Rever_00240 : CDS information
Location
Organism | Streptomyces sp. |
---|---|
Strain | SN-593 |
Entry name | Reveromycin |
Contig | AB568601 |
Start / Stop / Direction | 71,116 / 92,208 / + [in whole cluster] 71,116 / 92,208 / + [in contig] |
Location | 71116..92208 [in whole cluster] 71116..92208 [in contig] |
Type | CDS |
Length | 21,093 bp (7,030 aa) |
Annotation
Category | 1.1 PKS |
---|---|
Product | polyketide synthase |
Product (GenBank) | polyketide synthase |
Gene | |
Gene (GenBank) | revD |
EC number | |
Keyword | |
Note | |
Note (GenBank) | |
Reference |
|
PKS/NRPS Module
9 | methylmalonyl-CoA | |
10 | malonyl-CoA | |
11 | methylmalonyl-CoA | |
12 | malonyl-CoA |
Sequence
>polyketide synthase [polyketide synthase] MTQSSDKIVEALRASLLENQRLRKEHQDLADAVSEPLAIVGMACRFPGGVEDPEGLWRLV AEGGDAVGGFPTDRGWDTELLHDIPNGGGFLADASGFDAEFFGISPREALATDPQQRLLL EASWAALEHAGLDPRKAAGTPTGVFIGAAPYGYSDVMSGSSDDLQGHVLTGNAPAVVSGR VAYTLGLEGPAVTVDTACSSSLVALHLAGHSLRAGECSMALVGGVTVMATPGTFVEFSRQ GGLSSDGRCRAFADAADGTGWSEGVGVLVVERLSDAQRNGHRVLAVVRASAVNQDGASNG LTAPNGPSQQRVIRTALAAAELSSADVDVVEAHGTGTTLGDPIEAQALLSTYGQDRPEDR PLWLGSLKSNIGHTQAAAGVAGVIKMVLAMRHGVLPQTLHVDQPSTHVDWSRGQVRLLTE SVAWPENGRPRRAGVSAFGMSGTNAHVILEAPEVAADAEAEVGVVPGVQDEPAAGAGGAA PVAWVVSGRSAAAVRGQAGRLLAAVESSESPEWSGSVEPVDVGAALLSRSLFDHRAVVVG SGREELVAGLSSLAAGEPAGNVVADGVRSGAGRRVVFVFPGQGAQWVGMAAGLLESSSVF RESMELCGEALRPFVEWDLLGVLGEGDEVVLGRVDVVQPVLWAVMVSLAAVWRSWGVVPT AVVGHSQGEIAAACVAGGLSLGDGARVVALRSRAIAGALAGRGGMVAVSLPVEGVRGLLS GGLSVAVVNSPGGVVVAGPVEELDALLVVCEERGVRARRVPVDYASHSVFVELIEDRVLA DLAGLAPVSSGVPMYSSVSGERVDTAGLDGGYWYRNLRQTVEFERATRALAADGFSVFVE VSPHPVLTVAVQDTLGEGVVAAGTLRRHEGGLDRFLLSAAELFVRGVPVAWDGLFAGRRT 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>polyketide synthase [polyketide synthase] ATGACTCAGTCCTCGGATAAGATCGTTGAGGCGCTGCGCGCGTCGCTTCTGGAGAACCAG CGTCTTCGCAAGGAGCACCAGGACCTCGCGGACGCGGTGAGCGAGCCACTGGCGATCGTG GGCATGGCCTGCCGGTTCCCCGGTGGTGTCGAGGACCCCGAGGGCCTGTGGCGCCTGGTC GCCGAGGGAGGCGACGCGGTCGGCGGCTTCCCGACCGACCGTGGCTGGGACACCGAGCTG CTGCACGACATCCCCAACGGCGGGGGGTTCCTCGCCGACGCCAGCGGGTTCGACGCCGAG TTCTTCGGCATCTCGCCCCGCGAGGCCCTGGCCACCGACCCGCAGCAGCGGCTGCTGCTG GAGGCGTCCTGGGCGGCGCTGGAGCACGCGGGCCTCGACCCCCGCAAGGCGGCGGGCACT CCGACCGGCGTCTTCATCGGCGCCGCGCCCTACGGCTACAGCGACGTCATGAGCGGGTCG TCCGACGATCTCCAGGGCCATGTGCTGACGGGCAACGCTCCCGCCGTCGTCTCCGGCCGG GTGGCGTACACGCTGGGCCTGGAGGGTCCGGCGGTGACGGTGGACACGGCCTGCTCGTCG TCGCTGGTGGCACTGCACCTGGCCGGCCACTCGCTGCGGGCCGGCGAGTGCTCGATGGCA CTCGTCGGCGGTGTGACGGTGATGGCGACGCCGGGCACCTTCGTGGAGTTCAGCCGGCAG GGCGGTCTGTCGTCCGACGGGCGGTGCAGGGCGTTCGCGGACGCCGCGGACGGCACCGGC TGGTCCGAGGGCGTCGGTGTGCTGGTGGTGGAGCGGCTGTCGGACGCACAGCGCAACGGG CACCGGGTCCTCGCCGTGGTGCGCGCCAGCGCGGTGAACCAGGACGGCGCGTCCAACGGC 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GCCGGCACTGACGCCGAACCGTCCGACCTCGTGGTCCTGGAGGTCGCCCCGGAGGGCGAC CAGGTGGTGGAGGCCGTCCACGCGACGGCGAACTGGGTGCTCGGCCGGCTCCAGGCGTTC ACCGGCACGCGCATGGCCGTCGTGACCCGGGGCGCGGTCGCCGCCGGCCCGGGCGAGACC GTCACCGACCTGGCCGCGGCCTCGGTGTGGGGCCTGGTCCGCTCCGCGCAGACCGAGGAC CCGGGCCGCTTCGTGCTGCTCGACATCGCGCCGGACGCCGCGCCGGACGCCGTTCTCGAC GCCGCTCTGGTGGCCCGCGCGTTCGCGGCGGACGAGCCGCAACTCGCCCTGCGCGGCGAG