Azino_00230 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces sahachiroi
Strain	NRRL 2485 (=NBRC 13928)
Entry name	Azinomycin B
Contig	EU240558
Start / Stop / Direction	31,608 / 32,738 / + [in whole cluster] 31,608 / 32,738 / + [in contig]
Location	31608..32738 [in whole cluster] 31608..32738 [in contig]
Type	CDS
Length	1,131 bp (376 aa)

Annotation

Category	2.1 modification addition of extender units
Product	putative LysW-ornithine/LysW-gamma-lysine hydrolase
Product (GenBank)	Azi23
Gene	aziC10
Gene (GenBank)	azi23
EC number
Keyword	aziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acid
Note
Note (GenBank)	N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase
Reference	ACC B4XYB5 PmId [18635006] Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis. (Chem Biol. , 2008) comment Azinomycin B生合成遺伝子クラスターの報告。 aziC10: N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase AziC2-C11は、3つめのbuilding blockであるaziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acidの生合成に関与すると想定される。 deacylase familyに属するAziC10はdeacylation反応を触媒し、azinomycin B骨格組み立てのために重要なbuilding blockとしてaziridino[1,2a]pyrrolidinyl amino acidを放出すると想定される。
Related Reference	ACC Q8VUS5 PmId [11852094] ( , ) [19620981] ( , ) comment Thermus thermophilus HB27_lysK(TT_C1396) Acetyl-lysine deacetylase [PMID:11852094] argE homologのknockout mutantを作製、この株を最少培地で培養したところlysineの添加により生育が著しく改善したことから、この遺伝子をlysKと命名。精製したlysKは、N(2)-acetyllysineとN(2)-acetylornithineに対して同程度のdeacetylating activitiesを示した。 [PMID:19620981] LysKのlysine-releasing activityがgamma-linkage特異的であることを(i) LysW-alpha-Lys, (ii) 13-alpha-Lys ,(iii) 13-gamma-Lysを基質として用い確かめた。この結果より、中間体のC末端の結合はgamma-peptide結合であり、LysKは厳密なgamma結合特異性を持つことを示した。LysKの機能は、lysine生合成の最終ステップにおいてLysW-gamma-Lysからlysineを遊離させることだと証明した。

Sequence

>putative LysW-ornithine/LysW-gamma-lysine hydrolase [Azi23]
MADHQRTADRTRPAAGDGDYPAWLLRAALGIPSVSGRELPVARFLADRMAELGLDSYVDE
VGNVHGLIGPRTGPTVMLLGHIDTVPGQVPVVQVGDLLYGRGAVDAKGSIVTMICAAART
EGVRVHVIGAVGEEVAGSRGAHHVLATVPPPAALVIGEPSGWDGVCLGYKGRIGIGYEIS
RPPLHTSSPEPTAVECAARFAHDIQEYLRGLSPEQDDPVAFGVAAATLVRLHGDLAEAEA
FLSCRVPPGFDFAALERFARSRPHSRIRVDERVPGVTRPRTDPVVSQLRAAIAAQGVRPT
LKRKAGTSDMNTLAPWGIPMAAYGPGDAHLDHTTDEHIPLGDLYRAIDVLALALPRLASR
LAAPPRTTGAPELLEA

>putative LysW-ornithine/LysW-gamma-lysine hydrolase [Azi23]
ATGGCTGACCACCAGCGCACCGCCGACCGTACCCGCCCCGCGGCGGGCGACGGGGACTAC
CCGGCCTGGCTCCTGCGGGCCGCGCTCGGCATCCCCTCGGTCTCCGGCCGGGAACTGCCC
GTCGCCCGCTTCCTCGCCGACCGGATGGCCGAGCTGGGCCTCGACTCGTACGTCGACGAG
GTCGGCAACGTGCACGGCCTGATCGGCCCGCGCACGGGCCCCACCGTCATGCTGCTCGGA
CACATCGACACCGTCCCCGGACAGGTACCGGTGGTCCAGGTCGGCGATCTGCTCTACGGC
CGCGGCGCGGTGGACGCGAAGGGCTCCATCGTCACCATGATCTGTGCCGCGGCCCGCACC
GAGGGAGTACGCGTGCACGTGATCGGCGCGGTCGGCGAGGAGGTCGCCGGCTCCCGCGGC
GCCCACCACGTGCTGGCCACGGTGCCGCCCCCGGCGGCGCTCGTGATCGGCGAACCGAGC
GGCTGGGACGGCGTCTGCCTGGGCTACAAGGGACGTATCGGCATCGGCTACGAGATCAGC
CGGCCACCCCTGCACACCAGCAGCCCGGAGCCGACCGCCGTGGAGTGCGCCGCCCGCTTC
GCCCACGACATACAGGAGTATCTGCGGGGACTCTCGCCCGAACAGGACGACCCGGTCGCC
TTCGGGGTCGCCGCCGCGACGCTCGTCCGGCTGCACGGCGATCTGGCCGAGGCCGAGGCC
TTCCTGAGCTGCCGGGTGCCGCCGGGGTTCGACTTCGCCGCGCTGGAACGCTTCGCCCGC
AGCAGACCGCACAGCCGCATCCGGGTGGACGAACGGGTCCCCGGAGTGACCCGGCCGCGC
ACCGACCCCGTGGTGAGCCAGCTCCGCGCCGCGATAGCCGCCCAGGGAGTCCGCCCGACG
CTCAAACGCAAGGCCGGCACCTCGGACATGAACACCCTCGCCCCCTGGGGCATCCCCATG
GCCGCCTACGGGCCGGGCGACGCCCACCTGGACCACACCACCGACGAACACATCCCGCTC
GGCGACCTGTACCGCGCGATCGACGTCCTGGCCCTCGCGCTGCCCCGGCTGGCGAGCCGC
CTCGCGGCGCCGCCGCGGACCACCGGCGCGCCCGAGCTGCTGGAGGCATGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001261 ArgE/DapE/ACY1/CPG2/YscS, conserved site (Conserved_site) PS00758 ARGE_DAPE_CPG2_1 IPR002933 Peptidase M20 (Family) PF01546 Peptidase_M20 IPR010175 Acetyl-ornithine/Acetyl-lysine deacetylase (Family) TIGR01902 DapE-lys-deAc
SignalP	Eukaryota
TMHMM	No significant hit

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