Azino_00190 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sahachiroi
Strain	NRRL 2485 (=NBRC 13928)
Entry name	Azinomycin B
Contig	EU240558
Start / Stop / Direction	27,975 / 27,040 / - [in whole cluster] 27,975 / 27,040 / - [in contig]
Location	complement(27040..27975) [in whole cluster] complement(27040..27975) [in contig]
Type	CDS
Length	936 bp (311 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative transketolase(fragment)
Product (GenBank)	Azi18
Gene	aziC5
Gene (GenBank)	azi18
EC number
Keyword	aziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acid
Note
Note (GenBank)	transketolase N-terminal subunit
Reference	ACC B4XYB1 PmId [18635006] Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis. (Chem Biol. , 2008) comment Azinomycin B生合成遺伝子クラスターの報告。 aziC5: Transketolase N-terminal subunit AziC2-C11は、3つめのbuilding blockであるaziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acidの生合成に関与すると想定される。 AziC5, AziC6はそれぞれtransketolasesのN末, C末subunitに高い相同性あり。 C5位での2C unit伸長のためのcofactorとしてthiamine pyrophosphate(TPP)とタンパク複合体を構成すると推測している。
Related Reference	ACC P27302 PmId [8396116] ( , ) [7607225] ( , ) comment Escherichia coli_tktA(tkt) Transketolase 1(EC 2.2.1.1) tktAとtktBはAAで74%id Azino_00190 31%, 6e-21 <-this ORF, TktAのN末部分にhit Azino_00180 No hit <-下流隣接ORF --- [PMID:8396116](1993) tktをtktAに改名している。 tktA: 主要酵素で、transketolase activityの70-90% tktB: 活性はとても低い。transaldolaseをコードするtalAとのオペロン内にあるかもしれない。 --- [PMID:7607225](1995) tktAにコードされるTransketolase Aの詳細な解析。酵素活性測定あり。 73000Daのsubunitから成るHomodimerである。
	ACC P33570 PmId [8396116] ( , ) comment Escherichia coli (strain K12)_tktB Transketolase 2(EC 2.2.1.1) Azino_00190 35%, 2e-24 <-this ORF, TktBのN末部分にhit Azino_00180 26%, 0.027 <-下流隣接ORF, TktBのC末部分にhit
	ACC O06811 PmId [22645655] ( , ) comment Mycobacterium tuberculosis_tkt(Rv1449c) Transketolase (700 a.a.) 構造解析およびkinetic解析を行っている。 Azino_00190 id31%, 2e-18 <-this ORF, TktのN末部分にhit Azino_00180 id26%, 0.020 <-下流隣接ORF, TktのC末部分にhit

Sequence

>putative transketolase(fragment) [Azi18]
MSRPPLPRRFLRSTSWSTSRTDARPKGIRTMAVPLTGPPQPPAPAPPPQPLDPADMARRI
RQDVIRMAGGPEGAHVGGSLSCADVLAVLHTRLLRPGDSFVLSKGHAAPALYSTLVQLGR
LPADELDSYTAPGSRLFGHPSHDLPGVEFATGSLGHGLGLSVGLAIAEQLHGGDGRVYTL
LGDGELQEGSVWEAALLAGHRRPPGLVAVVDRNGLQITGGTEDCVGLEPLDAKFAAFGWE
TRTVDGHDLPALYEALQPSPGGPVAVLARTVKGRGVPFLEARVAGHYAKLKPALVSRALA
ALGHPVQGGTA

>putative transketolase(fragment) [Azi18]
GTGAGCCGCCCGCCGCTCCCCCGCCGGTTCCTCCGCTCCACGTCCTGGTCCACGTCCCGG
ACCGACGCCCGTCCGAAGGGAATCCGCACGATGGCCGTACCCCTCACCGGCCCACCGCAG
CCACCCGCCCCCGCGCCGCCTCCGCAGCCGCTCGACCCGGCGGACATGGCCCGGCGGATC
CGCCAGGACGTGATCCGCATGGCGGGCGGGCCCGAGGGCGCGCACGTCGGCGGCAGTCTG
TCGTGCGCGGACGTCCTGGCCGTCCTGCACACCCGGCTCCTGCGTCCGGGCGACTCGTTC
GTGCTGAGCAAGGGGCACGCCGCACCCGCGCTGTACAGCACGCTGGTCCAGCTCGGAAGG
CTCCCGGCGGACGAGCTCGACAGCTACACCGCGCCGGGCAGCCGGCTGTTCGGCCACCCC
TCGCACGACCTGCCCGGAGTCGAGTTCGCCACCGGTTCCCTGGGCCACGGACTCGGCCTG
TCGGTGGGCCTGGCCATCGCCGAGCAGCTGCACGGCGGCGACGGACGCGTGTACACCCTG
CTCGGAGACGGTGAACTGCAGGAGGGCAGTGTCTGGGAGGCCGCCCTGCTCGCCGGTCAC
CGCAGGCCGCCCGGGCTGGTCGCGGTGGTGGACCGCAACGGGCTGCAGATCACGGGCGGT
ACGGAGGACTGCGTCGGACTCGAACCGCTGGACGCCAAGTTCGCGGCGTTCGGCTGGGAG
ACACGCACCGTCGACGGACACGACCTGCCCGCGCTGTACGAGGCCCTGCAGCCGTCCCCG
GGCGGTCCGGTCGCGGTGCTCGCGCGCACCGTGAAGGGCCGCGGGGTGCCGTTCCTCGAG
GCCCGCGTGGCCGGTCACTACGCCAAGCTCAAACCGGCCCTGGTCAGCAGGGCCCTGGCC
GCGCTCGGCCACCCCGTGCAGGGAGGTACGGCGTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR005474 Transketolase, N-terminal (Domain) PF00456 Transketolase_N
SignalP	Bacteria, Gram-positive Bacteria, Gram-negative
TMHMM	No significant hit

Azino_00180 Azino_00200