Tatmc_00060 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sp.
Strain	CK4412
Entry name	Tautomycetin
Contig	DQ983361
Start / Stop / Direction	7,941 / 6,790 / - [in whole cluster] 7,941 / 6,790 / - [in contig]
Location	complement(6790..7941) [in whole cluster] complement(6790..7941) [in contig]
Type	CDS
Length	1,152 bp (383 aa)

Annotation

Category	3.4 other modification
Product	putative CoA transferase
Product (GenBank)	TMC biosynthetic enzyme L2
Gene
Gene (GenBank)	tmcD
EC number
Keyword	dialkylmaleic anhydride moiety
Note
Note (GenBank)	CAIB/BAIF family protein; ORF L2
Reference	ACC A4KCF6 PmId [17379718] Isolation of the biosynthetic gene cluster for tautomycetin, a linear polyketide T cell-specific immunomodulator from Streptomyces sp. CK4412. (Microbiology. , 2007) comment tautomycetinの生合成遺伝子クラスターに関する文献。 tmcD: CAIB/BAIF family protein (Burkholderia thailandensis), id=60% predicted acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase (Burkholderia pseudomallei), id=60% tmcD自体の機能実験は行われていないが、tmcD不活化変異株を作成し、tautomycetin生産が消失することが示されている。また、acyl-CoA transferase/carnitine dehydrataseとの相同性を示すことより、該当するCoA esterとしてcyclic C8 dialkylmaleic anhydride moietyに活性化する酵素をエンコードしていると予想している。
Related Reference	ACC C6ZCS3 PmId [19191560] Characterization of the tautomycetin biosynthetic gene cluster from Streptomyces griseochromogenes provides new insight into dialkylmaleic anhydride biosynthesis. (J Nat Prod. , 2009) comment <Predicted acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase, BLAST 1; id=100%> Streptomyces griseochromogenesにおけるTautomycetin Biosynthetic Gene Clusterを同定した文献。 ttnP (383 a.a): CoA transferase ttnP自体の機能実験は行われていないが、ttnP不活化変異株を作成し、Tautomycetin (TTN)生産が消失すること、この変異株にttnPを相補するとTTNの生産が部分的に回復することが確認されている。また、相同性よりanhydride ringの閉環反応に関与すると予想している。TmcDと逆でCoAを離脱する反応が割り当てられている。
	ACC Q1KLK1 PmId [16547052] Properties of succinyl-coenzyme A:L-malate coenzyme A transferase and its role in the autotrophic 3-hydroxypropionate cycle of Chloroflexus aurantiacus. (J Bacteriol. , 2006) comment <Succinyl-CoA:L-malate CoA transferase subunit A, Chloroflexus aurantiacus, BLAST 208; id=41%> Chloroflexus aurantiacusよりsuccinyl-CoA:L-malate coenzyme A transferaseを精製し、その二つのサブユニット(subunit A, B)のN末端アミノ酸配列を決定し、遺伝子を同定している。また、クローニングした二つの遺伝子を E. coliで発現させて、諸性質を調べている。
	ACC Q1KLK0 PmId [16547052] Properties of succinyl-coenzyme A:L-malate coenzyme A transferase and its role in the autotrophic 3-hydroxypropionate cycle of Chloroflexus aurantiacus. (J Bacteriol. , 2006) comment <Succinyl-CoA:L-malate CoA transferase subunit B, Chloroflexus aurantiacus, BLAST 279; id=40%> Chloroflexus aurantiacusよりsuccinyl-CoA:L-malate coenzyme A transferaseを精製し、その二つのサブユニット(subunit A, B)のN末端アミノ酸配列を決定し、遺伝子を同定している。また、クローニングした二つの遺伝子をE. coliで発現させて、諸性質を調べている。

