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Madu_00190 : CDS information

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Organism
StrainATCC 39144
Entry nameMaduropeptin
Contig
Start / Stop / Direction33,501 / 32,644 / - [in whole cluster]
33,501 / 32,644 / - [in contig]
Locationcomplement(32644..33501) [in whole cluster]
complement(32644..33501) [in contig]
TypeCDS
Length858 bp (285 aa)
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Category3.4 other modification
Productputative acyltransferase
Product (GenBank)acetyltransferase/esterase
Gene
Gene (GenBank)mdpB3
EC number
Keyword
  • 3,6-dimethylsalicylic acid
Note
Note (GenBank)
Reference
ACC
PmId
[17918933] Characterization of the maduropeptin biosynthetic gene cluster from Actinomadura madurae ATCC 39144 supporting a unifying paradigm for enediyne biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2007)
comment
Maduropeptin生合成遺伝子クラスターの報告

mdpB3: Putative Hydrolase

MdpB,MdpB1,MdpB2 が3,6-dimethylsalicylyl-CoA biosynthesisに関与するとしている。MdpB3がenedyine coreへの3,6-dimethylsalicylic acid moietyの付着に関与するとしている。

カップリングのタイミングは不明のまま。
機能解析はされていない。
Related Reference
ACC
Q8GHB5
PmId
comment
Streptomyces roseochromogenes subsp. oscitans_cloN7
Putative hydrolase
Clorobiocin生合成遺伝子

cloN1、cloN7の機能解析
putative acyl carrier proteinとされるcloN1、putative acyl transferaseとされるcloN7欠損株は、pyrrole-2-carboxyl moietyを欠いたclorobiocin derivativeを蓄積し、free pyrrole-2-carboxylic acidも生産した。代謝産物をNMR,MSにて解析し、CloN1とCloN7は以前解析したCloN2と共にclorobiocinのdeoxysugarへのpyrrole-2-carboxyl moietyのtrasferに関与するとしている。
ACC
Q9F8U0
PmId
comment
Streptomyces rishiriensis_couN7
Putative hydrolase
coumermycin A(1) 生合成遺伝子

CouN7を大腸菌にて発現・精製。
CluN7はdescarbamoylnovobiocinのnoviose sugarへCouN1からpyrrole acyl moietiesを動かすacyltransferaseであることを確認している。

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selected fasta
>putative acyltransferase [acetyltransferase/esterase]
MTRAPGREPAAGLLAVPGADLYYEIRGAGPALLLIPTGNGDAGPYAPLADALADRHTVIT
YDRRGYSRSPMHAPVDGARRVAVDARDASLLIERLAAGPAAALGGSSGAVVALALLERHP
DTVRTLVAHEPPLASVLPDAAEWRRFYADLYDTYRRIGARPARAEFRARMGMTGDTRPPE
EAQPPPAELERMLGRIRGNLDRWFEEELRPYPSYPLDTAALGRVAGRLVLAGGRDSRDHH
PYEPNTVLAKRFGLDIADFPGGHVGYVTHPFEFAERLAEVLAGAR
selected fasta
>putative acyltransferase [acetyltransferase/esterase]
GTGACCCGGGCCCCCGGGCGCGAACCGGCCGCGGGGCTGCTGGCGGTGCCCGGCGCCGAT
CTCTACTACGAGATCCGCGGCGCCGGGCCCGCCCTGCTGCTGATCCCCACGGGCAACGGT
GACGCCGGACCCTACGCGCCGCTGGCGGACGCGCTGGCCGACCGCCACACCGTCATCACC
TACGACCGGCGCGGCTACTCCCGCAGCCCGATGCACGCCCCGGTCGACGGCGCGCGGCGC
GTCGCGGTCGACGCGCGCGACGCGAGCCTGCTGATCGAGCGGCTGGCCGCCGGGCCCGCC
GCCGCGCTGGGCGGCAGTTCCGGCGCCGTGGTCGCCCTCGCGCTGCTGGAACGCCACCCG
GACACCGTGCGGACGCTCGTCGCGCACGAGCCGCCGCTGGCCTCGGTGCTGCCGGACGCG
GCCGAATGGCGCCGGTTCTACGCCGACCTGTACGACACGTACCGGCGGATCGGCGCGCGT
CCGGCCCGCGCGGAGTTCCGCGCGCGGATGGGGATGACCGGGGACACCCGGCCGCCGGAG
GAGGCGCAGCCGCCGCCCGCGGAGCTGGAGCGGATGCTCGGCCGGATCCGGGGCAACCTG
GACCGCTGGTTCGAGGAGGAACTCCGCCCCTACCCGTCCTACCCCCTCGACACGGCGGCG
CTGGGACGGGTCGCGGGCCGGCTCGTCCTGGCGGGCGGCCGCGACTCGCGCGACCACCAC
CCCTACGAGCCCAACACCGTGCTGGCGAAGCGGTTCGGCCTCGACATCGCGGACTTCCCC
GGCGGCCACGTCGGCTACGTGACCCACCCCTTCGAGTTCGCCGAACGGCTCGCGGAGGTG
CTCGCCGGGGCCCGCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0 		No significant hit
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Madu_00180 Madu_00180   Madu_00200 Madu_00200
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