Oxtet_00200 : CDS information

Location

Organism	Streptomyces rimosus
Strain	ATCC 10970 (=NBRC 12907)
Entry name	Oxytetracycline
Contig	DQ143963
Start / Stop / Direction	21,064 / 22,098 / + [in whole cluster] 21,064 / 22,098 / + [in contig]
Location	21064..22098 [in whole cluster] 21064..22098 [in contig]
Type	CDS
Length	1,035 bp (344 aa)

Annotation

Category	3.2 modification methylation
Product	SAM-dependent N,N-dimethyltransferase
Product (GenBank)	OxyT
Gene	oxyT otcZ
Gene (GenBank)	oxyT
EC number	2.1.1.-
Keyword
Note
Note (GenBank)	putative N-methyltransferase
Reference	ACC Q3S8P6 PmId [16597959] Engineered biosynthesis of a novel amidated polyketide, using the malonamyl-specific initiation module from the oxytetracycline polyketide synthase. (Appl Environ Microbiol. , 2006) [18422316] Identifying the minimal enzymes required for anhydrotetracycline biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2008) comment [PMID:16597959](2006) oxytetracycline gene clusterのシークエンス、配列解析。 resistance genes otrAとotrBの間に全21genesを同定。わかりやすくするため、gene namesがotc → oxyに変更され、振り直されている。 oxyT (otcZ): N-Methyltransferase OxyTはS-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferasesをコードする。 O-methyltransferasesに高い配列類似性あり。 OxyQ, OxyR, and OxyS (OtcC)と同時転写される。 4-amino-ATCにある遊離アミンをdimethylationしてATCをもたらすと推定的に割り当てられている。 --- [PMID:18422316](2008) 完全に機能的なring Aを含む最初の中間体anhydrotetracycline (ATC)の生合成に必要な最小酵素セットの同定と再構築。 in vivo and in vitro approachesを組み合わせて、6-methylpretetramid → ATC への変換に必要なのはOxyL, OxyQ, OxyTであることを確認した。 OxyLはNADPH-dependent dioxygenaseであり、6-methylpretetramid に2つの酸素原子を導入し、不安定な中間体4-keto-ATC をもたらす。 aminotransferase OxyQは4-keto-ATC の還元的アミノ化を触媒し、4-amino-ATC をもたらす。さらに、N,N-dimethyltransferase OxyTはSAM-dependent様式で、4-amino-ATC → ATC の形成を触媒する。 E.coli発現、精製して得たOxyTを用いて、4-amino ATCを基質としてSAMと共に反応させたところ、短時間(10min)ではmonomethylated compoundを、長時間(10h)ではATCが検出された。よって、OxyTは基質として芳香族polyketide aglyconeを使う初めてのN,N-dimethyltransferaseである。 SAMがないとどちらの化合物も形成されなかったので、SAMが必須のmethyl donorである。

Sequence

>SAM-dependent N,N-dimethyltransferase [OxyT]
MTTTPLAPVAQARSLLQLTTAYHQAKALHSAVELGLFDLLADGPATAEEVKDRLRIVHPL
AKEFLDALVALELLEADGDRYRNSPAAQAFLVSGASEYLGGTVLQHARKHYHVWAGLTTA
LQEGEAGSGAEAHGPEAYPKHYEDPERARQVMAHFDTFSSFTAEELARRVDWSGYGSFID
IGGARGNLATRVALAHPHLHGAVFDLPALAPLAGELIRERGLEGRVRFHGGDFLTDPLPS
ADAVVTGHVLPDWPVPQRRKLLARIHEALPSGGALVVYDLMTDPATTTVHDVLQRLNHGL
IRGDSSSSSVEEYRAEIEEAGFRVRQAERIDNLLGDWLIVAVKP

>SAM-dependent N,N-dimethyltransferase [OxyT]
ATGACCACCACACCGCTCGCCCCCGTGGCCCAGGCCCGCTCGCTGCTGCAGCTGACCACC
GCGTACCACCAGGCGAAGGCCCTGCACAGCGCCGTGGAGCTGGGCCTGTTCGACCTGCTC
GCCGACGGGCCCGCGACCGCCGAGGAGGTGAAGGACCGGCTGCGGATCGTCCATCCGCTG
GCCAAGGAGTTCCTCGACGCGCTCGTCGCGCTGGAGTTGCTGGAAGCGGACGGCGACCGC
TACCGCAACTCCCCCGCCGCCCAGGCGTTCCTGGTGTCCGGCGCCTCCGAATACCTGGGC
GGCACCGTCCTCCAGCACGCCCGCAAGCACTACCACGTATGGGCCGGGCTGACGACGGCG
CTCCAGGAGGGCGAGGCGGGTTCCGGCGCCGAAGCGCACGGGCCCGAGGCGTACCCCAAG
CACTACGAGGACCCGGAGCGGGCCCGTCAGGTCATGGCGCACTTCGACACCTTCAGCTCC
TTCACGGCCGAGGAGCTGGCGCGCCGCGTCGACTGGAGCGGGTACGGGTCCTTCATCGAC
ATCGGCGGCGCACGGGGCAACCTCGCCACGCGGGTGGCCCTGGCCCACCCGCACCTGCAC
GGCGCCGTGTTCGACCTGCCCGCGCTGGCCCCGCTGGCCGGCGAGCTGATCCGTGAGCGC
GGCCTCGAAGGCCGCGTCCGCTTCCACGGCGGCGACTTCCTGACCGACCCGCTGCCGTCC
GCGGACGCCGTGGTCACCGGGCACGTACTGCCCGACTGGCCGGTACCGCAGCGGCGCAAG
CTCCTCGCGCGCATCCACGAGGCGCTGCCCTCCGGCGGCGCGCTGGTGGTCTACGACCTG
ATGACGGATCCGGCCACCACGACGGTGCACGACGTACTGCAACGGCTCAACCACGGCCTC
ATCCGCGGCGACAGCTCGTCCAGCAGCGTCGAGGAGTACCGCGCGGAGATCGAGGAGGCC
GGCTTCCGGGTGCGGCAGGCGGAGCGCATCGACAACCTCCTCGGTGACTGGCTGATAGTC
GCCGTCAAGCCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	IPR001077 O-methyltransferase, family 2 (Domain) PF00891 Methyltransf_2 IPR011991 Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (Domain) G3DSA:1.10.10.10 Wing_hlx_DNA_bd IPR016461 O-methyltransferase, caffeic acid-type (Family) PIRSF005739 O-mtase
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

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