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Azino_00290 : CDS information

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Organism
StrainNRRL 2485 (=NBRC 13928)
Entry nameAzinomycin B
Contig
Start / Stop / Direction45,500 / 46,513 / + [in whole cluster]
45,500 / 46,513 / + [in contig]
Location45500..46513 [in whole cluster]
45500..46513 [in contig]
TypeCDS
Length1,014 bp (337 aa)
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Category5.3 uncharacterized protein (biosynthesis involved)
Producthypothetical protein
Product (GenBank)Azi29
GeneaziU3
Gene (GenBank)azi29
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
  • hypothetical protein
Reference
ACC
PmId
[18635006] Characterization of the azinomycin B biosynthetic gene cluster revealing a different iterative type I polyketide synthase for naphthoate biosynthesis. (Chem Biol. , 2008)
[23039858] Essential role of an unknown gene aziU3 in the production of antitumor antibiotic azinomycin B verified by utilizing optimized genetic manipulation systems for Streptomyces sahachiroi. (FEMS Microbiol Lett. , 2012)
comment
[PMID:18635006](2008)
Azinomycin B生合成遺伝子クラスターの報告。

aziU3: Unknown protein

aziU1,U2,U3はstart and stop codonsがoverlapしていることから、翻訳共役される可能性が示唆された。
配列からの機能推定はできなかった。
これらのORFがazinomycin Bの生合成に関与するかはわかっていない。

---
[PMID:23039858](2013)
in-fame deletion and complementation experimentsの結果から、3つのunknown genes (aziU1, aziU2 and aziU3)は、azinomycin B 生合成に必須の遺伝子であることが示された。

また、aziU3の過剰発現株だけがazinomycin B産生を著しく改善したことが判明している(Shan Wang & Jing He,　unpublished)。

AziU3はBtrH (pfam14399)のconserved domainを保存しており、AziU3のBLASTP解析の結果と合わせて、AziU3はazinomycin Bのnonribosomal peptide鎖を組み立てる珍しいNRPS systemか、前例のないazabicyclic環の生合成に関与していると示された。

AziU3の生化学的調査は行われていない。

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selected fasta
>hypothetical protein [Azi29]
MTTTAPPVELWTRDLGSCLHGTLATALIRDGHDPVTVLGAPWEFRRRPGAWSSEEYFFFA
EPDSLAGRLALYHPFESTWHRSDGDGVDDLREALAAGVLPIAAVDNFHLPFRPAFHDVHA
AHLLVVYRITETEVYVSDAQPPAFQGAIPLADFLASWGSLNPPDDADVFFSASPSGRRWL
RTRMTGPVPEPDRHWVGRVIRENVARYRQEPPADTQTGLPGLRRYLDELCALTPGTNAAS
EALSELYVISWNIQAQSGLHAEFLRAHSVKWRIPELAEAAAGVDAVAHGWTGVRMTGAHS
RVWQRHRPAELRGHATALVRRLEAALDLLELAADAVS
selected fasta
>hypothetical protein [Azi29]
ATGACCACCACCGCACCGCCCGTCGAACTCTGGACACGCGACCTGGGAAGCTGCCTGCAC
GGCACCCTGGCGACGGCGCTGATCCGCGACGGCCACGACCCGGTCACCGTCCTCGGCGCG
CCCTGGGAGTTCCGCCGCCGCCCCGGGGCCTGGAGCTCGGAGGAGTACTTCTTCTTCGCG
GAACCCGATTCGCTCGCCGGGCGGCTCGCCCTCTACCACCCCTTCGAGTCGACCTGGCAC
CGCAGTGACGGCGACGGCGTGGACGACCTGCGCGAGGCGCTCGCGGCAGGCGTGCTGCCC
ATCGCCGCCGTCGACAACTTCCATCTGCCCTTCCGGCCCGCCTTCCACGACGTACACGCC
GCGCACCTCCTCGTGGTCTACCGGATCACCGAGACCGAGGTGTACGTCTCCGACGCCCAG
CCCCCTGCCTTCCAGGGCGCGATCCCGCTCGCCGACTTCCTGGCGAGCTGGGGATCGCTC
AACCCGCCGGACGACGCGGACGTGTTCTTCAGCGCCAGCCCCAGTGGCCGCCGCTGGCTG
AGGACCCGTATGACGGGCCCCGTCCCGGAACCGGACCGGCACTGGGTCGGCCGTGTCATC
CGGGAGAACGTCGCCCGGTACCGGCAGGAGCCCCCTGCGGACACCCAGACGGGACTGCCC
GGCCTGCGCCGGTACCTCGACGAGCTGTGCGCGCTCACTCCCGGCACGAACGCGGCGTCC
GAGGCCCTGAGCGAGCTGTACGTCATCTCGTGGAACATCCAGGCCCAGAGCGGCTTGCAC
GCCGAGTTCCTGCGCGCCCACTCGGTGAAATGGCGGATCCCGGAACTGGCGGAAGCAGCG
GCCGGTGTCGACGCGGTGGCACACGGCTGGACCGGGGTACGCATGACCGGCGCCCACTCA
CGCGTCTGGCAGCGGCACCGGCCGGCGGAACTGCGCGGGCACGCCACCGCACTCGTCCGG
CGCCTCGAAGCCGCCCTCGACCTGCTCGAACTCGCCGCGGACGCGGTGTCCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0 		No significant hit
SignalP
[1-24] 0.234 Signal
Eukaryota   
TMHMM No significant hit
Azino_00280 Azino_00280   Azino_00300 Azino_00300
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