Madu_00280 : CDS information

Location

Organism	Actinomadura madurae
Strain	ATCC 39144
Entry name	Maduropeptin
Contig	AY271660
Start / Stop / Direction	45,205 / 43,877 / - [in whole cluster] 45,205 / 43,877 / - [in contig]
Location	complement(43877..45205) [in whole cluster] complement(43877..45205) [in contig]
Type	CDS
Length	1,329 bp (442 aa)

Annotation

Category	3.3 modification reduction
Product	putative monooxygenase
Product (GenBank)	hydroxylase
Gene
Gene (GenBank)	mdpH
EC number
Keyword
Note
Note (GenBank)
Reference	ACC B0BLN7 PmId [17918933] Characterization of the maduropeptin biosynthetic gene cluster from Actinomadura madurae ATCC 39144 supporting a unifying paradigm for enediyne biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2007) comment Maduropeptin生合成遺伝子クラスターの報告 mdpH: Hydroxylase C-1027, Neocarzinostatin生合成遺伝子との相同性より、MdpHはhydroxylaseであるとしている。 Maduropeptin enediyne coreの形成に関与すると推定している。
Related Reference	ACC B5M9L6 NITE Lasal_00200 PmId [22506807] Sequential enzymatic epoxidation involved in polyether lasalocid biosynthesis. (J Am Chem Soc. , 2012) [23796908] Biosynthetic machinery of ionophore polyether lasalocid: enzymatic construction of polyether skeleton. (Curr Opin Chem Biol. , 2013) comment Blast id30% Streptomyces lasaliensis ATCC 35851_lsd18 Putative epoxidase GenBank,UniprotではATCC31180と登録されているが、clusterの報告論文[PMID:19129623]ではATCC35851であるとされている。 --- [PMID:22506807](2012) Lsd18がprelasalocidのbisepoxylasalocidへのsequential epoxydationに関与するようだ。酵素学的エポキシ化反応の解析。 --- [PMID:23796908](2013) Lsd18,Lsd19について続報有り。abstract only.
	ACC B5M9L6 NITE Lasal2_00240 PmId [19025863] Analysis of specific mutants in the lasalocid gene cluster: evidence for enzymatic catalysis of a disfavoured polyether ring closure. (Chembiochem. , 2008) comment Blast id30% Streptomyces lasaliensis NRRL3382R(ATCC 31180)_lasC Putative epoxidase S. lasaliensis ATCC31180におけるLasalocid生合成gene clusterの報告。 lasC deletion mutant作製し機能推定している。 flavin-linked epoxidaseをコードしていると予測されているlasCを欠損すると、lasalocidとiso-lasalocid両方の生産ができなかったことから、full-length polyketide productの放出より前にポリエーテル環の酸化的環化がPKSで行われていると思われる。また、相補実験の結果から、PKS結合dieneがLasC, LasBの基質であると推測された。
	ACC Q846W9 NITE Monen_00220 PmId [12940979] Analysis of the biosynthetic gene cluster for the polyether antibiotic monensin in Streptomyces cinnamonensis and evidence for the role of monB and monC genes in oxidative cyclization. (Mol Microbiol. , 2003) comment Blast id29%, gapあり Streptomyces cinnamonensis_monC1 Monensin epoxidase Streptomyces cinnamonensisのmonensin biosynthetic gene clusterにおけるmonB と monCの機能について調べた文献。 monCI について、S. coelicolorにおけるHeterologous expressionを行ったところ、linaloolをlinalool oxideにepoxidizeする能力が10-20倍に増加することを確認している。

