもnogalose部分のC2'にmethoxy基を含むので、SnogYがC2'でのO-methylationを担う。提唱経路schemeでは、aglyconeに付着されてからメチル化を受けるとされている。
	ACC Q2P9Z1 NITE Stref_00240 PmId [16751529] Isolation, characterization, and heterologous expression of the biosynthesis gene cluster for the antitumor anthracycline steffimycin. (Appl Environ Microbiol. , 2006) comment Blast 13th, id42%, 2e-66 Streptomyces steffisburgensis_stfMII 同じstf cluster内にあるhomolog 配列解析によりL-rhamnoseでのC-2' hydroxy基のメチル化が割り当てられている。

Sequence

>putative O-methyltransferase [O-methyl transferase]
MEPVMDDRRLAELITLADRPPGDTDAGIAGLGPAAVAEALLGEICSRARLLPDLPEKVAV
QFDLGYGAERLRYLLTLGPGRWEAEPGDDPLAPVTYRQDLAELLRAVFSPGPHDGTRELS
VKDSEEPHGIAADDPWLRQRRLAVLAAHQATEAISGRFTDLTALAVRFDADKWGGHWYTP
HYQQYFEPLRDRRVRVLEIGVGGYDAPDLGGASLRMWKHYFWRGQIYGLDLYPKHGVTEP
RLRTLQGDQGDAAFLTDIATEYGPFDVVIDDGSHFSQDVRTSFASLFPHVRHGGLYVIED
MQSSYWPGWGGSTDLNASATSMGFVKTLLDGLNHQEQIRTADQRPSATELSVRGVHVHHN
LAVIEKGVNTEQGTPAWVPRTEDPRAWYPSQS

>putative O-methyltransferase [O-methyl transferase]
ATGGAACCGGTCATGGACGACCGTCGGTTGGCCGAGCTGATCACACTGGCCGACCGTCCT
CCCGGCGACACCGACGCCGGGATCGCCGGGCTCGGACCCGCGGCGGTCGCCGAGGCACTG
CTCGGGGAGATCTGCTCACGGGCCCGGCTGCTCCCCGACCTCCCGGAGAAGGTGGCCGTA
CAGTTCGACCTCGGGTACGGCGCGGAGCGACTGCGCTATCTGCTCACCCTGGGCCCGGGC
AGGTGGGAGGCGGAGCCGGGTGACGACCCGCTGGCTCCGGTGACGTACCGCCAGGACCTG
GCGGAGCTGCTGCGCGCGGTGTTCTCCCCCGGCCCCCACGACGGCACCCGTGAGCTGTCC
GTCAAGGACTCCGAGGAGCCGCACGGCATCGCCGCCGACGATCCGTGGCTCCGGCAGCGG
CGGCTCGCCGTGCTGGCCGCGCACCAGGCCACGGAAGCGATCTCCGGGCGGTTCACCGAT
CTCACCGCCCTCGCCGTGCGGTTCGACGCGGACAAGTGGGGAGGGCACTGGTACACCCCG
CACTATCAGCAGTACTTCGAACCGCTGCGGGACCGCCGGGTGCGGGTCCTGGAGATCGGC
GTCGGCGGCTACGACGCCCCGGATCTCGGCGGCGCGTCACTGCGCATGTGGAAGCACTAC
TTCTGGCGGGGCCAGATCTACGGGCTCGATCTCTACCCCAAGCACGGCGTCACCGAGCCC
CGGCTCCGGACCCTTCAGGGCGACCAGGGCGATGCCGCGTTCCTCACGGACATCGCTACG
GAGTACGGCCCGTTCGACGTGGTGATCGACGACGGCAGCCACTTCAGCCAGGACGTCCGC
ACGTCGTTCGCCTCGCTCTTCCCGCACGTGCGCCACGGGGGGCTCTACGTCATCGAGGAC
ATGCAGTCCAGCTACTGGCCGGGCTGGGGCGGGAGTACCGACCTCAACGCGTCCGCCACC
TCGATGGGGTTCGTCAAGACCCTGCTCGACGGGCTCAACCACCAGGAGCAGATCCGCACG
GCGGACCAGCGGCCCTCGGCGACCGAGCTGTCGGTGCGGGGGGTGCATGTGCACCACAAC
CTGGCCGTGATCGAGAAGGGCGTCAACACCGAGCAGGGCACACCGGCGTGGGTCCCGCGC
ACCGAGGACCCACGGGCCTGGTACCCGTCCCAGTCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Stref_00270 Stref_00290