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Azino_00220 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 2485 (=NBRC 13928)
Entry nameAzinomycin B
Contig
Start / Stop / Direction30,737 / 31,615 / + [in whole cluster]
30,737 / 31,615 / + [in contig]
Location30737..31615 [in whole cluster]
30737..31615 [in contig]
TypeCDS
Length879 bp (292 aa)
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Category2.1 modification addition of extender units
Productputative LysW-glutamate/LysW-aminoadipate kinase
Product (GenBank)Azi22
GeneaziC3
Gene (GenBank)azi22
EC number2.7.2.-
Keyword
  • aziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acid
Note
Note (GenBank)
  • acetylglutamate kinase
Reference
ACC
PmId
[18635006] Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis. (Chem Biol. , 2008)
comment
Azinomycin B生合成遺伝子クラスターの報告。

aziC3: N-acetylglutamate kinase

AziC2-C11は、3つめのbuilding blockであるaziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acidの生合成に関与すると想定される。

AziC3, AziC4はオルニチン生合成経路の酵素と相同性を示す。AziC3はリン酸化によって、N-acetylglutamic acidのgamma-carboxyl基を活性化する可能性が示唆された。
Related Reference
ACC
Q4JAQ2
PmId
comment
Blast id31%
Sulfolobus acidocaldarius_argB/lysZ(Saci_0751)
Acetylglutamate/acetylaminoadipate kinase

lysZ homologであるSaci_0751は、LysW-AAAとLysW-glutamateの両複合体をリン酸化することを示した。つまり、lysineとarginine生合成の両方で機能することが出来る。
ACC
O50147
PmId
comment
Blast id37%
Thermus thermophilus HB27_(TT_C1541)
Putative acetylglutamate kinase-like protein
このentryはLysZに相当。

LysW, LysXを用いるlysine生合成経路の報告。

異種性発現、精製して得たLysW, LysX, LysY, LysZ, LysJ and LysKをputative cofactorsと共に反応させると、相当量のlysineが検出された。どれかひとつでも酵素を省略すると、lysine産生は観察されない。

LysZによってリン酸化されたalpha-aminoadipate(AAA)部分を含む中間体、その後LysYによって形成されるAAA semialdehyde部分を含む中間体は、実験はしてみているがそれらがおそらく不安定であったため検出できていない。

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selected fasta
>putative LysW-glutamate/LysW-aminoadipate kinase [Azi22]
MAQDPRGHEPNPLIGGFAHDGPIVVKIGGGSDPEPVLDEVAELALAGRPTVLVHGGGAVA
DLLSEQLGVERRVIRSPDGTHSRRTDAAMLDVITLALLGRVKPRLISGLRARGARSVGLS
GADGALLTATRKPALRSVQDGRTVLIRDDRSGRIERVDPAPVRAVLDRGHVPVVSPPASD
AAGNLLNVDADEAAARLATALDASALVLLTDVGGVLADLGDPATRIARVGPHHLEGDVVR
GRMRHKVRAGLRASRTVRQVAIGAAHLHRPIHQALSGAGSRLCDEGERPEDG
selected fasta
>putative LysW-glutamate/LysW-aminoadipate kinase [Azi22]
ATGGCGCAGGATCCGAGGGGGCACGAGCCGAACCCGCTGATCGGCGGGTTCGCGCACGAC
GGGCCGATCGTGGTCAAGATCGGCGGCGGGAGCGACCCGGAGCCCGTACTGGACGAGGTG
GCCGAACTGGCGCTCGCCGGCCGGCCGACGGTACTCGTCCACGGCGGCGGAGCAGTCGCC
GACCTGCTGTCGGAACAACTCGGCGTGGAGCGGCGGGTGATCAGGTCCCCGGACGGCACG
CACAGCCGTCGCACGGACGCGGCCATGCTCGATGTCATCACCCTCGCCCTGCTCGGGCGG
GTGAAACCACGTCTGATCAGCGGATTACGGGCACGCGGCGCACGGTCGGTGGGCCTGAGC
GGCGCGGACGGCGCCCTGCTGACCGCCACCCGCAAACCGGCCCTGCGCTCCGTGCAGGAC
GGCCGGACCGTACTGATCCGGGACGACCGGTCCGGCCGCATCGAGCGCGTCGACCCCGCG
CCGGTCCGCGCGGTGCTGGACCGGGGGCACGTCCCCGTGGTCTCCCCGCCGGCCAGCGAC
GCCGCGGGCAACCTGCTCAACGTGGACGCCGACGAGGCGGCGGCCCGGCTGGCGACCGCC
CTGGACGCGTCGGCCCTGGTCCTGCTCACCGATGTGGGTGGCGTCCTGGCCGACCTCGGC
GACCCCGCCACCCGGATCGCGCGGGTGGGCCCGCACCACCTGGAAGGCGACGTCGTCCGA
GGACGGATGCGGCACAAGGTACGCGCCGGGCTGCGGGCCAGCAGGACCGTGCGGCAGGTG
GCCATCGGCGCCGCGCATCTGCACCGGCCGATCCACCAGGCCCTCTCCGGTGCCGGCAGC
CGGCTGTGCGACGAAGGGGAGAGGCCCGAAGATGGCTGA

close this sectionFeature

BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR001048 Aspartate/glutamate/uridylate kinase (Domain)
[22-274] 1.80000000000002e-47 G3DSA:3.40.1160.10
G3DSA:3.40.1160.10   Aa_kinase
[23-260] 4.9e-26 PF00696
PF00696   AA_kinase
[19-288] 4.50001022902825e-41 SSF53633
SSF53633   Aa_kinase
IPR001057 Glutamate/acetylglutamate kinase (Family)
[47-61] 3.0999994589937e-05 PR00474 [189-216] 3.0999994589937e-05 PR00474
PR00474   GLU5KINASE
IPR004662 Acetylglutamate kinase (Family)
[3-285] 4.39999001237694e-46 PIRSF000728
PIRSF000728   NAGK
[23-260] 2.1e-49 TIGR00761
TIGR00761   ArgB
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Azino_00210 Azino_00210   Azino_00230 Azino_00230
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