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Salino3_00220 : CDS information

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Organism
StrainXM211
Entry nameSalinomycin
Contig
Start / Stop / Direction92,379 / 92,765 / + [in whole cluster]
92,379 / 92,765 / + [in contig]
Location92379..92765 [in whole cluster]
92379..92765 [in contig]
TypeCDS
Length387 bp (128 aa)
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Category3.4 other modification
Productputative cyclase
Product (GenBank)putative epoxide hydrolase
Gene
Gene (GenBank)slnBI
EC number
Keyword
  • tetrahydropyran ring
Note
Note (GenBank)
  • SlnBI
Reference
ACC
PmId
[22156425] Cloning and characterization of the polyether salinomycin biosynthesis gene cluster of Streptomyces albus XM211. (Appl Environ Microbiol. , 2012)
comment
polyetherに特異的なepoxidaseの配列に基づいた縮重プライマーを用いてStreptomyces albus XM211からsalinomycin(sln)生合成gene clusterを同定。

SlnBI (128aa) : Epoxide hydrolase

polyether gene clustersにあるepoxide hydrolasesとのalignment結果から、段階的なepoxide openingと引き続く環化で重大な役割をするとlsd19で証明されている酸性残基ペア(D38-E65)のうち、glutamic acidがisoleucineに置換されていることが明らかになった。

遺伝子置換によるslnBI mutantは、salinomycin収量がwildの5%以下にまで減った。
他に候補がないこともふまえ、thioesterase活性を持つ可能性のある酵素としてSlnBI を挙げている。
Related Reference
ACC
H1ZZU2
NITE
Salino_01000
PmId
[22076845] A late-stage intermediate in salinomycin biosynthesis is revealed by specific mutation in the biosynthetic gene cluster. (Chembiochem. , 2012)
[26377145] Enzymology of Pyran Ring A Formation in Salinomycin Biosynthesis. (Angew Chem Int Ed Engl. , 2015)
comment
配列は[H6D578]と全く同じ。株違い。

---
[PMID: 22076845](2012)
monC gene-based hybridisation probeを使って、Streptomyces albus DSM 41398からsalinomycin(sal)生合成gene clusterを同定。

salBIII (128aa) : epoxide hydrolase/cyclase

配列解析のみ。
MonB-like epoxide hydrolasesは、他のpolyether gene clusterで1〜2つコードされるのに対し、sal clusterでは3つある。このうちsalBI と salBII を一緒に削除してもsalinomycin産生量に変化なし。
SalBIII がこれらの欠損を代償しているのかは確認されていない。

---
[PMID: 26377145](2015)
SalBIII がカルボキシ基寄りのtetrahydropyran環形成を担うことを実験確認している。必須触媒二分子としてAsp38 と Asp104を同定。提唱メカニズムの図では、ACP14に繋がれたまま分子内環化が触媒されている。

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selected fasta
>putative cyclase [putative epoxide hydrolase]
MQDEQKRKEIVAEYFRKVNEGDVDAIVEMFTENATIEDPVGKDVREGRAAQREYFNSNVT
AEVTIEPGHLSAGQDGKSVAVALAAEMTNILDPNRTRVKINAVDVFTLTPEGKIDSMRVF
WGMTDIGV
selected fasta
>putative cyclase [putative epoxide hydrolase]
ATGCAGGACGAGCAGAAGCGCAAGGAGATCGTCGCGGAATACTTCCGCAAGGTGAACGAG
GGCGATGTCGACGCCATCGTCGAGATGTTCACCGAGAACGCCACCATCGAGGACCCGGTC
GGCAAGGATGTCCGCGAGGGCCGCGCAGCGCAGCGCGAGTACTTCAACAGCAATGTCACC
GCCGAGGTCACCATCGAGCCGGGACACCTGTCGGCGGGTCAGGACGGCAAGTCCGTCGCC
GTCGCCCTGGCCGCGGAGATGACCAACATCCTCGACCCCAACCGCACCCGTGTGAAGATC
AACGCCGTCGACGTCTTCACCCTCACCCCCGAGGGCAAGATCGACAGCATGCGCGTGTTC
TGGGGCATGACCGACATCGGCGTCTGA

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BLASTP
Database:UniProtKB:2011_09 		show BLAST table
InterPro
Database:interpro:38.0
IPR009959 Polyketide cyclase SnoaL-like domain (Domain)
[11-114] 3.1e-13 PF12680
PF12680   SnoaL_2
SignalP No significant hit
TMHMM No significant hit
Salino3_00210 Salino3_00210   Salino3_00230 Salino3_00230
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