Azino_00030 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sahachiroi
Strain	NRRL 2485 (=NBRC 13928)
Entry name	Azinomycin B
Contig	EU240558
Start / Stop / Direction	7,205 / 6,384 / - [in whole cluster] 7,205 / 6,384 / - [in contig]
Location	complement(6384..7205) [in whole cluster] complement(6384..7205) [in contig]
Type	CDS
Length	822 bp (273 aa)

Annotation

Category	1.4 Other
Product	putative type II thioesterase
Product (GenBank)	Azi2
Gene	aziA6
Gene (GenBank)	azi2
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)	thioesterase
Reference	ACC B4XY95 PmId [18635006] Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis. (Chem Biol. , 2008) comment Azinomycin B生合成遺伝子クラスターの報告。 aziA6: Thioesterase azinomycin Bのcluster内にdiscrete TEは3つあり(AziA6, AziA7, AziA8)。 aziA6, aziA7は、NRPSであるaziA3, aziA4と遺伝的に連結している。とりわけaziA6はそのスタートストップがoverlapしていることから、12kbpの巨大なオペロンの中でaziA3, aziA4のNRPS genesと翻訳共役されていると推測している。
Related Reference	ACC Q846W2 NITE Monen_00290 PmId [16984884] Identification of NanE as the thioesterase for polyether chain release in nanchangmycin biosynthesis. (Chem Biol. , 2006) comment BLAST id38% Streptomyces cinnamonensis_monAX Thioesterase 対照実験として。 MonAXはdiketide-SNACを加水分解したが、polyether-SNACを加水分解しなかった。よって、polyether鎖の放出には関与しない。
Related Reference	ACC Q9ZGI1 NITE Pikro_00070 PmId [9770448] A gene cluster for macrolide antibiotic biosynthesis in Streptomyces venezuelae: architecture of metabolic diversity. (Proc Natl Acad Sci U S A. , 1998) [10421766] Elucidating the mechanism of chain termination switching in the picromycin/methymycin polyketide synthase. (Chem Biol. , 1999) [10676969] Alternative modular polyketide synthase expression controls macrolactone structure. (Nature. , 2000) [10713461] Genetic architecture of the polyketide synthases for methymycin and pikromycin series macrolides. (Gene. , 2000) [11223265] The Streptomyces venezuelae pikAV gene contains a transcription unit essential for expression of enzymes involved in glycosylation of narbonolide and 10-deoxymethynolide. (Gene. , 2001) [12368286] Biochemical evidence for an editing role of thioesterase II in the biosynthesis of the polyketide pikromycin. (J Biol Chem. , 2002) comment BLAST id32% Streptomyces venezuelae_pikAV Thioesterase II PikAV --- [PMID: 9770448](1998) 12員環骨格を持つMethymycin and Neomethymycinと、14員環骨格を持つNarbomycin and Pikromycinの生合成で共有されるclusterの同定。 PikAV: TEII pikAV deletion/replacement mutantはmethymycin, neomethymycin or pikromycinを、wild-type S.venezuelaeと比べて5%以下しか産生しなかった。それらの中間体である10-deoxymethynolide or narbonolideの蓄積も検出されなかった。 --- [PMID: 10421766](1999) pikAI-AIVをS. lividansで異種性発現し、12員環前駆体10-deoxymethynolideと14員環前駆体narbonolideの産生を確認。Pik TEII thioesterase(pikAV)も同時に発現させると産生レベルは増加するが、2つの化合物の比率は変わらない。 --- [PMID: 10676969](2000) PikAIVのTE domain, TEII gene(pikAV)に関するmutantを作成。 TEII 単独ではpolyketide終結に十分でない。 --- [PMID: 10713461](2000) ・12員環＋14員環マクロライドを産生するS. venezuelae ATCC 15439 ・主に12員環マクロライドを産生するS. venezuelae ATCC 15068 ・14員環マクロライドのみを産生するS. narbonensis ATCC 19790 の3株のPKSの配列解析から、その産生調節の違いを検討している。 S. venezuelae ATCC 15439のpik clusterの5つの遺伝子座のうちPKSのpikAをシークエンスし、遺伝子構成を示している。 pik TEII 単独ではpolyketide鎖長を決定する因子になりえない。 --- [PMID: 11223265](2001) pikAV in-frame deletionするとaglycone formだがpolyketide産物量は正常のまま。このdeletion株にdesVIII-VI and desRをplasmidで発現させると、機能的なPikAVはなくてもglycosylated products産生を完全に回復。したがって、PikAV TE II はpolyketide生合成において重要な役割をしておらず、削除されたpikAV DNAの領域はdes genesの発現のために必須の転写unitを含む。 --- [PMID: 12368286](2002) 精製されたrecombinant TEIIでvitro enzyme assays. TEII(PikAV)はacyl-ACP thioestersを加水分解できる。長い半減期をもつ異常なacyl-ACP種を優先的に取り除く。

Sequence

>putative type II thioesterase [Azi2]
MSTDTHAGASPRSGPVSFTMDSPWVRRVPREQARVRLICLPFAGGGASVYQRTAALMPSW
VETLTVQLPGREDRSREEPPARIETLVTACSIALRPYTTMPYVLYGHCAGGLLAYEIAHE
MGRRFGTWPQRLIVGEQPAPQAPPPAEPLHLLPDEELLATVRERGGLPDAVARNAPLLDM
LLPLLRSDFELWENYRHRPRPPLPVPITTVRGLTGSVDESDLAGWAAQTAVGRTGLSVEG
GHYFVVGLTPEAAREIGGQLAVEPPAPAGRTSS

>putative type II thioesterase [Azi2]
TTGAGCACGGACACCCACGCAGGGGCGTCCCCGCGCAGCGGACCGGTGAGCTTCACCATG
GACTCGCCCTGGGTGCGCCGCGTCCCCCGCGAACAGGCCCGGGTACGGCTGATCTGTCTG
CCGTTCGCCGGTGGCGGCGCGTCCGTGTACCAGCGGACGGCGGCACTCATGCCCTCCTGG
GTGGAGACGCTGACGGTGCAGCTGCCCGGCCGTGAGGACCGCTCCCGGGAGGAGCCGCCG
GCCCGCATCGAAACGCTGGTCACCGCCTGCTCGATCGCCCTGCGCCCGTACACCACCATG
CCGTACGTGCTGTACGGGCACTGTGCGGGCGGGTTGCTGGCGTACGAGATCGCGCACGAG
ATGGGCCGCCGGTTCGGAACGTGGCCGCAGCGGCTGATCGTCGGCGAGCAGCCCGCTCCG
CAGGCGCCGCCGCCTGCGGAGCCGTTGCACCTGCTCCCGGACGAGGAGCTGCTGGCGACG
GTGCGCGAGCGCGGCGGGCTGCCCGACGCGGTGGCCCGCAACGCGCCGTTGCTGGACATG
CTCCTGCCGCTGCTGCGCAGTGACTTCGAGCTCTGGGAGAACTACCGGCACCGGCCGCGT
CCCCCGCTGCCGGTTCCGATCACCACGGTTCGGGGGCTGACCGGCTCGGTGGACGAGTCG
GACCTGGCCGGCTGGGCCGCGCAGACGGCCGTGGGCCGGACCGGTCTGAGTGTGGAGGGC
GGGCACTACTTCGTCGTCGGACTCACCCCGGAGGCCGCCCGGGAGATCGGTGGACAGCTG
GCCGTCGAACCGCCCGCTCCGGCCGGAAGGACCTCTTCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001031 Thioesterase (Domain) PF00975 Thioesterase
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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