GTGTTCCGCAGTCCGCGCTTCACCCGGGTGCCCGGCTCCGAGGAGGAGCCCGCCCCGGTC GCCCTCGACGGCACCGTCCTGGTCACCGGCGGCACCGGTGGCCTGGGCCGCGAGGTGGCC CGGCACCTGGTGGCCCGCCACGGTGCGCGCGACCTGCTGCTGCTCAGCCGTCGGGGAGGC GACGCCGAGGGCGCCGCCGAACTCGTCGAGGAGTTGGCCGCCCAGGGCGCCCGGGCCACC GTCGCCGCGTGCGACGTCGCCGACCGCGAGGCCCTGGCGGCGGCGCTCGCCGGCACGAAG CTGGCCGGTGTGGTGCACACCGCGGGCATCCTGGACGACGGGACCGTCGCGTCGCTGACC GCGGACCAGATGGACCGGGTCATGCGGCCGAAGGTCGACGCCGCCTGGCACCTGCACGAG CTGACCCGGGACGCCGACCTGCGCGTCTTCGCGGTGTTCTCGTCGTTCTCCGGGCAGATC GGCAGCCCGGGGCAGGGCAACTACGCCGCGTCCAACATGTTCCTGGACGCGCTGATGGAA CAGCGCCGCCAGGACGGCCTGCCCGGCGTCTCGATGGCGTGGGCCGCCTGGACGCAGGAG 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GTGGGCTTTGGTGCGGGCACGGTGCTGGTGACGGGTGGTACGGGTGGTCTGGGCCGTGAG GTGGCGCGTCACCTGGTGGCGGTGCACGGGGTGCGGGATCTGCTGCTGCTGAACCGTAGT GGTGGCGGCGCCGAACTCGTGGCGGAGCTGGCGGAGTTGGGGGCGCGGGCGCGTGTGGTC GCGTGTGACGTCGCGGATCGTGCGGCGCTGGCCGAGGTGTTGGCCGGTGTCGCCCTGACC GGGGTGGTGCACACGGCCGGTGTCGTCGAGGACGCGGTGATCACCTCCCTGGACACCGAG CGGTTGGATCGGGTGTTGGCGCCGAAGGTGGATGCGGCGTGGTATCTGCACGAGTTGACG GCGGGGATGGATCTGTCGGCGTTCGTGGTGTTCTCGTCGTTGGCCGGTGTGGTGGGTAGT CCGGGGCAGGGCAACTACGCGGCGGGCAACGTGTTCCTGGACGCGTTGATGCAGTATCGG CGGCTGGAGGGGTTGCCGGCGGTGTCGATGGCCTGGGGTCCGTGGGCCCAAGGTGCGGGT CTGACGGGTGAGTTGTCGGACGCGGACATGCGGCGGATCACGGCGTCGGGAACGCCGCCG TTCACGGTGGAGCAGGGCCTGGCGGTGTTCGACGCGGCCCTGGGCAGCCCGGAGGCGGCC GTCGCCCTGACCCGGCTCGACCTCGCGGCACTGCGGACCCGCGACGAACTGCCCCCGCTG TGGCGCACCCTGGTCGGGCAGCCGGCCCGGCGTGCCGCCGGCGGACACCGCAACGACCCC GACGACCTGGCCCGCCGGCTGGCCGCGCTGCCCGACGCCGATGCGCGGGACGCGTACCTG CTGCGGCTCGTCGCCGACCACGTGGCCCTCGTCCTCGGTCACGCGCCGGGTGACGGGGTG GACACCACGAAGGAGTTCCGTGAGCTCGGCTTCGACTCGCTGACCTCCGTCGACCTGCGG 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TGGCTGGCGGGGGTGACCGCCCGGGTCGGTTAG
Feature
BLASTP Database:UniProtKB:2011_09 |
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InterPro Database:interpro:38.0 |
IPR001031 Thioesterase (Domain)
IPR001227 Acyl transferase domain (Domain)
IPR006162 Phosphopantetheine attachment site (PTM)
IPR009081 Acyl carrier protein-like (Domain)
IPR013968 Polyketide synthase, KR (Domain)
IPR014030 Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (Domain)
IPR014031 Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (Domain)
IPR014043 Acyl transferase (Domain)
IPR016035 Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (Domain)
IPR016036 Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (Domain)
IPR016038 Thiolase-like, subgroup (Domain)
IPR016039 Thiolase-like (Domain)
IPR016040 NAD(P)-binding domain (Domain)
IPR018201 Beta-ketoacyl synthase, active site (Active_site)
IPR020801 Polyketide synthase, acyl transferase domain (Domain)
IPR020806 Polyketide synthase, phosphopantetheine-binding domain (Domain)
IPR020807 Polyketide synthase, dehydratase domain (Domain)
IPR020841 Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase domain (Domain)
IPR020842 Polyketide synthase/Fatty acid synthase, KR (Domain)
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SignalP | No significant hit |
TMHMM | No significant hit |