Sequence

>putative monooxygenase [hydroxylase]
MYAQIGDRVIVLGGSLTGLFAAGALAESYREVVLVDRDELVGVREARRGAPQARHINGLL
AAGSRAMEDLFPEITAQMVTAGCPLTDLAGTVRWYFNGRALAQARAGLTNVAARRPIMEA
HVRERVQGFGNVVFMEGYDILGLVTSTDGTTVTGARVQSRAEGAAEEELTADLVIDATGR
GSRTPVWLEQLGYGRVEEEGTKIGLGYGTRHYRPRREVFGKDHSVVCVASADSPRGAICT
KTDDGLLELTTYGILGDHPPLDPEGFTAFVKTLAAPEIHEAIIDAEPLDDPVLFRFPTTM
RRRYERMSRFPANFLVMGDAICTPNPVFAQAQTLAALQAVALRKRVRSGVPPESGEFMRV
AGRIVDPAWELTEGINLTFPGVEGRRTGKLKFMHSYMRMLQTAATRDASITEAFMRAAGL
VDSPQSLMRPGLAWRVLRGAGA

>putative monooxygenase [hydroxylase]
GTGTACGCCCAAATTGGAGATCGCGTCATCGTGCTCGGCGGGAGCCTGACCGGGCTGTTC
GCCGCGGGGGCGCTCGCCGAGAGCTATCGCGAAGTCGTGCTGGTGGACCGGGACGAACTG
GTCGGCGTGCGGGAGGCGCGTCGCGGCGCGCCCCAGGCCCGCCACATCAACGGGCTCCTC
GCCGCCGGCTCGCGGGCGATGGAGGACCTGTTCCCCGAGATCACCGCGCAGATGGTCACG
GCCGGCTGCCCGCTCACCGACCTGGCGGGCACGGTCCGCTGGTACTTCAACGGACGCGCG
CTGGCGCAGGCGCGGGCCGGGCTGACCAACGTGGCCGCCCGGCGGCCGATCATGGAGGCG
CACGTCCGGGAGCGGGTCCAGGGCTTCGGGAACGTCGTCTTCATGGAGGGCTACGACATC
CTCGGCCTGGTCACGTCCACGGACGGGACCACGGTGACGGGCGCGCGGGTGCAGTCCCGG
GCCGAGGGGGCGGCCGAGGAGGAGCTGACCGCCGACCTGGTCATCGACGCCACCGGCCGC
GGCTCCCGCACGCCGGTGTGGCTGGAGCAGCTCGGGTACGGCCGGGTCGAGGAGGAGGGC
ACCAAGATCGGCCTCGGGTACGGGACGCGGCACTACCGGCCGCGCCGCGAGGTGTTCGGC
AAGGACCACTCGGTCGTCTGCGTGGCGTCGGCGGACTCCCCGCGGGGCGCGATCTGCACC
AAGACCGACGACGGCCTGCTGGAGCTGACGACGTACGGCATCCTCGGCGACCACCCGCCG
CTCGACCCGGAGGGCTTCACCGCCTTCGTCAAGACGCTGGCGGCTCCGGAGATCCACGAG
GCGATCATCGACGCCGAGCCGCTGGACGACCCGGTGCTGTTCCGCTTCCCCACCACGATG
CGCCGGCGGTACGAGCGCATGTCCCGGTTCCCGGCGAACTTCCTGGTGATGGGGGACGCC
ATCTGCACGCCCAACCCCGTGTTCGCCCAGGCGCAGACGCTGGCGGCGCTCCAGGCCGTG
GCCCTGCGCAAGCGGGTCCGCAGCGGGGTGCCGCCGGAGTCGGGCGAGTTCATGCGGGTG
GCGGGCCGCATCGTCGATCCGGCCTGGGAGCTGACCGAGGGCATCAACCTCACCTTCCCG
GGGGTCGAGGGCCGCCGCACCGGCAAGCTCAAGTTCATGCACTCCTACATGCGGATGCTG
CAGACCGCGGCGACCCGCGACGCCTCCATCACCGAGGCGTTCATGCGGGCGGCGGGCCTG
GTCGACTCGCCCCAGTCGCTGATGCGGCCGGGGCTGGCATGGAGGGTGCTGCGGGGCGCC
GGCGCCTGA

Feature

BLASTP Database:UniProtKB:2011_09	show BLAST table
InterPro Database:interpro:38.0	No significant hit
SignalP	No significant hit
TMHMM	No significant hit

Madu_00270 Madu_00290