Sequence

>putative CoA transferase [TMC biosynthetic enzyme L2]
MSDTPPPLAGLTVIDASTLFAGPFAARLLGDYGAEVIKVEAPAGDPVRGFGHAQNDVSLL
WKVLGRNKKSVVLDLRESAGAESFLRLVRRADALIENFRPGTLERWGLGPEVLAEANPRL
VLARVTTFGQDGPYARRPGFGTLAEAMSGLAAMSGEPDGPPALPSFPLGDAVAGLHAALA
VLIGLRARDTNGTGQVADVAIAETLIGTLGAQLTVYEHLGVKPERIGNRSHNSAPRNVYR
CADGRWVAVSASALSIAERIVRLVGRPELVAEPWFATGSGRAAHREVLDDAVRSWIATRK
RDEVVTAFEKAQAAVAPIYEVDDVLNDPQFRARGLTVEVPDAELGTVRMPGLPFRLSATP
GRIDWAGPRVGEHTEEFTGETEA

>putative CoA transferase [TMC biosynthetic enzyme L2]
GTGTCGGATACTCCGCCCCCCTTGGCCGGTCTCACCGTGATCGACGCGTCCACGCTCTTC
GCGGGCCCCTTTGCTGCGCGGCTGCTCGGCGACTACGGTGCCGAGGTCATCAAGGTCGAG
GCGCCGGCCGGCGATCCCGTACGCGGGTTCGGTCACGCCCAGAACGACGTCTCGCTGCTG
TGGAAGGTGCTGGGCCGCAACAAGAAGAGCGTGGTGCTCGACCTGCGCGAGTCCGCGGGC
GCCGAGAGTTTCCTGCGCCTGGTGCGCCGCGCCGACGCGCTCATCGAGAACTTCCGGCCC
GGCACGCTGGAGCGCTGGGGACTCGGCCCGGAGGTGCTCGCCGAGGCGAATCCGCGGCTG
GTGCTGGCCCGGGTGACCACGTTCGGCCAGGACGGCCCGTACGCGCGGCGTCCTGGCTTC
GGCACGCTGGCCGAGGCGATGAGCGGGCTGGCCGCGATGTCCGGTGAGCCGGACGGCCCG
CCCGCGCTGCCGTCGTTCCCCCTGGGCGATGCCGTGGCCGGGCTGCACGCCGCCCTGGCG
GTCCTCATCGGGCTGCGCGCCCGCGACACGAACGGCACCGGTCAGGTCGCGGACGTCGCG
ATCGCGGAGACGCTGATCGGCACGCTGGGCGCCCAGCTCACCGTGTACGAGCACCTCGGC
GTCAAGCCCGAGCGGATCGGCAACCGCAGCCACAACAGCGCGCCCCGCAACGTCTACCGG
TGTGCGGACGGCCGCTGGGTGGCGGTGTCCGCGTCGGCGCTCTCGATCGCCGAGCGTATC
GTCCGGCTGGTCGGCCGCCCCGAGTTGGTCGCGGAGCCGTGGTTCGCCACCGGAAGCGGC
CGGGCCGCGCACCGCGAGGTGCTCGACGACGCCGTCCGGTCGTGGATCGCCACCCGCAAG
CGCGACGAGGTCGTCACCGCGTTCGAGAAGGCGCAGGCGGCGGTCGCCCCCATATACGAG
GTCGACGACGTCCTGAACGACCCGCAGTTCCGCGCCCGCGGCCTGACCGTGGAGGTGCCC
GACGCCGAGCTCGGCACCGTACGCATGCCGGGCCTGCCGTTCCGGCTGTCGGCCACCCCG
GGCCGGATCGACTGGGCCGGCCCACGCGTCGGCGAGCACACTGAGGAATTCACAGGAGAG
ACCGAGGCATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR003673 CoA-transferase family III (Family) PF02515 CoA_transf_3 IPR023606 CoA-transferase family III domain (Domain) SSF89796 CoA-transferase family III (CaiB/BaiF) G3DSA:3.40.50.10540 no description
SignalP	Bacteria, Gram-positive Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

Tatmc_00050 Tatmc_00070